明代的花鳥畫也卓有成就，徐渭的淋漓暢快、陳道複的雋雅灑脫，代表了文人畫的兩種不同風格。清代石濤、惲壽平、朱耷和揚州八怪等都在花鳥畫發展史上占有重要地位。
現代畫壇中，花鳥畫整體上已不太引人注目，但吳昌碩、齊白石等大師為中國花鳥畫的發展，注入了新的活力。
（一）明代的花鳥畫
在我國繪畫史上，明代畫風迭變，畫派繁多。在繪畫的門類和題材方麵，傳統的人物畫、山水畫、花鳥畫盛行。水墨山水和寫意花鳥畫成就顯著。
這一時期花鳥畫的代表畫家有邊景昭、孫隆、林良、呂紀等。邊景昭擅長工筆重彩，承襲南宋院體傳統，妍麗典雅而又富有生趣。孫隆在北宋徐崇嗣的基礎上進一步發展，專攻沒骨法。林良以水墨寫意花鳥著稱，筆墨簡練奔放，形象準確生動。呂紀工寫結合，花鳥精麗，自成一派。
明朝中期，蘇州逐漸成為江南富庶的大都市，文化也隨之繁榮。陸治師從吳門四家之一的文徵明，花鳥畫則兼取徐熙、黃筌兩派之長，創文人畫的工筆花鳥新風，筆墨細秀，設色淡雅，有妍麗派之稱。
陳淳亦出自文徵明門下，花鳥畫受沈周影響，繼承水墨寫意技法，在筆墨的放逸、情致的跌宕等方麵有所發展，與徐渭並稱。周之冕受吳門派影響，融彙陸治、陳淳兩家之長，另創一兼工帶寫的小寫意畫法，被稱為勾花點葉體。
明朝後期約在萬曆至崇禎年間，繪畫領域出現了新的風格。徐渭進一步完善了花鳥畫的大寫意畫法。徐渭是繼陳淳以後，從根本上完成水墨寫意花鳥畫變革的一代大家，其畫風有力地推進了後世寫意花鳥畫的發展，畫史稱其畫派為青藤畫派。
徐渭的花鳥畫風格，吸取了宋元及沈周、林良、陳淳等水墨花鳥畫畫家的長處，並在此基礎上又有重大革新。徐謂以潑墨大寫意花鳥畫風影響了文人花鳥畫的審美觀。他以草書乃至狂草入畫，揮灑個性情感的雄勁筆墨，一掃正統文人畫家中以和為美的審美規範。
在題材方麵，他大膽突破客觀物象形質的局限，賦予物象以強烈的個人情感，作品或托物言誌，或借題發揮，一反吳門派文人畫恬適閑雅的意趣，直抒激蕩不平的心情，產生了強烈的藝術感染力。
在藝術形式上，徐渭擅長潑墨法，以狂草般的筆法縱情揮灑，不拘成法，超脫形似，追求氣韻。這種隨意點染的畫法，氣勢磅礴，恰當地表達了畫家熾熱激憤的情懷。
徐渭的畫風，對清代的朱耷、石濤、揚州八怪、海派乃至現代的齊白石等都產生了深遠的影響。
（二）清代的花鳥畫
清代水墨寫意畫法盛行，清初的朱耷以花鳥畫著稱，繼承陳淳、徐渭的傳統，發展了潑墨寫意畫法。作品往往托物言誌，以象征、寓意和誇張的手法，塑造奇特的形象，抒發憤世嫉俗之情和國亡家破之痛。筆墨簡練雄勁，構圖簡約空靈，景象奇險，格調冷雋。朱耷奇肆的畫風，創造了畫史上獨樹一幟的冷傲風格。
朱耷對後來的揚州八怪和近現代大寫意花鳥畫影響重大。惲壽平的沒骨花卉畫，以極似求不似，風格清新淡雅，影響也非常廣泛，被稱為常州派或南田派。
清代中期，揚州富商聚集，人文薈萃，經濟、文化迅速發展。各地畫家紛至遝來，賣畫獻藝，揚州八怪就是其中最著名的一批畫家。
關於揚州八怪，說法不一，一般認為並不僅限於八個人，而是代表了藝術個性鮮明、風格怪異的一批畫家。他們重視生活感受，強調抒發情感，作品多以梅、蘭、竹、菊和山石、野花、蔬果為題材，以寓意手法比擬清高的人品、孤傲的性格、野逸的誌趣，使作品具有較深的思想性。
在藝術形式上，揚州八怪繼承陳淳、徐渭、石濤、朱耷的水墨寫意傳統，不拘成法，自由揮灑，進一步發展了破筆潑墨技法，形成了個性鮮明、獨具神韻的風格。
揚州八怪中金農的水墨梅、竹，鄭燮的蘭、竹，汪士慎和李方膺的墨梅等，都對後世的花鳥畫產生了較大影響。
隨著乾嘉金石學的興起，花鳥畫的發展進入了新的階段，海上畫派以金石筆法入畫，又一次衝擊了傳統士大夫文人的中和之美，在中國花鳥畫史上翻開了一頁新的篇章。
尤其是吳昌碩蒼渾厚重的筆墨、相輔相成的色彩、氣勢雄勁的章法，加以獨特的書風、印風，對現代花鳥畫產生了重大的影響。
現代花鳥畫家中著名的有潘天壽、齊白石等人。潘天壽融南北宗於一體，突破明清以來花鳥畫清麗柔美的風格，開創了奇險雄勁的風格。表現了深厚的民族文化意識，也不同程度地滲透了現代人的情感。
潘天壽的雄渾與骨力，齊白石的真率與剛健，都是與現代精神相通的，在一定意義上突破了傳統文人畫的思想情感範疇，使花鳥畫取得了新的發展。