段祺瑞由衷地說：“大總統轁略過人，令人感佩！請問江蘇問題怎麼解決？”袁世凱說：“我想讓程德全當江蘇都督，先把江蘇局麵穩住，再把南京留守處撤銷，讓黃興這個留守處總辦去當漢粵川鐵路總辦，讓他麵子過得去。我給他比總長兩倍的薪俸和辦公費，讓他高興……”段說：“這也太便宜他了！”袁詭密地說：“咳，他美不幾天，早晚收拾他們！”段說：“這樣一來可高枕無憂了。”袁歎道：“唉，說安枕為時尚早啊！你要多負責任。”
1912年3月10日，袁世凱宣誓就職。3天後任命段祺瑞為陸軍總長。這時的他，在國人心目中聲望頗高，許多人發表文章，稱他為“推翻滿清的英雄，締造共和的功臣。”袁世凱對他十分信任，許多軍國大事找他密商。在北洋將領中，他的地位扶搖直上，成為僅次於袁世凱的實權人物。這樣一來，本來就趾高氣揚，目中無人的他，更加不可一世。
這些年來，段祺瑞先後在小站，天津、濟南、保定、北京、清江浦、湖北等地任職，居無定所，飄忽不定，有幾年處境艱危如履薄冰，一直沒有一處像模像樣的家。他嫌西堂子胡同段公館不夠氣派，於是，派得力幹將，把袁世凱送他的府學胡同房產修葺一新。並把最後一進院落加蓋一座三層小樓。段祺瑞上任不久，就舉家遷進新居。
新公館非常寬敞考究，有辦公處，寢室、娛樂室、休閑室、接待處，內號房，外號房，馬房，廚房，花房，裁縫室，理發室，庫房等2百餘間。除夫人，3房姨太太，10多個子女，兒媳及孫男孫女，姑舅甥侄，嫡親外戚外，尚有扈從衛隊，內外聽差，奴婢丫環，各種雜役1百多人。他還把有功於他家的年老聽差，護駕有功的老年傭人供養起來；此外，還有棋手，醫生和詩人。一切花費，龐大開交，全由陸軍部支付。還有，段祺瑞每晚打牌，動輒輸贏幾百上千元，不會自掏腰包。雖然他不似其他軍閥瘋狂聚斂，家裏不置房地產，但他明鑼響鼓地揮霍國家財產，已達驚人程度。
這天上午，段祺瑞一上班就來到袁世凱的辦公處。出於安全考慮，前不久袁世凱把總統府從石大人胡同遷入鐵獅子胡同的陸軍部附近辦公。段祺瑞對秘書口氣強硬地說：“快通報，我要見大總統！”秘書畢恭畢敬地說：“對不起總長，大總統吩咐過，今天不會客。”段祺瑞罵道：“混帳，我不是客！”說著，推開秘書徑往裏闖。還沒進門就高喊：“大總統大總統！”
袁世凱一見段祺瑞趕緊說：“芝泉，坐坐。”段祺瑞說：“大部統的門檻越來越高了，連我都不好進了。”袁世凱向門外喊：“來人！”應聲進來一個貼身衛士，他問，“今天誰當值？”衛士說：“報告大總統，是胡秘書。”袁說：“去，打他20軍棍，交夏壽田裁處！”衛士應命而去。
袁世凱問：“芝泉，你有什麼事？”段祺瑞口氣強硬地說：“我還是希望讓徐樹錚當次長。”袁世凱口氣充滿無奈和反感：“我希望你不要再提這件事了。我已經把你的想法向有關方麵幾次提及，他們一致認為這對一個涉足政壇僅10年的小人物不合適，給他個司長已經很照顧他了，再說，這個職務已經許給蔣作賓，你總要給我留點麵子吧。”
段祺瑞當仁不讓：“我記得大總統說過，你的用人之道是取其忠誠和才幹，這兩點他恰恰都具備！”袁世凱說：“掌管全國軍事大權是參謀部的事，由於參謀總長遠在武漢，由次長陳宦主持工作，陳宦是你的部下和學生，無法跟你分庭撫禮，所以，兩部大權實歸你一人之手，你還嫌不夠嗎？”段說：“正因如此我才更需要他。請大總統考慮。”說罷，也不道別，抬起腳就走。袁世凱也相當激動：“回來！”
段祺瑞毫無懼色，挑戰似地回過身，直挺挺站在袁世凱麵前，兩隻少有變化的死魚眼盯著袁世凱。意思是：“回來又怎樣？”瞬間，袁世凱冷靜下來，無奈地搖搖頭說：“唉，真拿你沒辦法。這樣吧，就讓他當陸軍部參謀長吧。”段祺瑞說：“不妨暫切如此。”
段祺瑞連個謝字也沒有，就匆忙忙走了。袁世凱盯視著他的背影，直到在寬大的活動門後消失，才把目光收回，長長地歎了一口氣……回到陸軍部，段祺瑞馬上把小徐叫來。老段發牢騷道：“老頭子昏了頭，我屢次推薦你做次長，他就是不準，堅持用南方人蔣作賓！”徐樹錚深知疏不間親的道理，故作深明大義地說：“大總統不同意必有他的道理和難處，芝帥且莫為我傷了二公和氣，我幹什麼都好，隻要在芝帥身邊。”段祺瑞高興地說：“難為你這麼懂事。不過，我為你爭得參謀長一職，你先幹著，以後慢慢說。再說，參謀長比次長更重要。”徐樹錚說：“是，這已經不錯了。以後芝帥對大總統不妨講點分寸，別傷了老人家的心。國家能夠安定，北洋能夠團結，反對派之所以不敢公開掣肘，很大程度上取決於二公的團結，您說對嗎？”
段祺瑞由衷地說：“對對，我這人口快心直，胸無城府，脾氣上來不管不顧，所以你多提醒。”徐樹錚說：“不敢，樹錚願為芝帥效犬馬之勞。”段祺瑞說：“我跟大總統親如家人，剛才我態度是不好，回頭我向他道個歉。蔣作賓快來了，你先把他的簡曆跟我說說。”
徐樹錚如數家珍介紹說：“蔣作賓字雨岩，湖北應城人，秀才出身，1903年入武昌普通學堂，1905年春赴日本士官學校步兵科學習，同年加入同盟會，3年後學成回國，在保定軍官學堂任教習。次年調任陸軍部軍學司司長。武昌叛亂後去了九江，任軍政府參謀長，南京臨時政府成立時任陸軍部次長，年僅28歲。是個專會看風使舵投機鑽營的家夥……”蔣作賓要來陸軍部的事鬧得沸沸揚揚，徐樹錚注意到他的簡曆。
段祺瑞罵道：“他媽的，這是個小兒科，資曆很平常嘛，怎麼把老頭子哄轉了。”徐樹錚說：“唐紹儀一再提倡南北合作，要各部多用南方人。我們偏不聽他的，就用自己人！在他上任前把五個司長全部換成自己人，他一個光杆司令說話沒人聽，做事沒人幫，久而久之，不走才怪呢。”段說：“好主意，就這麼辦！”