1948年5月14日夜，本·古裏安在特拉維夫博物館向全世界發布《以色列國獨立宣言》，莊嚴宣告：以色列國成立！並成為臨時政府首腦。
當日午夜，英國人離開巴勒斯坦。
第二天早晨，黎巴嫩、敘利亞、伊拉克、外約旦和埃及5個國家共4萬多人，分別從南、北、東三麵向以色列發起猛烈攻擊。總共隻有3萬餘人的“哈加納”同時與5個國家的正規部隊開戰，形勢非常危急。本·古裏安沒有瑟縮，也沒有顫抖，毅然地領導起獨立戰爭。經過勇敢的戰鬥，以色列軍隊初步改變了戰爭爆發時的絕對劣勢局麵，在各個方向遏製住了阿拉伯人的推進。6月11日，經聯合國斡旋，阿以雙方同意停火。
本·古裏安最大限度地利用這為期4周的停火時機，為以後的戰爭作準備。通過進行半公開移民，擴充兵員；積極向捷克斯洛伐克、美國和英國采購武器，發展陸、海、空三軍力量。
與此同時，本·古裏安著手整編軍隊，肅清過去的非正規軍色彩，實現國防軍的統一。停火令生效期間，“伊爾貢”偷運回一船軍火，欲據為已有。這種公然的背叛行為，激怒了本·古裏安，他開始擔心“伊爾貢”會武裝反叛以圖奪權或在耶路撒冷和猶地亞建立分裂的猶太國家。在內閣會議上本·古裏安強調：“我們不會有兩個國家，也不會有兩支軍隊。”6月21日傍晚，運送軍火的“阿爾塔萊納”號船在特拉維夫海岸被炸毀。6月28日，本·古裏安命令全國陸軍舉行對國家的效忠宣誓。接著，本·古裏安將國防軍編成4個軍區，明確各軍區所分擔的作戰區域。同年9月17日，聯合國安理會任命的阿以衝突調解人、瑞典紅十字會會長福克·貝納多特伯爵在耶路撒冷被殺。他的死據認為與“斯特恩幫”有關。由於發生“阿爾塔萊納”和調解人被殺這兩起事件，本·古裏安撤銷了“伊爾貢”和“斯特恩幫”這兩個軍事組織，從而保證了以色列武裝部隊的統一，並把它完全置於政府的領導之下。
本·古裏安對戰爭的準備和對軍隊的整編，使得以色列軍事力量迅速增長。繼7月9日發動反攻之後，10月15日再次向埃及和敘利亞軍隊發起功勢。到1949年初，迫使埃及政府宣布停戰。1949年7月20日，以色列與敘利亞之間簽訂了最後的停戰協定，以色列獨立戰爭結束。
戰爭結束後，以色列進行首屆議會選舉。選舉中，沒有一個黨派獲得絕對多數，巴勒斯坦工人黨獲得相對多數，在120席中占46席。魏茲曼總統授權巴勒斯坦工人黨領袖本·古裏安組閣。在以色列首屆正式的政府中，本·古裏安任總理兼國防部長。本·古裏安在各個領域中采取了一係列重要措施，這些措施決定了以色列未來的麵貌。這些措施的實施在很大程度上有賴於本·古裏安的倡議、堅持和個人權威。