有調查表明，在Web2．0時代，在選擇電子支付考慮的諸多因素中，64．5%的商戶首選安全因素。39．8%的商戶很關注電子支付是否快捷和方便。這同時也是支付公司和銀行共同關心的要素。因為支付產業從某種角度而言就是安全產業。從技術角度看，國內電子支付的安全係數遠遠高於國外，但是從支付安全管理而言，與國外還有一定距離。
在資金流裏麵必須建設的是安全問題，如果資金流不能解決安全問題，電子商務也就沒有前景可言。
兩年以前（2003年）我在達沃斯參加一個會議，經過長期思考，我認為中國銀行的發展非常緩慢，在銀行業從事電子商務可能有很長的路要走。而我們的一些企業呢？具備了電子商務的經驗，但又缺乏營業執照。
我們該不該建設資金流呢？要把中國的電子商務引向另一個階段，我們必須要配上資金流。所以在兩年前（2003年）我們發展了支付寶，支付寶在企業中的迅速發展讓我們非常吃驚。
2004年，阿裏巴巴意識到當今做資金流是最困難的事情。但如果不解決資金流，不解決電子商務的支付問題，電子商務不知道下一步會走到哪兒。電子商務資金流的流失對產業和國家的危害非常大，如果我們不做，跨國公司是會做的。
在今天，我們的銀行可以做（電子商務支付），但是銀行不知道該怎麼做，而處在電子商務裏麵的我們是知道怎麼做，但我們不能做，因為我們沒有資金。但如果跨國公司在中國做了電子商務支付，如果未來70％～80%的資金流走的都是電子商務，這對國家的經濟安全是有巨大挑戰的。所以，那天我在達沃斯的時候，我就決定要立刻做電子商務的支付，必須跟中國人民銀行，跟各個商業銀行聯合。銀行做銀行的，我們做我們的。
為解決電子商務支付環節的安全問題，2003年10月，阿裏巴巴首先在淘寶網推出了獨立的第三方支付平台——支付寶，正式進軍電子支付領域。
支付體係如果不解決，網商都會說這在瞎掰，都在浪費時間，兩個人扯來扯去，反而會把事情搞得越來越不好。銀行不做支付，你說我們怎麼做？但是要等銀行做，大家說說看，我估計要5年時間，再等五年，中國的電子商務跟海外會相差越來越多。去年（2002年）在國際網上，光在“中國供應商”上（實現）的海外采購已經超過了100萬美元。單子越來越多的情況下，電子商務不解決，這個問題很嚴重，所以我們跟四大銀行合作，推出“支付寶”。
2005年2月，國內最大第三方電子支付服務提供商支付寶公司又推出了“全額賠付”製度，對於使用支付寶而受騙遭受損失的用戶，支付寶公司將全部賠償其損失。支付寶公司又將全額賠付製擴展至阿裏巴巴B2B，以及所有采用支付寶支付工具的電子商務公司。這種主動全額賠付以保障用戶利益的做法，在國內電子商務網站尚屬首例。這一製度一方麵顯示了阿裏巴巴解決電子商務支付問題的決心，另一方麵也表現出阿裏巴巴對“支付寶”產品的絕對信心。
支付寶是一個最活躍的平台，因為馬雲要從這裏解決物流和資金流的問題，因而，他對支付寶公司投入的精力和財力是最大的。同時，支付寶公司也是阿裏巴巴公司中最為活躍的一個子公司，它的談判對象都是資金流與物流方麵特別優秀的銀行和企業。它甚至還吸引了阿裏巴巴對手的客戶。
馬雲表示：“我們未來幾年全力投入產業建設，這個環境建立起來，這個生態鏈建立起來，這才能起來。感謝這兩年銀行的加入，特別是各個銀行充分意識到電子商務的重要性，才產生支付寶這樣的工具。現在支付寶已經擁有五千萬的用戶，最終將超過三千萬的信用卡用戶，我覺得這個是在銀行充分意識到需求的情況下發展起來的。”
物流是指產品實體從供應者向需求者流動的過程。電子商務時代，由於企業銷售範圍的擴大，企業和商業銷售方式及最終消費者購買方式的轉變，使得送貨上門等業務成為一項極為重要的服務業務，從而推動了物流行業的發展。