公元前47年，愷撒在埃及停留前後達九個月之久。或許是因為打了十年的仗，他想歇歇了。
就在這時，忽然小亞細亞傳來軍書，愷撒派駐在小亞細亞的將領卡維納斯報告說，米特裏達梯的兒子法爾納塞斯與兵作亂，已奪回本都、小亞美尼亞、卡帕多西亞等地。卡維納斯的兵力不足，屢遭敗北，情勢非常危急。
愷撒接獲戰報後，於當年六月親自率領大軍離開埃及，趕往小亞細亞去平亂。當年八月，愷撒大帝和法爾納塞斯的軍隊發生激戰，愷撒軍以銳不可當的氣勢，一舉將法爾納塞斯擊潰，平定了米特裏達梯王的叛亂。
愷撒在小亞細亞獲勝後，致信給羅馬的友人，信上有這麼一句名言——我至，我見，我勝。
接著，愷撒立刻返回羅馬。他發現留守羅馬的安東尼才幹不足，沒有充分的統治能力，因此，羅馬城內一片混亂。
愷撒麵臨的首要問題，就是傾注全力以恢複羅馬的秩序，並且使元老院能夠正常地召開會議，其次是設法減輕無產市民的經濟負擔，以平抑其不滿情緒。
這時候，愷撒得知一些退役老兵發生了暴動，他們所持的理由是沒有獲得應得的報酬。
愷撒的口才雖然不像西塞羅那樣充滿熱情、智慧和修辭的鋒利，但他獨創了一種簡潔、精練，而且雄壯動人的風格，他的辯才僅次於西塞羅而已。
愷撒再一次發揮了他雄辯的才能，他冷靜地稱呼他們為“各位市民”，並向他們解釋說，他們已經退役而不再是士兵，當然就不能向政府要求軍人的待遇。這些退伍老兵經他這麼一說，也就無言以對，一場暴風雨就此平息。
在非洲方麵也有動亂。在法薩羅平原一役中，戰敗逃亡的西庇阿（龐培的嶽父）曾彙集了一部分殘餘部隊遠赴北非。另一敗軍之將加圖也逃到了非洲。雙方會合在一起，擁有步兵3.5萬人，他們依然野心不減，還想東山再起呢！
非洲的努米底亞王名叫猶巴，他本想置身事外，不願卷入羅馬人的政治紛爭中。但是西庇阿和加圖大軍壓境，他又無力反抗。
就這樣，西庇阿和加圖在努米底亞盤踞下來，而且居然在非洲成立了流亡政府，也設有元老院。由元老院任命加圖為最高統帥，西庇阿則從旁協助。愷撒當然不能眼看著他們在非洲勢力壯大，何況西班牙也傳來了叛亂消息。愷撒計劃先解決了非洲問題，再去西班牙平亂。
在元老院中，愷撒把當前的情勢作了一番詳盡的分析，接著，宣布了自己的計劃和步驟。
當時，元老院中有人提出質疑說：“遠征北非和西班牙都得飄洋過海，我們哪兒來這麼多的船隻呢？”
愷撒微笑著回答說：“閣下的顧慮確實很對！大軍渡海遠征，自然非有大量船隻不可。關於這件事，我早有安排，我在埃及的時候，曾命人在小亞細亞製造了大量的船艦備用，隻要一個命令下去，就可以調集到我們的南方港口來。”
因為愷撒已有縝密的計劃、周詳的安排，因此，元老院就立刻批準了他的請求，讓他率軍去遠征。
愷撒進攻非洲的路線是，先從意大利的南方渡海，經西西裏島，在地中海的南岸登陸。
公元前46年春，愷撒親自率領龐大的船隊，浩浩蕩蕩地渡海出發了。步兵、騎兵數萬人，加上馬匹、糧草、器械、給養等，載滿了幾百艘船隻，它們迤邐前進，煞是壯觀。當他們駛經西西裏島時，見到島上安寧如常，於是繼續揚帆開航，不久，就抵達非洲的北岸。
愷撒率軍登陸後，命令船隊分批回航，以便源源不斷地補充給養。
當時非洲的土著部落尚未開化，個個凶暴強悍，視殺人為家常便飯。愷撒的軍隊往內陸推進時，必須步步為營，時時警戒，一不小心，就會遭受土人偷襲，造成無謂的損失。這些從未到過蠻荒地帶的羅馬將士既恐懼又驚奇，那些罕見的飛禽猛獸，以及各種怪異的花卉果實都令他們目不暇給、心花怒放。
西庇阿和加圖聽說愷撒居然率領龐大艦隊渡海來征討，不免慌了手腳。西庇阿究竟經驗豐富，論膽識或智慧都超過那一夥人，他不得不故作鎮定地安慰他們說：“這一仗是免不了的！不把愷撒解決掉，我們就回不了羅馬。如今他自己送上門來，正好趁此機會解決問題。”有些人心裏沒底，於是反問他道：“我們身處蠻荒地帶，萬一敗了怎麼辦？你有沒有萬全之策，保證我們能獲得勝利！”
“關於這一點，我在幾天前就已經計劃好了。”西庇阿胸有成竹地說。
“那就請你說出來讓我們聽一聽，也好使大家安心。”
“我的計劃是這樣的，你們大家都知道塔普蘇斯這個地方非常險要，對不對？我準備把我們的主力集中在那裏，儲存好足夠的糧食。因為塔普蘇斯四麵環山，隻有一條羊腸小道往北方，愷撒的騎兵根本派不上用場，即使他以步兵通過，我們隻需在峽穀地帶設下埋伏，保證可以將他們殲滅，使他們有去無回。”