這海軍部和陸軍部的尚書看似威風的很，但是在明朝的這個時期，兵部尚書卻是比較空閑的職位，如今朝廷的軍務主要由陸軍部、海軍部還有五軍都督府管理，而這些部門又被內閣和秘書處製約著，這尚書根本就沒什麼特權，唯一的好處就是能夠憑借著這尚書的頭銜擠進內閣而已，可是現在內閣總理大臣的席位似乎不怎麼缺少，最少在幾年之內是不會擴增人數了，除非內閣的這幫老頭子有人掛掉，而且就算掛掉一個，如今光是正二品的尚書就有十幾個，還有一大堆候補的其他官員，如何能夠成為百裏挑一的好漢，那還難說的很，但是這就是後話了！
朱由校的最好打算便是把孫元化調到海軍部去，讓袁崇煥接替孫承宗的平遼水師經略的位子，但是朱由校看了看徐光啟的臉色，平日總是有些激動的臉上此時倒是反常的平靜，那平靜的臉色下麵肯定暗藏著激烈的思想鬥爭！
“這海軍部的代理尚書袁應泰做的不錯，朕無故替換似乎有些不合常例啊！”朱由校這時掃視了一眼海軍部代理尚書袁應泰，這人據說是個治水高手，搞內政十分了得，但是不知道為什麼竟然混跡到海軍部尚書的位子上來了，算是才不盡所用啊！雖然這袁應泰為人比較平和，進取不足，守成有餘，但是還算是個不錯的人物，而且和孫承宗和徐光啟等人界線分的很清，是朝中的第三種人，屬於是朱由校重點扶持的官員！
海軍部尚書和平遼水師經略還有南洋水師經略比來，官職要高，但是實權便要減少很多了，如今孫承宗便是希望這孫元化調到海軍部來掛個空職，可是朱由校這般一說，倒是讓孫承宗有些不好處理了！
“皇上，這回不是要把兩京之一的南京僅存的禮、刑、工三個舊製衙門、還有其他寺局全部撤消，然後把南京改為朝廷直屬布政史司麼！這布政左使自然需要個級別高些的人物，微臣覺得袁應泰大人就很適合的！”孫承宗這回為了給袁崇煥騰出平遼水師經略的位子，倒是花費了不少心血，這南京布政左使雖然隻是從二品，比之海軍部尚書的正二品是要差了些，但是能夠號令大明經濟實力第二強大的南京，那就不是一般的布政使了，也許袁應泰很快便可以躋身到大明的權利核心了！
朱由校有些突然，孫承宗的提議十分不錯，京師的發展已經十分突出了，但是背景地理位置離大明的人口和經濟密集地區江南要遠了些，發展南京已經是迫在眉睫的事情了，而朱由校也一直在對南京的官員配置進行調動，這袁應泰倒是個不錯的人選！
“徐愛卿以為如何呢？”朱由校將問題拋給了徐光啟，令徐光啟有些為難，看來今日吃虧是吃定了，政治平衡可是一把雙刃劍，有時候自己能夠因為這些從孫承宗那裏揀些便宜，但是有時候自己就是那般被人宰割！再說就算自己答應了皇上，皇上然後把孫元化調到了海軍部，憑借自己在軍中和朝廷的關係，這海軍部尚書也絕對不會像袁應泰在位時這般空閑，搞不好到時還是自己的一個好幫手呢！更何況這孫元化兩年前才是什麼人物，如今能夠火箭般的升到海軍部尚書，已經是天大的好事了！
“皇上，微臣以為袁應泰大人能夠很好的擔任這南京布政使的職務！”
朱由校這時覺得時機差不多，便是快言道：“既然如此，那就將袁應泰的海軍部尚書的職務撤消，然後委任為南京布政左使，待新任海軍部尚書到位之後便赴南京上任！各位大臣可以不同的意見麼！”
大家見到孫承宗和徐光啟答應，加上朱由校拍板，自然不敢說什麼反對意見，這件事情也就這般拍板了，這時朱由校又是接著說道：“既然這海軍部尚書的位子空出來了，現在就是在袁崇煥、孫元化和風落雲三人中遞補一個了，這三人中風落雲為南洋水師經略，暫且不做考慮，而袁崇煥和孫元化中一人要接任孫承宗的平遼水師經略，一人遞補海軍部尚書！朕的意思便是孫元化遞補海軍部尚書，袁崇煥接任平遼水師經略！各位可以反對意見麼？”
朱由校這回又是自己拍板，二十幾個大臣沒有一個敢出來反駁朱由校的，再說這官職的任免也是合情合理，又不曾有什麼超越常規的做法，而朱由校這回一舉免了孫承宗的軍權，同時還把徐光啟在大明水師中的勢力趕了出來，自然是非常好的結局。
孫承宗和徐光啟雖然不是十分滿意，但是這也都是一些不傷及根本的事情，再說朱由校雖然最近不怎麼給自己扣朋黨的帽子了，但是自己還是要避嫌一下，免得自己功高鎮主，招來殺身之禍！