2.內部審計法規不健全，人員素質不高
內部審計法律依據不充分、不健全，或出現空白，使得內審人員在進行審計時，隻有依據經驗和知識進行分析判斷，在某種程度上影響了審計結論的權威性，因而增大了審計風險。同時，目前我國內部審計人員整體水平不高，綜合素質較低，識別風險、判斷正誤的能力較差；有些內審人員職業道德欠佳，不能經受各方麵的誘惑；內審人員一般由領導指定，很容易出現任人唯親，從而難以選用有真才實識的人來擔當此重任，形成審計風險，在工作中仍以賬項基礎審計方法為主，審計目的仍是“查錯防弊”，在工作中往往是事後審計多，事前、事中審計少；對下屬單位審計多，對本級的審計少；對領導幹部離任審計多，對任期經濟責任審計少。
3.審計質量不高
內審人員長期的審計工作形成的思維方式和工作方法的局限性，導致審計質量不高。與此同時，內審人員常常將內審工作範圍限製在具體財政收支的狹小空間上，而沒有把內審工作的重點放在經濟權利的監督與製約上，對促進單位宏觀經濟管理水平的提高關注度不夠，導致審計質量不高。這都使內部審計質量得不到保證，更談不上防範風險。
三、全麵預算管理與內部審計相結合的可行性分析
（一）預算管理在內部審計中的體現。
1.內部審計是一種管理，它是管理的一個組成要素，它是為相關的管理人員服務的，來確保公司的日常經營符合公司的整體目標。所以，內部審計機構一定要涉及預算管理的全部活動。
2.目前，時代在不斷地變遷，內部審計的工作內容也隨之改變，其範圍在不斷擴展，出現了控製、谘詢以及評估等新的工作內容，這些新的職能結合管理控製共同發揮作用，有利於內部審計機構進行有效的監督，同時還能為公司更好地服務。因此，就內部審計的工作內容而言，內部審計機構要涉及預算管理的所有活動。
（二）內部審計在預算管理中的作用。
1、內部審計有利於戰略預算的實施
內部審計通過對企業風險管理過程的充分性和有效性的評價，運用環境分析與風險預警分析，評價企業戰略目標是不是再分析組織和行業的環境情況和趨勢、企業的優勢和劣勢、外部的機會和威脅的基礎上結合企業風險偏好製定的。它通過參與相關管理層討論，看分解到各部門的目標是否會對戰略目標提供足夠的支持，有利於企業判斷內、外部環境可能帶來的機遇與挑戰，及時進行戰略調整，改進戰略預算管理體係，使預算管理更好地服務於企業。
2、內部審計可以降低信息不對稱帶來的“預算鬆弛”現象
信息不對稱使預算執行者為了順利完成預算，製定預算時往往傾向於較為寬鬆的標準，使完成某項任務所預算的資源數量大於實施所需要的資源數量，或使預算的產出量小於可能的產出量，這種現象就是“預算鬆弛”。對於全麵預算管理而言，內部審計機構在企業中具有的相對獨立性，保證了內部審計機構在監督和評價預算管理時能夠保持客觀公正的心態，內部審計參與全麵預算管理控製可以緩解這種信息不對稱形成的預算鬆弛現象，利用其所掌握的各種信息形成對正確預算有力支撐，降低信息不對稱對全麵預算管理形成的不利影響。
3、內部審計可以保證預算得到有效執行
不少企業在編製、分解、下達預算指標時聲勢浩大，但在實際執行時卻缺乏有效的實時監控，使得控製與最終的考核缺乏標準性與公正性。內部審計可以通過全麵預算管理控製整個業務過程的記載，實現對整個預算管理的動態管理控製、對風險點的實時控製、實現對預算工作任務的合理分解，整合管理資源，促進部門預算管理責任製的落實，從而便於預算結果的考核和評估，保證預算得到有效執行。
四、體係構建
基於全麵預算管理和內部審計相結合的內部控製體係建立的指導思想是在內部審計機構介入全麵預算管理方式，開展全麵預算管理內部審計工作。
1.內部審計機構的工作內容
目前，公司的內部審計機構在組織形式方麵類型很多，一些審計部門附屬於監事會；一些審計部門附屬於總經理以及有關的財務負責人員；一些審計機構和紀檢監察機構共同創建了一個機構；一些審計機構與審計委員會並存，共同發揮作用，二者都屬於董事會的下設機構。就公司的管理而言，內部審計機構要參與預算，是一種管理活動。預算管理通常由三個方麵組成：預算決策的製定、有關的職能機構以及責任機構。預算決策的製定主要是由董事會和有關的谘詢部門負責，其工作的主要內容是對公司預算的審核批準，做到整體掌握。為了確保內部審計一些新型職能的有效發揮，內部審計機構應該盡量歸屬與董事會的領導。內部審計工作的主要內容有：對預算製度的有關方針進行審核；對預算目標，政策以及相關的步驟進行審核；對二級機構的具體實施情況的審核監督；對預算的實施結果進行審核，向公司高層提供審計報告。