1643年7月，戈洛文派瓦西裏·波雅爾科夫率132人入侵中國黑龍江流域，命令他“為大君主征收實物稅，尋找新的未繳納貢稅的人及銀、銅、鉛礦和糧食”，波雅爾科夫的隊伍中就有兩名收稅官。這一夥強盜從雅庫茨克出發，經勒拿河至阿爾丹河口，溯阿爾丹河而上至烏楚爾河口，經烏楚爾河進入戈納姆河，最後航行到紐約姆卡河口，渡過了一個個激流險灘。之後他們翻越外興安嶺，闖入中國境內，建立寨堡，捕捉當地居民達斡爾人為人質，向他們勒索毛皮和糧食。達斡爾人熱情好客，起初以禮相待，給他們讓出住房，提供糧食、牲畜，但沙俄殖民者並不以此為滿足，他們還要占領整個村寨，迫使達斡爾人歸順俄國“大君主”。這使達斡爾人怒不可遏，他們奮起反抗，打得沙俄強盜焦頭爛額，狼狽逃竄。
其時正值嚴冬，沙俄入侵者的糧食所剩無幾，附近的達斡爾人為防止這夥強盜的襲擊，堅壁清野，遠走他鄉。沒有糧食，俄國人便吃人肉，“吃被打死的達斡爾人和餓死的軍役人員，一冬天吃了五十多個”。這樣好不容易挨過了冬天。俄國史料中的這些記載充分暴露了沙俄殖民者的野蠻殘忍。
次年春天，波雅爾科夫一夥與另一夥殖民強盜會合，順精奇裏江（結雅河）下航。沿途他們目睹了這一帶的美麗富饒，隻見村舍櫛比，阡陌縱橫，牛羊遍野，樹木蔥蘢，這更引起了他們的無限妒意。沿途他們企圖上岸搶劫，但當地人不讓他們上岸，稱他們為“吃人惡魔”。沙俄殖民者如過街老鼠，人人喊打。不得已，他們決定返回，但不敢走原路，隻得冒險走海路，於1646年6月返回雅庫茨克，曆時三載。沙俄殖民者的第一次入侵以失敗告終。
之後，雅庫茨克督軍又多次派殖民強盜入侵中國。沙俄殖民者在黑龍江流域往來穿梭，攻城略地，搶劫殺戮。沙俄殖民者的野蠻入侵遭到中國軍民的頑強抵抗。1658年，清軍將領沙爾瑚達率部一千四百餘人在鬆花江口大敗俄軍，入侵俄軍五百餘人中有270人被殲，其頭目斯捷潘諾夫也被擊斃。其後清軍又拆毀了俄軍在雅克薩築建的城寨，攻占了俄軍盤踞的呼瑪爾斯克，殲滅了俄軍殘部。到1660年，黑龍江流域的俄軍已悉數被殲。
清軍在肅清入侵俄軍後並未留兵駐守，而是班師回朝。不久，沙俄殖民者又卷土重來，重占雅克薩，在此建阿爾巴津城堡，並以此為依托，到處建村設點，移民墾殖。同時沙皇政府公然在中國領土建立督軍府，設立阿爾巴津縣，任命殺人越貨的殖民強盜切爾尼果夫斯基為阿爾巴津總管。
對此，清政府當然不能坐視不理，康熙皇帝明確指出：“羅刹（即沙俄）犯我黑龍江一帶，侵擾虞人，戕害居民。昔發兵進討，未獲剪除，曆年已久。近聞蔓延益甚，過牛滿、恒滾諸處，至赫哲、飛牙喀虞人住所，殺掠不已。”1685年2月，康熙下令進攻雅克薩，由都統公彭春、副都統郎談、班達爾沙、黑龍江將軍薩布索等統兵三千，水陸出擊。6月，清軍抵雅克薩，當即向俄軍發出用滿、蒙、俄三種文字書寫的通牒書，嚴正指出：“爾等欲相安無事，可速回雅庫，於彼為界，捕貂收賦，毋複入內地構亂，歸我逋逃，我亦歸爾逃來之羅刹。果爾，則界上得以貿易，彼此晏居，兵戈不興。倘執迷不悟，仍然拒命，大兵必攻破雅克薩城，殲除爾眾矣。”言之鑿鑿，至情至理。然俄軍驕狂，不以為意，準備負隅頑抗。清軍遂於25日發動進攻，僅一日，俄守軍便支持不住，在付出百餘人的性命後獻城投降。清軍將雅克薩城池焚毀，退回璦琿。此為第一次雅克薩戰役。
但沙俄入侵者並不甘心失敗，他們探得中國軍隊已經撤離，便於9月重返雅克薩，再次建城據守。消息傳來，清廷震怒。1686年7月，康熙再派2000名清兵至雅克薩清剿俄軍。他們將雅克薩團團圍住，在城外“掘長塹、立土壘”，斷絕城中水源，不時用火炮轟擊。俄軍多次組織突圍，均被擊退。這樣圍城數月，城中斷水斷糧，俄軍傷亡慘重，到1687年5月，俄軍由原來的736人減少到66人了。俄軍頭目、沙皇政府委任的阿爾巴津首任督軍阿列克謝·托爾布津也中彈身亡。雅克薩的收複指日可待。