治療包括保持耳部清潔，防治並發症，注意鼻和咽部的疾病治療，對單純型和骨瘍型而無並發症者，用局部藥物治療為主。若保守治療無效，而有並發症或為膽脂瘤型者應采用手術療法：①清除膿液：必須經常、仔細、耐心地用雙氧水清洗外耳道和中耳內瀦留的分泌物。負壓吸引可清除中耳深處的膿液。②局部用藥：因本病多為混合感染，有條件時應根據細菌藥物敏感試驗結果選用藥物。藥有水劑、醑劑、油劑，應根據病情而選擇適當的劑型。在用滴耳液時，患側可側臥，患耳向上，滴入藥液後，用拇指交替壓、放耳屏數次，藥液可借正負壓置換作用，流入中耳。③鼓室內肉芽應予以清除。④手術療法：膽脂瘤型、骨瘍型和保守療法無效的單純型化膿性中耳炎患者，均應根據局部和聽力情況施行鼓室成形術、乳突根治術。原則是清除病變組織，防止或治療並發症，盡可能地保護或提高聽力。目前可行乳突根治和鼓室成形複合術，以清除病灶和改善聽力同時進行，但應嚴格選擇手術適應證。⑤在鼓室炎症消退後，鼓膜遺留幹性穿孔的患者，可以用手術或非手術的方法進行耳膜修補術，以防止水或其他液體入耳，否則可使炎症複發，同時也可以改善聽力。
本病應與分泌性中耳炎相鑒別：分泌性中耳炎多數患者在發病前有感冒史，有耳堵感，聽力減退，自聲增強和耳雞。中耳負壓嚴重者可有耳痛和眩暈。檢查時見鼓膜內陷，鼓室積液時可見在鼓膜內側麵有液平麵，或有氣泡。病程長者，耳膜可變薄，常緊貼鼓室內壁。慢性者，耳膜可增厚，色暗淡，活動減退。聽力學檢查為傳導性聾。鼓室壓曲線為高峰偏負壓，並常呈弧形平坦型。
對於本病的預防在於防止急性中耳炎的發生。一旦發生急性中耳炎，應及時積極地治療，以免演變成慢性中耳炎。慢性化膿性中耳炎可以延續數十年而不愈。單純型中耳炎可呈間歇性發作，間歇期中炎症清退，耳漏停止，鼓膜留一幹性穿孔。有些病例鼓膜可自然愈合。炎症消退後，若有聽骨鏈粘連或鼓室硬化，則可發生明顯的傳導性聾。對某些膽脂瘤型和骨瘍型中耳炎若不及時進行手術，可引起各種顱內外的並發症。