在褚英、阿敏於萬曆三十六年二月攻打宜罕山城時，布占泰曾與蒙古科爾沁部翁阿岱貝勒合兵，出烏拉城，欲往援救，見建州之兵勢難抵擋，隻好返回城中，心中大懼，於當年九月擒葉赫五十人，交與建州使者，又遣使臣到建州，向努爾哈赤認罪道歉，並求娶其女說，“若得恩父之女與我為妻，吾永賴之”。努爾哈赤將親生之女穆庫什嫁與布占泰。但布占泰又違背盟誓，兩次攻掠已附建州的窩集部內的瑚爾哈路，以箭射其妻努爾哈赤的親侄女娥恩哲，並欲娶努爾哈赤早已聘定的葉赫布齋貝勒之女。
努爾哈赤聞聽大怒，於萬曆四十年九月二十二日領兵往征，二十九日至烏拉國，攻下金州城等六城，在烏拉都城外安營紮寨，“遣兵四出，盡焚其糧”。烏拉兵晝則出城，與建州軍對壘於河邊，夜則入城歇息。莽古爾泰與皇太極貝勒欲率兵過河，攻擊烏拉軍。努爾哈赤批評兩個兒子輕率出言說：“欲伐大木，豈能驟折，必以斧斤伐之，漸至微細，然後能折”。“欲一舉滅其勢均力敵之大國，豈能盡滅之？先剪除其外圍部眾，獨留其大村（都城），如此，則無仆何以為主，無民何以為君”。遂“毀所得之城，焚其房穀”。布占泰對其過失予以辯解，懇求不要燒焚糧食，努爾哈赤嚴厲譴責，命其送子入質後，班師。
努爾哈赤於第二年，萬曆四十一年正月，再征烏拉，“發兵三萬”，十七日至烏拉。次日，布占泰率兵三萬前來迎敵。諸貝勒、大臣奏請進攻，努爾哈赤再次講述“勢均力敵之大國”不能一次或兩次就可滅亡的理由。代善、阿敏、費英東等貝勒、大臣力請進攻；努爾哈赤同意。雙方交戰，烏拉大敗，“布占泰僅以身免，投葉赫國去”。
五年多以前的烏碣岩大勝及由此發展而來的烏拉之滅，是努爾哈赤及其創建的女真國、後金國發展史上的第三個裏程碑，影響很大。《滿文老檔》記述此役的收獲說：“是役，破敵三萬，斬殺萬人，獲甲七千副”，滅了烏拉，“獲其全國”，分俘獲，“編一萬戶，攜之以歸”。《滿洲實錄》說：“獲馬匹盔甲器械無算，烏拉國所屬城邑皆歸附”，“烏拉兵敗後，有覓妻子投來者，盡還其眷屬，約萬家。其餘人畜，散與眾軍”。
葉赫之戰
居住在葉赫河流域的女真部族，因其居住地而被稱為葉赫部，並築城稱為葉赫城,為他們的統治中心，它東麵是輝發，南麵是哈達，西麵是蒙古,北麵是烏拉。葉赫先世姓土默特氏，後滅扈倫納喇姓部，遂姓納喇氏。葉赫所屬十五部，部民“勇猛、善騎射”。
葉赫始祖星根達爾漢，傳到第四世至褚孔格。葉赫貝勒褚孔格與哈達貝勒旺濟外蘭，“兩關終以敕書不平為爭”。先是，自明朝永樂以來，給海西諸部自都督以下至百戶，敕書共九百九十九道，按強弱分配，屢有變動。那個時候哈達多而葉赫少，南北關相爭，褚孔格被殺，敕書等為哈達所奪。褚孔格子太杵，太杵有二子：清佳努和楊吉努，能撫馭部眾，依險築二城清佳努居西城，楊吉努居東城，皆稱貝勒。後哈達貝勒萬（王台）死，諸子內爭，葉赫乘機報殺祖之仇。但李成梁等支持哈達歹商，在開原漢壽亭侯商誘殺清佳努和楊吉努。
清佳努子布齋、楊吉努子納林布祿分別繼為貝勒，謀掠哈達報世仇。一五八八年（萬曆十六年），李成梁師出威遠堡，馳行六十裏，至葉赫城下。明軍發炮毀柵，攻入內城，布齋與納林布祿出城乞降。葉赫與哈達遂均敕入貢，但因哈達忠於明，多一敕。李成梁曾“大捷共計十次，斬首五六千級”，先後殺王杲、王兀堂、阿台、阿海、清佳努和楊吉努等，在客觀上為努爾哈赤崛起掃清道路。這正如章太炎所雲：
然成梁已戮王杲，數年複大破迄東都督王兀堂，誅阿台，無幾又與巡撫李鬆誅北關首領清佳、楊吉，斬其騎兵千五百人，群夷服。而努爾哈赤以梟雄立姿，晏然乘諸部虛耗，蠶食以盡。藩翰既潰，禍及全遼。則是成梁之功，適為建州之驅除也。
