當賀人龍押著土謝圖汗回到營地的時候，這場戰役已經徹底結束，土謝圖汗部落的士兵除了潰散逃跑的，向明軍投降的以外，死傷並不算太多。除了攻取第一個營寨時，為了起到震懾作用外，對另外的兩個營盤衝過來的騎兵發射迫擊炮隻起到了打亂隊形的作用，真正被炸死的並不多，再加上賀人龍彪悍的斬首出擊行動，讓他們失去了作戰意誌，最終收降的俘虜有四萬多人，死亡人數不超過兩萬人。
土謝圖汗屬於被俘虜的敵人，他失去了談判的機會，孫傳庭也沒有殺他，而是把他交給了謨囉唄瑪，謨囉唄瑪按照遊牧民族的習慣，作為戰勝者他有權利接受失敗者的一切財產，但是還是根據孫傳庭的意見，釋放了所有俘虜，並且告訴他們自己已經接受了大明的談判條件，將來要按照大明的管理方法管理大草原，不會再像以前那樣無條件收取個人的任何東西，不過將來要實行牛羊馬匹的圈養，在這一帶開始定居生活，修建民房，不得隨意遊牧，免得破壞牧場的生態平衡。其實有些道理他自己也不明白，什麼不得破壞生態平衡，他自己也覺得原來不也是這麼過來的麼，反正孫傳庭說了，就這樣說下去慢慢再理解好了。
謨囉唄瑪和孫傳庭商議是不是讓他和奧巴一起去會見哲布尊丹巴活佛，讓哲布尊丹巴活佛接受大明的建議，開展佛教活動自由，但是必須接受朝廷的管理，要像烏斯藏那裏的活佛一樣，可以成為民間團體，但是不得幹預政治事務。
孫傳庭同意了謨囉唄瑪的要求，並且答應他可以讓哲布尊丹巴活佛可以以住錫地為中心，建設一座講經誦佛的寺院，並且給予一定的土地最為生活來源，如果還有什麼別的要求，也可以提出來，要盡量滿足他的合理要求。
事情有時會發生意想不到的變化，謨囉唄瑪和奧巴還沒有出發，就傳來了意外的消息。就在孫傳庭和謨囉唄瑪商議這件事情的第二天，大廳外麵有人通報，說是有哲布尊丹巴活佛的弟子求見。孫傳庭見用到的是求見的詞語，就判斷發生了不太好的事情，因為正常的詞語應該是會見，就是打算商量事情。於是，就立即名人將來人請到大廳詢問。
事情還是因林丹汗引起的，原來林丹汗把土謝圖汗推到自己前麵做擋箭牌，自己就帶領部落直奔哲布尊丹巴活佛的住錫地，他的目的是讓哲布尊丹巴活佛幫他說服劄薩克圖汗，還有附近的逐漸接受佛教的部落，擴大自己的勢力。哲布尊丹巴活佛可不是普通的活佛，它是後世藏傳佛教的四大轉世活佛之一，幾乎和後世西藏地區的達賴、班禪活佛齊名，尤其哲布尊丹巴活佛還是第一代活佛的前身，他肯定是一位務實的智者，不然的話作為一個外地人，他是無法融入當地生活的。據後來的記載，哲布尊丹巴活佛是四川理塘的藏族人，受四世達賴喇嘛的委托前來喀爾喀蒙古傳教，而四世達賴喇嘛卻是土默特蒙古達延汗的孫子，這是一種比較複雜的權力鬥爭互相妥協的結果。
哲布尊丹巴活佛從烏斯藏地區來到這裏已經十多年了，對於這裏的複雜勢力了解的比較充分，再加上他崇高的地位，對於外界的了解也是絕對多於普通的蒙古人，無論是朱有孝帶領下的大明快速的興旺擴張情況，還是李信的兵不刃血迅速取得烏斯藏大方式，這些情況哲布尊丹巴活佛多做了仔細的形勢分析，以他那高超的智力肯定會偏向於和大明合作，林丹汗不會是大明的對手。所以在孫傳庭向喀爾喀三部出兵的時候，他就打算出麵協調，不料明軍進軍速度太快，還沒有來得及溝通，已經被孫傳庭收服了兩位，而林丹汗的到來，讓事情發生了以外的變化。本來他還想說服林丹汗接受明朝的統治，沒想到林丹汗卻憑借正統嫡係的名義要求他協助對抗大明。哲布尊丹巴活佛自然不會聽從林丹汗的要挾，於是便被林丹汗劫持西行，好歹還有弟子逃脫，這就有了向孫傳庭求救的事情發生了。