在當時，北塔東南10米處施工用的淋灰坑裏的石灰水一夜之間向正北流滲而盡，有洞長達10米，距北塔塔基不足兩米。有人推測或許塔基下有藏寶洞，遂停工挖寶。 這時，奇跡出現了，從洞中挖出了遼代建塔時埋下的佛偈磚221塊，拆舊易新，恰巧用去220塊，僅餘一塊，此機緣足見古人建塔時慮事之縝密，仿佛早就算準了未來修繕時有此之需。
南塔建成於1117年4月，為寺僧紹坦所建。塔13層，高60餘尺，內藏舍利300餘粒。
遼代雲居寺的佛教宗派由晚唐的禪、律共處，改為律宗。
金代直至金明昌年間，雲居寺並未因朝代更替而間斷刻經事業。1180年，義謙法師繼任雲居寺住持，改律為禪。金世宗子、章宗伯父完顏永中施刻的《增一阿含經》《雜阿含經》就在義謙住持之際。金人繼遼代之後續刻自遼代開始刊刻的《契丹大藏經》，並因此才使此經留傳後世。
義謙對雲居寺“重建廊宇，別建僧庵，西序東廚，煥然頂新”，當時長鄉城義井院、李河靈岩寺以及歧陽開化寺皆請義謙為提控宗主。
1215年，蒙古大軍攻破遼中都，大元一統後，雲居寺得到元執政者的重視。
1315年，元仁宗命朝廷官員明裏董阿前往涿州代自己進香，順道至雲居寺視察石經。明裏董阿回京後，奏請元仁宗賜經律論一大藏，藏於雲居寺內。
元代在元文宗、元寧宗之際，雲居寺進行了一次較大規模的修複，至1332年才告結束。
1341年4月，高麗僧人慧月又修葺了石經山華嚴堂，並補刻了堂內殘損的5塊經版。
大明立國之初，明太祖朱元璋於1388年派名僧道衍到雲居寺視察，道衍為隋靜琬開創刻經事業所感，題《石經山詩》並序鐫於華嚴堂石壁上。
1428年，道教的北派全真教代表人物陳風便、南派正一教王至玄等，仿效佛教刻經，募刻了道教的《玉皇經》等4部共刻石8塊，送至石經山藏於第七洞中。
1393年和1444年，明政府又對雲居寺進行了大規模的修複。明永樂年間，中天竺僧人桑謁巴辣曾修複東峪雲居寺，改稱“東峪觀音寺”，並成為該寺住持。
桑謁巴辣是在我國佛寺擔任住持的第一位印度僧人。他在1405年率領諸國使臣至明政府進貢方物，在南京受到永樂皇帝接見，並被封為“圓融妙慧淨覺弘濟輔國光範衍教灌頂廣善西天佛子大國師”，允其隨方傳教，自在修行。
在此之後，桑謁巴辣奉詔居於北京崇恩寺，並在內府教授官員學梵語，有不少王公大臣投其門下，削發為僧。他還於1436年大修了崇恩寺。
桑謁巴辣圓寂後，塔葬於東峪雲居寺附近的白雲陀金香爐山清峰嶺上。桑謁巴辣傳播的是秘密大乘佛教，自明永樂年間桑謁巴辣重修東峪寺後到成化年間，東峪寺住持哩提幹資羅及西峪寺住持嗔嗒悉哩，他們都是桑謁巴辣的梵僧弟子，從而開創了我國佛寺由印度僧人任住持的先例。
1592年，五台山一代高僧真可法師至石經山雷音洞參禮，發現洞內像設癱敝，石經薄蝕，還在雷音洞拜石下石函內起出3顆肉舍利。於是，真可法師在明代慈聖皇太後李彩鳳等人的資助支持下，贖回骨塔和香樹庵，並為香樹庵購置500畝的下莊一所。
此外，真可法師還將東、西雲居寺的住持、執事僧召集一處，嚴加訓示，重申戒律，再肅清規。
明萬曆末年至天啟、崇禎年間，吳興沙門真程勸說在北京的南方籍官僚居士葛一龍、趙琦美、馮銓、董其昌等刻造石經，他們采取先集資在北京石燈庵用小石版刻好佛經，然後送往石經山貯藏，共刻經10餘部。並於雷音洞左側新開一洞，將這些石經藏入其中。
