日升昌經營的後期，形成了大量的呆死賬貸款，主要有兩部分，一是貸給官吏和官府的款項。到清朝末年，由於政局變動，貸給官吏和官府的大量款項根本就無法收回。二是貸給商戶的款項。在日升昌的經營中，十分注重信用，這也為其贏得了信任，日升昌留存下的賬目贏得了許多客戶，但是在信貸業務中也隻是一味地依賴於信用，不采取任何的擔保手段，致使貸款到期難以收回而承受了巨大的損失。大量的呆死賬貸款，使日升昌的經營周轉發生了困難。日升昌自身業務不需要擔保，但卻對外提供了擔保，這也是它經營衰敗的直接導火線：日升昌北京分號因為祁縣合盛元票號提供擔保，受合盛元倒閉的牽連而於1914年離京撤號。債權人起訴後追索到了平遙總號，日升昌進入清理、償債期，從此一敗塗地。