學科有專門學科、交叉學科和文理滲透之分，上述的學科均為專門學科；交叉學科大致分為三類，即邊緣學科、綜合學科和橫向學科，其中邊緣學科是由幾門學科的邊緣部分相互滲透所產生的中間性學科。如地球物理學，它是由自然科學的邊緣產生的；教育哲學，它是由社會科學的邊緣產生的；數理語言學、教育統計學，都是在自然科學和社會科學的滲透過程中產生的。也就是說，邊緣學科是主要研究某些學科間的交界問題的學科。
綜合學科主要是指以自然界的某一整體為特定對象，運用自然科學與社會科學中的各種學科理論知識和方法加以係統綜合研究的學科。如海洋科學，環境科學等。
橫向學科，是指研究各種專門學科中某些共同性問題而發展起來的學科，並為各門學科的專用研究方法提供公共的研究方法。如控製論、協同論等。
2.專業是“高等學校或中等學校根據社會分工需要而分成的學業門類”，各專業都有獨立的教學計劃，以此來體現本專業的培養目標和規格。從學校的角度講，專業是為學科承擔人才培養的技能而設置的。從社會職業需要的角度講，專業是為了滿足從事某類或某種社會職業必須接受的訓練而設置的。為此，專業是處在學科體係與社會職業需要的一個交叉點上，而不是某一級學科。另外，專業的設置既取決於國民經濟發展和科學文化發展的需要，又取決於學校辦學條件和學校的性質。同時又規定著學校培養人才的規格。專業有長線與短線之分，但長線與短線都是相對而言的。
（二）從教學計劃來講專業建設以學科建設為依托，但不是學科建設
專業的教學計劃是三類課程的組合，即第一類是對學生進行全麵素質教育所必需的思想品德和人文知識課程；第二類是學科基礎課程；第三類是專業性知識和技能訓練課程。第二類和第三類課程就是這個專業培養“人才規格”的目標所規定的課程。這三類課程組合模式在教學改革中，無論專業培養方案如何改革，課程組合中各類課程的分量如何彼此消長，各個學校同類專業無論有多少各自的特點，直至今天都未被突破。而這種課程的設置原則，就是“以育人為目標、以學科為依托、以社會要求為導向”。為此，專業建設是以學科建設為依托，但專業建設不是學科建設。
（三）從專業設置上講，以一門學科為基礎可以設置若幹個專業，這些專業又因學科基礎課程大體相同而被稱為“相近專業”；而一個專業設置可能會涉及不止一門學科，這些學科又可能屬於不同的學科門類。因此，這類專業又被稱為“跨學科專業”或被稱為培養“複合型”人才的專業。
（四）從學科與專業的劃分上來講，學科的劃分是遵循知識體係自身邏輯而形成的“樹狀分支結構”。學科及其分支是相對穩定的知識體係
不管是邊緣學科還是綜合學科，它們都有自己相對穩定的研究領域。而專業是按照社會對不同領域和崗位的專門人才的需要來設置的。不同領域的專門人才根據所從事的實際工作，需要什麼樣的知識結構，專業就組織相關的學科來滿足，也就是說，專業會隨著社會產業結構的調整和人才需要的變化而變動的，如新專業不斷產生，老專業需要不斷更新或淘汰；有時長線專業會變成短線專業，而有時短線專業也會變成長線專業等等。
（五）從學科建設的內容上講，學科建設是專業建設的基礎，學科建設既包括專業建設也包括學科群的建設
1.從學科建設是專業建設的基礎來講，這些基礎具體包括：高水平的師資隊伍；教學與科學研究基地；學科發展最新的成果等。專業建設需在學科建設的基礎上製定專業建設目標和人才培養規格，確定專業的口徑，製定專業教學計劃或者是人才培養計劃。
2.從學科建設的內容上來講，學科建設有些內容屬於專業建設，有些屬於學科群的建設。其理由：
（1）由於專業的劃分要以學科分類為基礎，要與社會職業分工相適應，而專業又是處在學科建設體係與社會職業需求的結合點和交叉點上。所以，學科建設必然涉及到專業建設的內容。
（2）由於學科分類是按其分化的程度呈現出層次性，也就是我們常說的“一級學科、二級學科和三級學科”。為此，按哪一級學科來劃分專業，就必然涉及到專業的口徑寬窄問題。所以，嚴格地講，學科建設，有些屬於專業建設範疇，有些屬於由若幹專業組成的“學科群”建設――如博士、碩士學位授予點的一級學科的建設範疇。為此，不能單一認為，學科建設就是專業建設。