睡眠除了可以幫助人體消除疲勞，使人產生新的活力外，還與提高免疫力、抵抗疾病的能力有密切關係。這是因為人體的大多數功能都有晝高夜低的運轉規律，而免疫係統則正好相反，呈晝低夜高的運轉狀態。也就是說，隻有在睡眠狀態下，人體的大部分免疫成分的含量才有所增加。免疫係統需要足夠的睡眠才能達到最佳的功能狀態，睡眠不足或睡眠不良都會大大折損我們身體的免疫力。
最常見的例子就是感冒。我們在患上感冒後，會昏沉欲睡，而睡過一會兒後，就感覺好了很多。這就是人的自我保護反應。人體通過睡眠來抑製其他一些功能，突出免疫功能，保護機體。
而一旦身體患上疾病，或出現異常、不適等，都容易導致失眠。尤其是慢性消耗疾病更為明顯，據國外統計資料報告，失眠者中幾乎半數都患有各種精神、神經及內科疾病，其中各種精神障礙占35%，身心疾病占15%，藥物和酒精依賴占12%，周期性肢體運動障礙占12%。這可能與身體疾病削弱大腦皮質的活動導致中樞神經係統抑製過程減弱有關。而更為重要的是疾病引起的身體不適、疼痛、瘙癢和機體代謝障礙，造成患者焦慮不安的心情，使其難以寧靜放鬆，從而出現失眠。比如，關節炎患者很可能難以入睡或因關節疼痛而清醒後不能再入睡；半夜疼痛起來的風濕病患者，雖無難以入睡的情況，卻發生多次疼痛，使得睡眠時間變短；泌尿係統疾病的患者也有同樣的症狀，如尿頻症患者多次產生想如廁的感覺，結果半夜數次起床，而且這種症狀多見於女性、高齡人群和患前列腺肥大的男性。
一般來說，容易引起失眠的疾病如下。
（1）中樞係統疾病：如腦外傷、腦腫瘤、鬆果體瘤、腦血管疾病（腦出血、腦梗死）、帕金森症、老年性癡呆、癲癇等。
（2）呼吸係統疾病：如急慢性支氣管炎、阻塞性肺氣腫、肺心病、肺結核、百日咳等。
（3）泌尿係統疾病：如慢性腎炎、尿毒症、泌尿係統感染等。
（4）消化係統疾病：如潰瘍病、腸炎、痢疾等。
（5）循環係統疾病：如心絞痛、高血壓、心力衰竭、動靜脈炎等。
（6）變態反應性疾病：如皮膚瘙癢、過敏性鼻炎、蕁麻疹等。
另外，伴發失眠的身體疾病還有關節炎、骨關節病、夜間肌陣攣綜合征、甲狀腺功能亢進、肝炎、睡眠呼吸暫停綜合征等等。有這些病的患者最好到專業醫院檢查，進行及時治療。
需要注意的是，在治療高血壓、哮喘、心髒病等常見病時，醫生開的處方中往往有催眠藥，對此應該加以注意，認真詢問醫生。