3.預算管理粗放
我國預算管理是在計劃經濟體製下形成的，隨著社會主義市場經濟體製的確立，其弊端日益凸顯出來。一是預算編製方法不科學。傳統的預算是收入按類別、支出按功能采用基數加增長的增量預算方法編製的。“基數加增長”固化了財政資金在部門間的分配格局，製約了對經濟結構和社會事業發展布局的調整。二是預算分類不規範。科目設置不準確，不能全麵反映政府事權和收支全貌。大量體現政府職能的收支在預算科目分類中並沒有反映，而是在預算之外循環，政府預算不完整。三是由於預算編製較粗，層層留機動，在預算執行過程中，追加追減頻繁，透明度不高，人為因素較多，誘使一些基層單位經常到上麵跑資金，弱化了一些領導在預算管理方麵的法製觀念，不利於廉政建設。四是預算編製時間短，編製粗，項目論證不充分，多數資金落實不到項目，在一定程度上影響了人大審查監督作用的發揮。五是政府分散采購和國庫分散支付製度存在較多弊端。支出過程脫離財政監督，財政部門隻能依賴各支出部門的財務報告進行事後審查監督，不能及時發現和製止支出過程中的違紀違法行為。同時，資金分散支付和儲存，過程性沉澱資金較多，使用效率不高，財政資金運行的信息反饋滯後，不利於及時調整和完善政策。
（二）1994年以來我國財稅運行機製的改革曆程
針對財政包幹體製和稅製存在的諸多弊端，中央政府從1994年起在全國實行稅製改革，實施了分稅製財政體製，初步建立起與市場經濟要求相適應的財政體製框架。在完善財政收入機製的同時，著眼於製度創新，不斷加大財政支出體製改革力度，在從源頭上預防和治理腐敗方麵進行了有益的探索。
1.初步建立起與市場經濟要求基本相適應的財政收入機製
一是實施財稅體製改革。1994年，在全國範圍內實行工商稅製改革的同時，實施分稅製財政管理體製。改革的主要內容是建立以增值稅、消費稅和營業稅為主體稅種的新型流轉稅製，在劃分中央政府和地方政府的事權和支出責任的基礎上，按稅種確定了中央和地方收入及中央對地方的稅收返還數額。隨後，各地相繼實施了省以下分稅製財政體製。二是為了調節各地財力差異，完善分稅製財政體製，1995年起中央從集中的收入增量中拿出一部分資金，以省（市、區）為單位，選取對省（市、區）財政收支影響較大的客觀因素，按照相對規範的辦法，建立了過渡期轉移支付製度，對貧困地區實施轉移支付補助。《過渡期轉移支付辦法》是我國財政轉移支付製度改革的一個重大突破。以“因素法”代替傳統的“基數法”確定撥款的數額為財政體製的規範化管理、克服人為因素樹立了比較成功的範例。三是進一步完善財政收入機製。近幾年來，各地區、各部門按照國務院和中紀委的部署和要求，在清理整頓各類收費的基礎上，積極推進稅費改革，規範財政收入渠道；全麵實行收費“票款分離”辦法，對預算外資金收支實行財政專戶集中支付製度；不斷推進和加強政府收費和罰沒收入“收支兩條線”的管理工作，實行綜合預算，將預算外資金逐步納入預算管理。同時調整了部分稅種、稅率，清理了過渡期稅收優惠政策，整頓了先征後返、變相減免等不規範的做法；加強稅收征管，嚴格依法治稅，努力建立科學有效的收入征管體係。另外，對全國行政事業單位的銀行賬戶進行了清理，在從源頭治理腐敗、增強政府宏觀調控能力方麵取得了新的進展。