1631年初，出資刻經的明代著名書法家董其昌在新開的洞額題“寶藏”二字，故此洞也俗稱為“寶藏洞”。
至此，曆時千載的房山雲居寺石經刻造事業宣告結束。
到了清代，雲居寺改為臨濟正宗，世代相傳，而且在1672年終於迎來了溟波大師任住持。溟波大師後被尊為雲居寺重開山第一祖。
據溟波大師自述，他7歲即被父母送往天仙廟出家，後在北京憫忠寺受具足戒。曾經師從天津如來庵大博禪師開悟，40歲入主雲居寺。
溟波大師是清康熙年間的著名高僧，蜚聲遐邇，曾得康熙帝親自垂問法力，並賜白金30兩添缽。
在溟波大師主持下，雲居寺共修複建設殿宇、禪堂、寮房、廚庫200餘間，整修了西域寺、東域寺、夢堂庵、雲居寺雙塔、戒壇，以及石經山藏經洞、暴經台等一應建築。
此後，重開山第二代圓通法師繼承乃師遺誌，至1698年將雲居寺重修工程告竣。
圓通的弟子重開山第三代、傳臨濟正宗三十五世了塵法師也是一代有作為的住持，移大悲壇，修兩壁僧寮，建藏經閣。
雲居寺蒸蒸日上的時候，正是清康乾盛世，後世將清代前三代重開山祖師圓通、了塵、光泰並稱雲居寺“三公”，並將他們三人的遺骨分別安奉在3座形製相仿的覆缽式塔中，墓塔均為東向，石砌覆鬥座，覆缽塔身，塔刹為十三天承寶珠，通高均為7米，並列位於雲居寺北塔以北的平台上，俗稱“三公塔”。
經過曆代多次增修、重修的雲居寺，占地麵積6萬多平方米，由當代佛教領袖、書法家、社會活動家趙樸初居士題寫的“雲居寺”寺匾懸於寺門之上。
雲居寺山門前有漢白玉的款龍橋和台階石獅，整座寺廟，依山而建，形成五大院落六進殿宇：即天王殿、毗盧殿、大雄寶殿、藥師殿、彌陀殿與大悲殿，各殿逐次提升，各正院之旁又有配殿，蔚為壯觀。
雲居寺中路以北為行宮院，寺之北部有北塔羅漢塔、三公塔，右側有石經地宮和琬公塔、壓經塔即續秘藏石經塔。
山門即天王殿，出天王殿前有木牌樓一座，左右為鍾鼓樓，院東北隅修竹聳翠，溪流環繞。
正殿為毗盧殿，殿前的兩通石碑為1688年立，記載了重修寺院經過。毗盧殿門懸匾“慧海智珠”，兩旁懸對聯“林外鍾聲開宿月，階前幡影漾清輝”，均為清代乾隆帝禦筆。
毗盧殿後通過兩道磚階攀至第一平台，有一座韋陀小殿兀立其上。
入第二道院為釋迦殿，門額懸匾“耆窟香林”，殿聯“石洞別天清淨地，經函常護吉祥雲”也是清代乾隆帝禦筆，殿內供釋迦牟尼像。
釋迦殿後由旁梯升至第二平台，即第三院，有正殿“藥師殿”，內供藥師佛，懸乾隆題匾“香雲常住”，藥師殿後有兩石階連第三平台。
進入第四院為寺院中心所在，院落寬敞，花木扶疏，院右為方丈居所，院左為文殊殿。
正殿為彌陀殿，懸乾隆禦題“金輪正覺”，內塑阿彌陀佛像，後堂供觀音坐像。彌陀殿院內還立有清康熙年間造的經碑《金剛經》《藥王經》兩方。
繞行彌陀殿後，拾級攀入第五院，庭院甚闊，立碑4方，正殿為大悲殿，懸乾隆禦匾“蓮台淨域”，內供大悲觀世音菩薩，相貌慈悲，供於神龕之內，外遮深色薄紗。
殿右為藏經殿，有小門與大悲殿通。藏經殿深且廣，殿內巨櫃林立，中存經卷。
此外，第四院有南北跨院，南院有殿兩座，一座為祖師殿，內供雲居寺曆代住持像，另一座為地藏殿；北院有大殿兩組，一為千佛殿，另一為行宮院，為清代曆朝皇帝駐蹕之所。
