清代之後，對於佛教的政策幾乎是完全繼承明代。清代帝王雖然對喇嘛教十分推崇，但對漢地佛教也極力崇信。世祖順治曾召玉琳國師到京說法，並命選僧1500人受戒，以表示對漢族地區佛教的扶持。
其次，清聖祖康熙和乾隆曾多次出巡常住名山巨刹，並賦詩題字、撰製碑文，表示對佛教的濃厚興趣，還多次派遣官員專程上山向地藏致祭，屢賜重金修繕化城寺，欽賜禦筆匾額。
此後，九華佛教又有了進一步發展。寺廟林立，僧伽雲集。化城寺的寮房增至72家之多，又自稱禪院，各立門戶。僧人多達三四千人之眾，金地藏可謂是身後沙門多似沙了。
1858年，太平軍與清軍激戰於九華山，許多佛寺禪院毀於戰火。戰後，清朝朝廷出於政治需要，扶持佛寺的恢複。光緒年間給甘露寺、百歲宮等寺3次賜予《龍藏》各一部。地主紳商及善男信女競相捐輸，佛寺、精舍修複很快，還陸續出現了一些茅蓬小廟。
隻園寺、東崖寺、百歲宮等大的叢林又恢複了受戒法會、講經法會，開壇講授戒律和《法華經》、《地藏經》等，並刻補經書雕版，印刷發行。各寺都恢複水陸法會等宗教活動。
康熙年間，朝廷派包衣昂邦赫奕、內侍李環、太仆寺少卿格爾芬到九華山進香，賜銀三百兩。次年又賜禦書九華聖境。
旃檀林是化城寺十二寮房之一，由4座廳堂式民居和宮殿式大雄寶殿組合而成。
東為僧房和齋房，敞廳堂，3層樓閣，有內落水小天井。西為雲水堂，敞廳四開間，兩層樓，小天井。僧房和雲水堂之間為前廳，內用板壁隔成彌勒殿和韋馱殿，進深20.5米，殿兩側是兩層樓閣。
韋馱殿前有兩個小雕像，一個是濟顛和尚，一手拿著薄如紙的小酒盅，另一手搖關破芭蕉扇兒，笑盈盈，喜哈哈，手舞足蹈，似酒醉歸來，逍遙自在。另一個是瘋僧，赤足，手揮拂塵，左肋下夾著一把掃帚。
韋馱殿裏，韋馱身著鎧甲，手扶金剛杵，麵對大雄寶殿佛像而立。
彌勒殿裏供西方三聖，又稱阿彌陀三尊，即西方極樂世界的教主、三世佛之一的阿彌陀佛，他有13個名號，是淨土宗的主要信仰對象。加上左邊的觀世音菩薩，右邊的大拋至菩薩，合稱為西方三聖。
從韋馱殿向左，進門又是一幢樓閣，樓上佛堂敞，樓下廳堂高大，古色古香。廳前天井狹長，左右為庫房、僧寮。由韋馱殿向右，進角門穿過樓間小巷，是又一組樓堂。
樓下3間敞廳，屏風後和左右兩端有10間客房，樓前天井，上有巨幅壁畫，為墨龍行雲圖，龍首向下噴水，鯉魚向上跳躍，也稱魚龍變休圖，左右上方還有蘆雁秋景、秋菊傲霜和春蘭、冬梅等小品圖畫。古雅清幽，可供觀賞。
在兩廂樓柱間，有唐玄奘率孫悟空、豬悟能、沙悟淨西天取經的雕像，4人風塵仆仆，遠道而來，各自佇立於廊下一角，好像等待寺中住持和尚出來迎接款待，十分有趣。
穿過一石板鋪地，潔淨如洗的長方形天井，就可達大雄寶殿。大雄寶殿高18米，寬11.5米，深15.5米。仰觀大殿，鐵黑色葫蘆矗立在正脊中間，魚龍尾翹在兩邊。重疊的飛簷，條條魚龍飛來，裝點得八角殿更加壯觀。重簷間，繪著青獅彩鳳。
四周廊柱上，雕有八仙人物像：跛足蹣跚的鐵拐李，腰間葫蘆搖晃；風度翩翩的呂洞賓，瀟灑自如，春風滿麵，袒胸露腹的漢鍾離，須髯飄灑，手搖寶扇；倒騎毛驢的張果老，手擊漁鼓，欲唱一曲道情；身穿官服的曹國舅也趕來檀板輕敲。
還有仙人劉海，喜盈盈地在戲弄金蟾，這些都是道家神仙。
殿前廊下左右鍾鼓高懸，古鍾重在上千千克以上，鎏金大字閃爍有光。廊下和佛幡前有黑底金字楹聯和泥金雕花楹聯。
第一聯說道：
山中做伴莫負煙霞，
林下相逢祗談因果。
又一聯說道：
把臂入林可複有太白聯吟陽明打坐，
現身說法恍然悟新羅月滿南海波澄。
說的是李白遊九華，吟詩聯句。王陽明上九華山，在東崖晏坐，已為陳跡。所說新羅即金地藏，相傳農曆七月十五是其生日，正值月滿。南海指觀音，普陀山為南海觀音道場，與九華山齊名，都謂之菩薩道場。
佛像座前一聯說道：
奉雙親參禮九華，喜今日旃檀林中便是極樂世界；
願一心長持半偈，想當年菩提樹下用何等刻苦功夫。
這是出自在家信佛的居士之手，以示其虔誠。
殿堂正中供奉著釋迦牟尼佛像，兩旁侍立著是阿難、迦葉。兩側是觀音、地藏像，觀音像兩側有金童、玉女，地藏像兩旁有閔公、道明侍立。