布齋和納林布祿受李成梁重創，元氣再損；而恰好在這時，努爾哈赤已統一建州女真。但葉赫二貝勒對建州的實力估計不足，在劫寨和談判失敗之後，糾合九部聯軍，發動古勒山之役（前已述及）。布齋在古勒山下的戰鬥中喪生，“北關請卜酋屍，奴酋割其半歸之。於是北關遂與奴酋為不共戴天之仇”。布齋死後，“素性剛暴”的納林布祿敗回葉赫城，因念兄優，晝夜哭泣，不進飲食，鬱鬱成疾，後來死去。布齋子布揚古、納林布祿弟金台石繼為貝勒。
布揚古、金台石分別繼為葉赫貝勒後，海西、建州和明朝此時的關係呈現著錯綜複雜。
烏拉亡後布占泰於一六一三年（萬曆四十一年）逃往葉赫，建州三次遣使告葉赫縛布占泰以獻，但葉赫毫不理會。九月，努爾哈赤統兵四萬再征葉赫。建州兵北入蘇完境，迂至北麵時攻入時赫，收取張與吉當阿二路居民，繼圍兀蘇城。城中守將山談、扈石木，看到建州軍“師眾如林，不絕如流，盔甲鮮明，如三冬冰雪”，隻好開門迎降。努爾哈赤對降將賜東珠、金佛帽和衣物，並以金杯賜酒。隨後，建州軍又連下呀哈城、黑兒蘇城等大小十九城寨；但因葉赫預知軍期，有備，乃焚廬舍、攜降民而回。
建州在進攻葉赫的時候，力求能取得明朝的諒解或中立。發兵之前，努爾哈赤便派第七子阿巴泰率所屬阿都等三十餘人求質於明，但遭到部議拒絕。建州奪取兀蘇城後，葉赫荒忙奏於明，明派遊擊馬時楠、周大岐率兵千人，攜帶火器，助葉赫戍守東西二城。努爾哈赤得知明助葉赫的消息後，急忙至撫順所，投書李永芳，長篇大論地述說其征伐葉赫的合理性，略謂：“侵葉赫，以葉赫背盟，女已字，悔不遣；又匿布占泰；故與明無怨，何欲相侵”？建州想割斷明朝與葉赫的聯係，以免在進攻葉赫時腹背受敵。但由於它們各自利益所在，這是難以辦到的。
在扈倫的四部中，以葉赫部勢力最強，又受到明朝的支持。努爾哈赤繼對葉赫兩次征討之後，於一六一九年（萬曆四十七年，天命四年），再次發兵攻打葉赫。這年的正月初二日，努爾哈赤命大貝勒代善率將十六員、兵五千人，往守紮喀關，用以努爾哈赤防止明軍偷襲建州；親率傾國之師起行，初七日深入葉赫界。建州兵自克亦特城、粘罕寨焚掠至葉赫城東十裏，俘獲葉赫部大量人民、畜產、糧食和財物，盡焚葉赫城十裏外之大小屯寨二十餘處。葉赫向明乞師，明開原總兵馬林率合城兵前往馳救。建州軍為了避免兩麵受敵，班師而回。葉赫為了報答明朝的救援，派兵二千應援薩爾滸之戰的明軍。時努爾哈赤謀使所屬詐降葉赫金台石，金台石不應。於是，建州在取得薩爾滸大捷之後。乘勢再次發兵出征葉赫。
努爾哈赤一六一九年（萬曆四十七年，天命四年）八月，召集諸王貝勒大臣會議，商討對葉赫的作戰計劃，並在會議上誓言；“此舉如不克平葉赫，否必不返國也”！時葉赫貝勒金台石住東城，貝勒布揚古往西城，兩城相距僅三裏許。諸王貝勒大臣會議決定：大貝勒代善、二貝勒阿敏（舒爾哈齊之子）、三貝勒莽古爾泰、四貝勒是太極等率護軍健騎，揚言征討蒙古，繞路潛行，直沒葉赫貝勒布揚古駐地西城；又命額亦都等領前鋒軍，“扮為蒙古兵”，馳投葉赫貝勒金台石駐地東城；努爾哈赤則親率八固山額真，直督大軍，隨後進圍金台石城。大軍於十九日出發，即斷絕往來信息。
葉赫貝勒金台石駐地東城，又稱葉赫山城，依山修築，堅固險要。它原為金台石之兄納林布祿住地，瞿九思記述東城言：
其外大城以石，石城外為本柵，而內又為本城。城內外大壕凡三道，其中堅則一山特起，鑿山坡，周使峻絕，而壘石城其上。城之內，又為木城，木城中，有八角明樓，則其置妻子、資財所也。上下內外，凡為城四層，木棚一層。其中控弦之士以萬，甲胄者以千計，刀劍、矢石、滾木甚具。