雲居寺是佛教經籍薈萃之地，寺內珍藏的石經、紙經和木版經，號稱“三絕”。石經曆經了隋、唐、遼、金、元、明6個朝代，綿延1000多年，鐫刻佛經共1122部、3572卷、14278石，分別珍藏於石徑山9個藏經洞和雲居寺石經地宮中。
鐫刻如此大規模的石經是世界文化史上罕見的壯舉，堪與我國的萬裏長城、京杭大運河相媲美，被譽為“北京敦煌”。
雲居寺紙經現藏2.2萬多卷，為明代刻印本和手抄本。刻印本包括明永樂時期南京印刷的近3000卷的《南藏》印本和一部1440年《北藏》印本7000餘卷，一部1613年《北藏》印本3000餘卷。藏文經卷共4種1000餘卷，屬於最早的藏文印刷品。手寫佛經多數為明代抄本，最早書於1540年。雲居寺紙經數量之多，為國內各大名寺所罕見。
雲居寺木版經，是始刻於1733年至1738年的清代《龍藏》，梨木雕刻，刻工精細，佛像及版麵生動美觀。這批《龍藏》木版經共7.7萬多塊，先後存放於故宮武英殿、柏林寺、智化寺，後分別運至雲居寺，全部木版經重達400餘噸，堪稱我國木版經書之最。
雲居寺塔建有很多，其中包括唐塔7座，如開元十年塔、開元十五年塔、景雲塔、太極塔與石徑山金仙公主塔等；遼塔5座，如雲居寺北塔即羅漢塔、開山琬公塔、續秘藏石經塔、老虎塔等；以三公塔為首的明清代塔若幹。此外還有隋唐碑刻等曆史文物。
雲居寺中有4件銅質品彌足珍貴，分別是：銅佛1尊、銅鍋2口和銅香爐1尊。
銅佛乃供奉於雲居寺彌陀殿內的阿彌陀佛，這尊銅佛高約3米，重7.5噸，僅修複一個缺損的指頭就用去銅料1.5公斤。
銅鍋是雲居寺的鎮寺之寶，有一大一小兩口，大鍋直徑3米，小的直徑1.5米。據說過去雲居寺香火鼎盛時有800僧眾，兩口銅鍋燒一次飯足夠800僧眾吃一頓。銅鍋底部均勻地分布著一些凹槽，是為防止熬粥時裏麵有小沙子而特意設計。
銅香爐為明宣德年間鑄造，三足鼎立，古樸敦厚，是一件難得的銅鑄法器。
雲居寺不僅藏有石經與千年古塔，而且珍藏著令世人矚目的兩顆佛祖肉舍利。這是世界上唯一珍藏在洞窟內而不是供奉在塔內的舍利，與北京八大處的佛牙、陝西西安法門寺的佛指，並稱為“海內三寶”，為千年古刹增添了一份祥光瑞氣。
[旁注]
天台宗 我國佛教宗派之一。實際創始人是陳隋之際的智顗。因其常住浙江天台山，故名。天台宗以《法華經》為主要教義根據。智顗注有《法華玄義》、《摩訶止觀》、《法華文句》，被奉為天台三大部。其教義主張一切事物都是法性真如的顯現，以中、假、空三諦圓融的觀點解釋世界。
智升 唐代名僧。730年，於長安西崇福寺東塔院撰開元釋教錄20卷，詳錄後漢明帝至唐開元時傳譯至我國的大小乘經律論三藏、賢聖集傳，及失譯缺本等，共收錄5048卷，敕入大藏。此錄為經錄中最完備者，古來凡言及翻譯經典之書，亦皆以此錄為標準。
劉濟 （757年～810年）北京人，唐代藩鎮割據時期任盧龍節度使，忠於朝廷。盧龍節度使即幽州節度使，又稱範陽節度使，是唐王朝在今河北地區設置的節度使，天寶時期的十節度使之一。後來直到五代時期割據河北，一直為河北三鎮之一。
