為興建三峽水利樞紐工程（以下簡稱三峽工程），開發長江上遊水力資源，經國務院批準，中國長江三峽工程開發總公司（以下簡稱中國三峽總公司）於1993年9月27日正式成立，是國家實行計劃單列的特大型國有企業。中國三峽總公司的戰略定位是以大型水電開發與運營為主的清潔能源集團，主要經營範圍是水利工程建設與管理、電力生產、相關專業技術服務。經過十餘年的建設和發展，中國三峽總公司正逐步由項目法人轉變為國有大型集團公司，由單一的三峽工程建設向多項目、流域梯級開發轉變，由主要側重於三峽工程建設向多個大型水電工程建設、電力生產、新能源開發等多業務並舉轉變。
中國三峽總公司全麵負責三峽工程的建設與運營。三峽工程竣工後，中國三峽總公司將控有三峽、葛洲壩兩個樞紐2500萬千瓦的裝機容量。
國家授權中國三峽總公司滾動開發長江上遊幹支流水力資源，組織建設溪洛渡、向家壩、烏東德、白鶴灘四個巨型電站。這四個電站裝機容量4035萬千瓦。
近兩年，中國三峽總公司還積極探索了風電和抽水蓄能電站等新型可再生能源開發。
在水電開發與運營中，中國三峽總公司以科學發展觀為指導，積極倡導和推行“建好一座電站，帶動一方經濟，改善一片環境，造福一批移民”的理念，努力實現經濟效益、社會效益和生態效益的協調統一。2006年，中國三峽總公司黨組被中組部、國資委黨委授予全國國有企業“四好”領導班子榮譽稱號。2008年，中國三峽總公司被科技部、國資委和中華全國總工會確定為首批創新型企業。
中國三峽總公司作為國有獨資企業，實行總經理負責製。最高決策層由總經理和副總經理組成，總經理對國家和出資人負責，在公司章程和有關法規規定的權限內全麵管理公司事務。公司設科學技術委員會、投資委員會和預算委員會，作為決策層的谘詢機構輔助決策。
中國三峽總公司全資及控股公司包括長江電力、財務公司、三峽發展公司等15家子公司。2002年9月，中國三峽總公司作為主發起人，設立了中國長江電力股份有限公司，2003年10月，長江電力A股發行成功。11月18日，長江電力A股在上海證券交易所上市。長江電力上市以來按照國際一流標準管理和運營三峽、葛洲壩梯級電站，公司業績穩步增長，核心能力顯著增強，在電力市場和資本市場樹立了良好形象，確立了其在水電生產行業的龍頭地位。
2009年1月1日，中國水利投資集團公司並入中國三峽總公司，中國水利投資集團公司與其下屬的中國水利電力對外公司分立，成為中國三峽總公司兩個全資子公司。
為宣傳三峽工程和水電開發，中國三峽總公司主辦了國內外公開發行的《中國三峽工程報》、《中國三峽》雜誌、《中國三峽建設年鑒》等報刊和CTGPC網站。