第二，對每月績效工資進行加總，測算是否超過單位年績效工資總量。基層單位年績效工資總量是根據單位人均績效和編製人數由人社局進行核定，醫院實行收支兩條線後績效工資差額由財政補助，如果基層單位績效工資發放脫離了總量控製，肆意發放，勢必失去了“削峰填穀”“限高托低”的作用，從而也加大了財政負擔。
第三，抽查會計憑證，是否有濫發津補貼行為。績效工資實施以收支兩條線和規範津補貼為前提。檢查基層單位在實施績效工資後是否還有以職工福利、差旅費等實物或現金形式變相發放津補貼的情況；檢查單位工會賬戶，是否有不合理大額現金支出；是否嚴格執行收支兩條線管理，有沒有賬外私設小金庫。例如：將工會活動室出租給他人開麻將館，收取定額租金，遇節假日則將租金用來發放職工福利。收取牙科醫療收入不存入財政專戶，滯留單位小金庫以期私分。
四、對績效工資實施效果進行評價
單位在實施績效工資後有沒有調動職工的積極性，有沒有提高醫院診療人次，入出院人次。有沒有提高社區居民或患者的滿意度。審計方法：調取HIS係統數據查詢診療人次和入出院人次數、製作滿意度調查問卷。
五、其他應重點關注的問題
一是查看績效工資核算資料和相關佐證資料是否完整。是否裝訂成冊，妥善保管。二是單位領導和職工是否配合。如單位在接受審計時，領導人員和財務人員、人事幹部等態度暖昧，說話模棱兩可，以不清楚不曉得，資料滅失為由進行搪塞，拒不配合審計檢查，對於這樣的單位十之八九有問題，應重點予以審查。
參考文獻：
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