由漢奸與“自治會”開設的慰安所在倭寇占領南京初期,，曾一度受到倭寇軍隊的歡迎。但這樣的保密性不夠，倭寇當局對之存疑慮與顧忌，害怕在根子裏怨恨倭寇的中國人，會安排一些假扮服務的女殺手，特別是一些倭寇軍官害怕在這樣的“慰安所”丟掉性命。
南京社會秩序漸漸恢複以後，特別是在倭寇對華實施“新政策”後，倭寇當局收斂一些極易引起中國人民反感的霸道行為。於是,，這類慰安所在南京逐步減少,，或停辦,，或出讓給日僑娼業主經營。漸漸由倭寇軍部直接開辦或委托倭僑娼業主設立慰安所。
之後，倭寇在南京設立慰安所，是由倭寇軍部自行開辦,，更多的則由倭寇軍部的委托，倭僑娼業主在南京擇地設立。慰安婦開始多是軍部從後方征調的東洋、朝籍人,，後來被擄掠來的中國婦女不斷增加。他們以國籍別稱為“日本窯”“高麗窯”“中國窯”。
從南京城南部,，自從夫子廟，到大行宮一帶都是。
由於這一帶是南京最繁華的商業區，又是倭寇當局劃定的東洋僑民聚集的“日人街”所在地,，靠近兵營與許多軍事機關，科巷全是慰安所，二條巷、四條巷、利濟巷、文昌巷都是!
牆上掛著牌子。慰安所裏帖著照片，編號。除了倭寇軍人和東洋人，沒有中國人進去，偶爾也有中國翻譯進去。
“安樂酒店慰安所”：位於太平南路，由倭寇軍部主辦，公開名稱是“軍官俱樂部”。
“鬆下富貴樓慰安所”：位於南京常府街細柳巷福安裏 5 號。40多間房間，除一間辦公, 其餘都是慰安婦的場所。
“青南樓慰安所”，又名“菊水樓慰安所”：位於文昌巷 19 號白菜園大院，在東白菜園與西白菜園的洋房內。
“東雲慰安所”，又名“東方旅館”：位於利濟巷2 號,，原是一個叫楊普慶在戰前建造的高級住宅區“普慶新村”的一座長方形的水泥磚瓦結構的二層樓洋房。這家慰安所裏的慰安婦多是年輕的朝鮮婦女。
“故鄉樓慰安所”：位於利濟巷 18 號。這裏是“普慶新村”的主體部分, 有相同式樣的二層樓洋房 8 幢, 裏麵都是東洋籍慰安婦。
“吾妻樓慰安所”：位於科巷南壽星橋口, 與“東雲慰安所”隔街相望。上書“揚州姑娘”四個大字。
“浪花樓慰安所”：位於中山東路四條巷樹德裏 48 號。
“築紫屋軍食堂”：以“食堂”名義提供性服務的變相慰安所，位於南京市中心洪武路 18 號。“朝日屋軍食堂”, 由原“築紫屋軍食堂”改名“大華樓慰安所”，位於白下路 213 號。
城北部下關一帶因為是南京的交通樞紐、商業集中地區,，下關火車站與長江碼頭又被倭寇軍管, 因而駐防倭寇較多。倭寇當局在這裏設立了多家慰安所，“華月樓慰安所”，“鐵路橋慰安所”，“鶴見慰安所”。下關一帶慰安所有“日華會館慰安所”、“聖安裏 A 所慰安所”、“聖安裏 B 所慰安所”、“東幸升樓慰安所”、“煤炭巷慰安所”等。
此外還有“鼓樓飯店中部慰安所”、“傅厚崗慰安所”、“珠江飯店慰安所”、“滿月慰安所”、“共樂館慰安所”、“皇軍慰安所”、“上軍南部慰安所”、“昭和樓慰安所”、“日支館料理店兼慰安所”、“一二三樓慰安所”、“江浦慰安所”等等。
這些都是後話。