李鴻章和左宗棠一模一樣，都是遙控指揮戰鬥，左宗棠把前線的重任托付給劉錦棠，劉錦棠人稱羽扇綸巾的周瑜，可謂軍事奇才，深得大清將士的愛戴，對回軍的戰役，左宗棠完全可以高枕無憂。
而李鴻章還沒定下決心，台灣戰事的組織有些雜亂無章，大清有數支軍隊在台灣作戰，卻沒有統一的調配，沒有發揮兵多將廣的優勢，反而龜縮在軍事要塞裏，任憑日軍四處掃蕩台灣東部的少數民族地區。
現在名義上是由台灣鎮總兵劉明燈統籌全局，但劉明燈勇猛有餘，謀略不足，在他任職期間，台灣駐軍與台灣少數民族之間摩擦不斷，造成台灣少數民族成立排外的社團，台灣番邦與大清的關係降至冰點。沒有發揚禮儀上邦揮金如土的高尚品格，清廷寓教於人做得不夠出色，使大清與台灣番邦之間有了嫌隙。
台灣番邦竟然說大清不講信用，真是狗咬呂洞賓不識好人心。大清政府每年向台灣輸送給養、物資，隻讓台灣百姓繳納一點蔗糖，真是良心被狗吃了。
劉明燈隻給朝廷發電報，要求援兵支援台灣，不斷陳述日軍有上萬兵馬，清軍隻有固守待援，好似守住戰略要地，就是最大的功勞。劉明燈不敢和日軍交戰，接觸戰開打，便使出龜縮戰術，二千清軍主力固守在基隆港。
但是幾位軍機大臣早已做出過分析，台灣地荒民貧，人口稀少，糧食不能自給自足，是靠福建、廣東調配，這才使得大清四千駐軍得以在台灣、澎湖駐守。
日軍若是出動上萬人，要花多少人力物力運送糧草？小日本矮小瘦弱，一個人基本口糧就算是半斤，10000人就是5000斤糧食，一個月就是要150000斤糧食，要從日本本土或是琉球列島把150000斤糧食運至台灣。戰爭還有驚人的損耗，運送150000斤糧食，至少要運送200000斤糧食，甚至更多，這後勤壓力就會讓日軍崩潰。所以日軍絕不會一次性出動一萬人，還是相信英國人的情報，日軍出動3000人馬，已經到了日本軍力的極限。
日軍要是出動上萬人馬，就不是用來攻打生番之地，早就攻破台灣府，打到基隆港了。哪會在台灣的東部和台灣的少數民族打得不可開交，日軍隻對排灣族施以血腥的報複，猛攻排灣族的領地，日軍對於其他少數民族，采用互不侵犯的原則，反而使出糖衣炮彈，收買台灣少數民族的人心。
李鴻章不相信日本人有這麼大膽量，敢對大清開戰。大清的國力遠在日本之上，直到現在日本人也不承認侵犯了大清的領土。戰爭的初級階段，日軍是以台灣少數民族地區可以作為日本殖民地，以這個借口向台灣少數民族開戰，日軍是抓住大清國文上的漏洞，對台灣用兵。
但就算日軍先頭部隊隻有3000人，對於清軍來說並不好打，日軍是一支現代化裝備的軍隊，而清軍分散在各處軍事要塞，武器裝備落後，軍事力量薄弱。
日軍侵略台灣的目標並不是一口氣占領整個台灣，而是以占領一處深水港為第一目標，就是在琅嶠建立一個橋頭堡，用以修築一個軍事堡壘，為首要戰略目標，以後視戰事情況而定，軍事上做到進退自如的境地。這和西方殖民統治的初級階段類似，殖民者先立足於一個軍事要塞，而後向外擴張，在此期間，殖民者還能和當地少數民族和睦相處，偽裝成做商業貿易。一些唯利是圖的土著民，還以為與殖民者做貿易一本萬利。等到殖民者羽翼豐滿，土著民隻有被屠殺的命運。
明代，豐臣秀吉入侵朝鮮，日軍就是在朝鮮登陸後，修建一處處軍事要塞，這才使得日軍被大明軍隊打得大敗之後，還能做出戰略調整，固守在朝鮮東部沿海的軍事要塞裏，讓明軍啃不動，兩軍隻能互相對峙。中日在朝鮮打了兩年之後，日軍因為耗不起財力，國力支持不了這場戰爭，再加上豐臣秀吉之死，這才使得日軍撤出朝鮮。
若是讓日軍在琅嶠建立橋頭堡，建立龐大的軍事基地，日軍就會對清軍的駐地展開進攻。到時日本人又會有另一番說辭，名曰：“是清軍首先開槍的，日軍是被迫自衛反擊。”這種鬼魅伎倆，豈能蒙蔽世人的眼睛。所以李鴻章絕不容許日軍在台灣站穩腳跟，把他最厲害的王牌“李國樓”派往台灣島，兩人遙相呼應，此戰必勝。
李鴻章對於李國樓提出的“以戰促和”的主張，頗為欣賞。戰是手段，和是根本。若是沒有敢戰的勇氣，再多的軍隊也沒用。日本軍法之嚴酷，超出人的想象。日軍是以最大的敵人戚繼光為榜樣，練出的現代化軍隊。戚繼光編著的《紀效新書》、《練兵實紀》成為日軍練兵的參考書，日軍學習敵人的所長，練成一支技術過硬，思想過硬的鐵軍，使日軍悍不畏死，敢於以弱逞強，彈丸小國也敢入侵大清領土。