東城為葉赫城之役攻堅所在。
二十二日，後金軍進至葉赫城下。葉赫貝勒金台石、布揚古統兵出城，開始鳴角操鼓，準備迎戰。後金軍盔甲鮮明，劍戟林立，鉦鼓相聞，河穀震蕩。兩軍混戰多時，葉赫貝勒見勢不能敵，便令鳴角收兵，入城堅守。代善等四大貝勒督率護軍圍布揚古所住西城。努爾哈赤率額亦都等督軍亦圍金台石所住東城。
金台石城被圍後，後金軍毀其柵城，墮其外城。後金軍開始呼金台石投降，金台石不聽，答道：“吾非明兵比，等丈夫也！肯束手歸乎？與其降汝，寧戰而死耳”！東城守軍誓死拒戰，堅守內城。努爾哈赤見敵軍負險頑抗，便激勵將土道：“今日仍不克，則罷兵歸矣”！眾軍齊聲喊道；“願赴死戰”！努爾哈赤便命軍士布列梯，冒矢登城。城上射矢鏃，發巨石，推漆木，擲火器；後金軍二三十人並排井然登城，但傷士也非常慘重。努爾哈赤又命穴其城。軍士們冒矢石，“於城下掘穴，置藥，乃陷”。內城破攻陷後，後金兵士擁入城中衝殺，葉赫兵四麵潰散、金台石見內城陷，攜妻與幼子登上禁城八角摟。
後金軍進圍禁城台樓。因為金台石是皇太極的舅父，皇太極便從西城馳騎至東城，前來向金台石勸降。金台石對皇太極道：“聽到你說收養的一句善言，舅父我就下來；如果說不收養，要殺我怎麼能下去呢？死就死在家裏”。皇太極給金台石以“生殺惟父皇命”的回答。
金台石又請求讓近臣阿爾塔石前往見努爾哈赤，觀察其臉色後再作決定。阿爾塔石被允準帶至努爾哈赤麵前，努爾哈赤怒數其罪責以後，便以鳴鎬射之。阿爾塔石回去後，金台石仍不降。皇太極再派金台石之子德爾格勒至合樓下勸降。金台石終不從。皇太極大怒要將德爾格勒縛而殺之，努爾哈赤說道：“子招父降而不從，父之罪也；父當誅，勿殺其子”。金台石三次拒降，後金兵持斧毀台樓。金台石之妻攜子沙揮下台樓降。金台石走投無路，無奈對皇太極道：“大丈夫豈肯受製於人乎？吾甥庶念汝母及諸舅氏骨肉至戚，弟全吾子孫足矣。吾誓不生也”！
言畢，金台石引弓殺守台軍士，然後奪路直入後室，舉火自焚未死，後被俘而縊殺之。
東城既陷的消息，讓西城聞風喪膽。布揚古孤城無援，軍心渙散：四大貝勒督兵匝圍，攻城益急。布揚古令其堂弟吳達哈（布齋之胞弟）領兵巡禦四門，吳達哈見東城已陷落，大勢已去，遂“攜妻孥開門出降”。四大貝勒兵由此得以長驅而入，徑圍布揚古居所。大貝勒代善勸布揚古降，布揚古因疑懼而不敢出來。代善對布揚古以刀劃酒警道：“今汝等降，我若殺之，殃及我；汝俾我誓，飲誓酒而仍不降，惟汝等殃。汝等不降，破汝城，必殺無赦”！
代善向布揚古作出了降後不殺的保證，自飲誓酒一半，送給布揚古飲另一半。布揚古這才命開居所門降。努爾哈赤因為扈倫四部全亡，留著布揚古無用，便借跪拜禮節不恭為由，將他縊殺。
葉赫東西二城降後，其所屬各城俱都降。時明遊擊馬時楠，率助守葉赫二城兵一千人，也全都被後金軍殲滅。努爾哈赤同葉赫打交道曆時三十六年，終於將其傳八世十一貝勒的葉赫部滅亡。葉赫亡，明朝就此失去北關。
後金對於葉赫降民，父子兄弟不分，親戚不離，原封不動地帶來了。不動女人穿著的衣襟，不奪男子帶的弓箭，各家的財物，由各主收拾保存。葉赫部民被遷徙至建州，入籍編旗，成為後金的臣民。
海西女真在哈達、輝發、烏拉、葉赫，在古勒山之役以後，相繼被建州滅亡。努爾哈赤之所以能夠滅亡扈倫四部，除了在客觀上有利條件之外，就主觀條件來說，是他精神專注，不敢旁騖，采取了先弱後強，由近及遠，利用矛盾，聯大滅小，集中兵力，各個擊破的策略。努爾哈赤就是這樣有策略地、有步驟地逐漸統一了海西女真。
努爾哈赤在統一海西女真的同時，又逐步地開始並附“野人”女真。