《大寶積經》 又作《寶積經》，唐代菩提流誌等譯，凡120卷，收於大正藏第11冊。係纂輯有關菩薩修行法及授記成佛等之諸經而成，在我國佛教界，被稱為五大部之一，有著崇高的地位。全經內容泛論大乘佛教之各種主要法門，涉及範圍甚廣，每一會相當一部經，亦各有其獨立主題。
喇嘛 藏語意為“和尚”。本來並不是每個出家人都能稱為喇嘛、和尚的，隻有出家的男人受十戒的稱沙彌，受具足戒的稱比丘；出家的女人受十戒的稱沙彌尼，受具足戒的稱比丘尼才能具此稱呼。在我國內蒙古、青海、西藏等處，皆稱僧為喇嘛，意思是上師。
全真教 也叫全真道、全真派，是世界道教的主流宗派，被天下奉為“太上玄門正宗”。該宗嗣太上老君遺教，秉東華帝君演教，承正陽帝君鍾離權和純陽帝君呂洞賓二祖傳教，開宗於重陽全真開化輔極帝君王重陽，以“三教合一”、“全精、全氣、全神”和“苦己利人”為宗旨，並逐漸包容合並了太一道、真大道和金丹南宗。
真可 (1543年～1603年)俗姓沈，字達觀，明末僧人。17歲到蘇州虎丘雲岩寺出家，拜虎丘僧明覺為師，閉戶讀書。20歲受具足戒後，廣研經教。對修寺、刻經，頗有業績。始自楞嚴寺，終至雲居寺，複興梵刹計15所。晚號紫柏大師，門人尊他為紫柏尊者，是明末四大師之一。
董其昌 （1555年～1636年）字玄宰，號思白、香光居士。明代著名書畫家。擅畫山水，師法董源、巨然、黃公望、倪瓚，筆致清秀中和，恬靜疏曠；用墨明潔雋朗，溫敦淡蕩；青綠設色古樸典雅。以佛家禪宗喻畫，倡“南北宗”論，為“華亭畫派”的傑出代表。
覆缽式塔 又稱喇嘛塔，是藏傳佛教的塔，因塔身形如倒扣的缽而得名，基本結構相同，有八種不同的風格。塔的每層結構都表達著一種宗教意義，從下向上分別是：基座、塔身、塔脖、塔刹。巨大的塔身蘊含著深厚的佛教內涵。
方丈 我國佛教雖然一般將住持稱為“方丈”，但一般情況下隻要有寺廟就有住持，而方丈必須是上規模的寺廟群才能有。並且方丈可以兼任多個寺廟，而住持則不能。一般來說，方丈必須由所在省的宗教管理部門和佛教協會任命才能生效。
敦煌 位於我國甘肅酒泉，有悠久的曆史，燦爛的文化。其中莫高窟又稱“千佛洞”，是我國最大、最著名的佛教藝術石窟。分布在鳴沙山崖壁上三四層不等，全長1600米。存有石窟492個，壁畫總麵積約4.5萬平方米，泥質彩塑2415尊，是世界上規模最大、內容最豐富的佛教藝術聖地。
法門寺 位於炎帝故裏陝西寶雞扶風縣法門鎮。始建於東漢末年，有“關中塔廟始祖”之稱，周魏以前稱作“阿育王寺”，隋文帝時改稱“成實道場”，唐高祖時改名“法門寺”。法門寺因安置釋迦牟尼佛指骨舍利而成為舉國仰望的佛教聖地，法門寺佛塔被譽為“護國真身寶塔”。
[閱讀鏈接]
在雲居寺彌陀殿院內，有座嘉慶禦碑亭。嘉慶禦碑是一塊臥龍碑，雕刻精美，做工考究。碑上玉龍騰躍，祥雲環繞，碑身兩麵分別刻有清嘉慶皇帝兩次遊幸雲居寺時禦筆親題的詩文《雲居寺瞻禮二十韻》和《再遊雲居寺》，詞藻華麗，書法遒勁，是一代天驕的代表作。
在抗日戰爭時期，有一次日軍戰機轟炸，有一塊炸彈彈片神奇地擊中了《雲居寺瞻禮二十韻》詩中的“雲”字，且恰恰切去了“雲”字的下半部分，形成一朵雲襯托於“雲”字的下方。這一巧合不得不稱為雲居寺的靈異所在。大概雲居寺通過這朵雲來譴責日本軍國主義製造的戰爭陰雲，給世界文明帶來的災難。
0
1
204
1