隨著藥王廟會聲望日隆，全國各路藥商，紛紛雲集安國，有購有銷，互通有無，並輸往香港及朝鮮、東南亞地區。
至清代中期，這裏逐漸形成了全國各地藥商組成的“十三幫”及“五大會”；同時建立了招待商客、管理市場的“安客堂”。自此，安國成為我國北方最大的藥材交流中心和藥材集散地。明清時期，藥王廟會由“十三幫“輪流操辦，每年初一、十五都要臨廟祭祀。
藥王廟會有“春五秋七”之說，即春廟5個月，秋廟7個月，經年不斷。春廟的正期是農曆四月二十八，傳說這一天為藥王生日，所以成為春廟最盛的一天。冬廟則以農曆十月十五為正期，傳說這天為藥王祭日，盛況與春廟正日相同。
藥王廟會有其獨特的參拜禮儀，包括演戲、抬大供、獻鼎、樹傘、塑金身、掛匾、獻袍、捐地、勞役等多種形式。禮儀則分三拜九叩和四叩禮等數種，另供麵食、三牲祭品。其間還有豐富多彩的遊藝活動。
每屆廟會，整個縣城藥氣熏天，熱鬧非常。“藥州”、“藥都”、“天下第一藥市”、“祁州藥材名天下”的美譽也就名揚中外，有了“藥不經安國不成藥，不過祁州沒有藥味”之說。
【旁注】
針灸 由“針”和“灸”構成，是我國中醫學的重要組成部分之一，其內容包括針灸理論、腧穴、針灸技術以及相關器具，在形成、應用和發展的過程中，具有鮮明的漢民族文化與地域特征，是基於漢民族文化和科學傳統產生的寶貴遺產。
按摩 我國最古老的醫療方法。按摩，又稱推拿，古稱按磽、案杌等，是我國勞動人民在長期與疾病鬥爭中逐漸總結認識和發展起來的。我國最早的按摩專著，當推《黃帝按摩經》。
東漢 我國曆史上的一個大一統朝代，東漢又稱為後漢，乃為區別於西漢之前漢。東漢時的首都洛陽被稱為東京，因此又以東京為東漢的代稱。在東漢，蔡倫發明造紙術；張衡發明地動儀和渾天儀。 佛教也在此時傳入中國。
南宋 是北宋滅亡後宋室皇族在江南建立的政權。南宋雖偏安於淮水以南，卻是我國曆史上經濟最發達、古代科技發展、對外貿易、對外開放程度較高的一個王朝。南宋與金朝、西遼、大理、西夏、吐蕃及13世紀初興起的蒙古帝國為並存政權。
【閱讀鏈接】
藥王廟內碑文所記“十三幫”是：關東幫、京通衛幫、山東幫、山西幫、西北口幫、古北口幫、陝西幫、懷幫、彰武幫、亳州幫、川幫、寧波幫、江西幫。各幫都有自己的幫首，還有一定的規約與習慣。
“五大會”是安國本地藥商及藥市服務行業組成的行會組織，即：南大會，也稱“小藥市”；北大會，也稱“大藥市”；皮貨估衣會、雜貨會和銀錢號會。“安客堂”是安國當地富有聲望的士紳和藥商組織成立的招待客商、解決市場有關問題的群眾性管理組織。
它有很高的權威，主要任務是解決客商糾紛、代管經紀人員，隻有遇到實在不能解決的問題才送交官方，官方一般也要按照它的意誌去辦理。堂內設有“公平秤”，專門解決為稱量而發生的爭執。
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