1.內外對應
蒙醫學認為人體是自然界的縮影，是一個有機的整體，表裏有多種相應關係。這種對應關係包括下列幾點：
（1）身體各部位與髒腑之間特定的對應關係。如“頭者整體之關鍵，喉者舌之關鍵……關節者肢之關鍵，四掌者脂之關鍵，齒者骨骼之關鍵，大拇指者肌之關鍵，陰器者筋之關鍵……”的說法，把相互之間的對應關係表述得非常全麵且具體。
（2）體表器官與髒腑之間特定的對應關係。如：蒙醫學認為，“舌為心髒之關鍵，鼻為肺之關鍵，目為肝之關鍵，唇為脾之關鍵，耳為腎之關鍵”，或“舌為心髒之花，鼻為肺之花，目為肝之花……”，“視舌厚薄長短，可估計心髒之大小……舌薄而長者，其心髒為麻雀胃狀……舌薄而短者，其心髒為近似四方狀……視鼻大小遍股，可估計肺之特性……視目大小寬窄及黑白珠，可知肝知特性……視唇厚薄好惡，可估計脾之狀況……視耳大小高低散卷厚薄，可辨別腎之狀況……”。
（3）顏色變化與髒俯器官之間的特定關係。蒙醫學根據五行學說認為：“白當肺，赤當心，青當肝，黃當脾，黑當腎。”在三大因素方麵：青（或黑）與赫依有關，赫依病人麵部、皮膚、尿等的顏色以青為主要特征，還因赫依依賴於下身，主要位於臍以下，故青（或黑）色也與下身器官有關；黃（或赤）與希日有關，希日病人的麵部、皮膚、尿……以黃（或赤）色為主要特征，因希日依賴於肝膽，主要位於臍以上、心以下的軀體中部，故黃（或赤）也與中部器官有關；白色與巴達幹有關，巴達幹病人的麵部、皮膚、尿等以白色為主要特征，因巴達幹依賴於腦，主要位於心以上、頭部等軀體上部，故白色與軀體上部的組織器官有關。
（4）外在變化與內在變化在趨勢上相對應。如：“尿之泡沫從中央向外擴散者，其病從內走外；從外向中央聚者，其病從外走內……”並根據伊渣瑪嘎沉澱物積聚於尿液上、中、下部的具體情況，可在軀體相對應的上、中、下部找出其病變部位。
2.局部與整體的不同部位相對應
蒙醫的診法原理認為，綜合病人的局部變化，可以測知其整體情況。
（1）脈診
脈診是蒙醫的一種全息診斷方法。其中，男子左寸對應心和小腸，左關方法。診脈的部位和方法在“腕上第一皺紋起，下量一寸突骨（橈骨莖突）內側，對應脾胃，左查克對應腎和散木賽（散木賽棗相當於男女內生殖器官）；右寸對應肺和大腸，右關對應肝膽，右查克對應右腎和膀胱”，女子“左寸對應肺和大腸，右寸對應心和小腸，其餘與男子相同”；“手指按之上角診五髒，下角診六腑”。診脈部位分前、中、後，正好分別對應人體的上、中、下部，也基本上與人體左右兩半相對應。
（2）舌診
舌是一個相對應的部分，《金光注釋集》中說：“舌和尿若同名鏡，疾病就像明鏡裏清楚顯現的影子，故察之可辨清疾病也。”另外還有“舌尖候心肺，舌中候脾胃，舌根候腎，舌邊候肝膽”的分位區診法，後者可能是從中醫理論中吸取過來的。
（3）目診
蒙醫把眼睛當做“肝之花”，其內容為：“內眥外眥候心，黑珠（虹膜）正上方的眼白（鞏膜）候肺，黑珠正下放的眼白候肝，黑珠內下放的眼白候腎，黑珠外下放的眼白候脾胃。”
（4）察耳郭辨病
即：“男孩左耳上部對應心和小腸，左耳中部對應脾胃，左耳下部對應左腎和散木賽，右耳上部對應肺和大腸，右耳中部對應肝膽，右耳下部對應右腎和膀胱……女孩左耳上部對應肺和大腸，右耳上部對應心和小腸，其餘相同。”
（5）頭頂五髒穴
蒙醫認為“頭頂正中為心穴，正中前一寸為脾穴，正中往後一寸為腎穴。”若五髒有病變，其相應穴位有壓痛，其穴位上施以針或灸，即可治對應的髒器之病。
（6）手指
五指指甲與五髒的對應關係是：“大拇指指甲候肺，食指候肝，中指候心，無名指候脾，小拇指候腎……其顏色白者為巴達幹病，全白者為赫依病，全黃者為希日病。”另外，五指背側還布有五髒病放血穴位，即：“大拇指背有心脈，食指背側有肺脈，中指背是脾脈，無名指背是腎脈，小拇指背是肝脈。”或灸五指可治相應髒腑之病，即：“心和大腸之病灸大拇指，肺和大腸之病灸食指，肝膽之病灸中指，脾胃之病灸無名指，腎、散木賽、膀胱之病灸小拇指。”
總之，蒙醫診法是以全息思想為基礎的，是由外象測知本質，由局部測知整體，體現了部分同整體對應，部分是整體的縮影及不同係統之相似性聯係等全息觀點。這與中醫辨病的整體觀從原理上是類似的。