這個懲治苗克豐的計策是王應駿想出來的，是他和兩個軍士設計調開監軍所的守門人，將柳木樁放進去的。按照計策，王應豸將苗克豐阻撓建生祠的事寫成條陳，親自送到大理寺。他們隻想借此事拖延建生祠，未想到大理寺正卿是魏忠賢一黨，他送走王應豸，立刻將王應豸的條陳秘密送到魏忠賢手中。
魏忠賢聽了苗克豐守門人的哭訴，已對王應豸有了疑心。看了大理寺送來的條陳，立刻悟出王應豸在使著手段拖延建祠。他知道，如今新皇上剛登基，一些想彈劾他的大臣正侍機欲動。倘若王應豸乘機動本，自己為自己建生祠的事就會被揭穿。他越想越擔心，派人找來李元治，讓他另調心腹官員去薊門衛替代王應豸、去五軍都督府安排撤換王肇生，再將二人秘密處死，李元治答應一聲，快步去了。
看著李元治出了宮，魏忠賢猛地想起一件大事：苗克豐盡知自己建生祠的秘密，若在軍營中被刑訊，難免會說出什麼來，他急忙召來李永貞，要他多帶些有武藝的太監，持夜晚出入城令，立即去薊門衛把苗克豐討回宮。又說若是王應豸不放人，可先將他拿住，再把苗克豐搶回來。
薊門衛囚禁了苗克豐，將士們個個高興，這天傍晚，王肇生擺了酒宴，請來王應豸弟兄倆，三個人剛舉起酒杯，忽然小軍來報：說南營門外有一老者請王應豸速去見麵。
王應豸匆匆來到南營門，一見來人，驚得他張著大嘴半天說不出話。原來此人是東閣大學士李元治，他化了裝獨自騎馬來了。
李元治一見王應豸出了營，冷著臉把他拉到一處背風的石崖下，他看了看四處無人，指著王應豸的腦門說：“你啊你啊，你用計囚禁了苗克豐，可能夠取得他的口供？你不知官員底細，去的什麼大理寺？寫的什麼條陳？你這是惹火燒身啊。”見王應豸直著雙眼發愣，他近前一步說：“倘若明日大理寺將人提走，苗克豐再反咬一口，說你們惡意汙陷顧命元臣，你和營中的幾個將領還有命嗎？更何況你的計謀如今就被人識破了。”他說了魏忠賢剛才的秘密安排，驚得王應豸頭上冒出冷汗。
麵對這位魏忠賢提拔的朝廷重臣，王應豸不知該說什麼話，李元治好似看透他的心思，他歎了口氣說：“本閣是魏公公一手提拔的，但我李元治做官從未忘記一個‘德’字，更不做禍國秧民的事。我若支持他建生祠，就不會要你來做這個官了。”他輕輕地搖搖頭，又說：“那天魏公公安排我為你接風，在李永貞麵前，我暗暗給你斟了杯冷水，你很聰明地悟出我的意思。今天這事關係到你和營中多人性命，是坐以待斃，還是爭個魚死網破，你們快商議去吧。”他見天色已晚，怕關城門，上馬急急地走了。