與皇室矛盾升溫
1581年春，朱翊鈞冷不防地再度提出外戚恩蔭的問題，張居正很是鬱悶。外戚恩蔭的問題，早在兩年前朱翊鈞嶽父封伯時就已解決，此時又被朱翊鈞提出，張居正無法明白這位皇帝小兒的心思。
朱翊鈞這次提出，要把嶽父王偉的弟弟王俊加恩授職。張居正和張四維、申時行商議，商議了大半天，張居正覺得精力不濟，索性就做了心中早想好的主張：授王俊錦衣衛千戶。
可這道票擬才進宮沒多久，朱翊鈞的手詔又到了。張居正被從疲憊的夢中驚醒，聞聽朱翊鈞的手詔：“正德年間，皇親夏助等人，都授錦衣衛指揮使等官世襲，今為何止授王俊千戶？又無世襲字樣？”
顯然，這是極度不滿下的詰問。張居正隻好親自去見朱翊鈞，向他解釋。
張居正說：“對非有軍功的皇親不封爵，不世襲，這是兩年前製定的規矩。當時皇上也是同意的，怎麼如今要自壞規矩呢？”
這話有些不敬，朱翊鈞的火氣冒上來：“張先生，您總說不違祖製，可不世襲就違背了武宗皇帝時的製度，這是違背祖製啊。”
這話充滿了指責的火藥味。張居正不管他，說：“皇上有仁慈之心，加恩外戚，做臣子的當然要照做。”
朱翊鈞想不到事情如此順利，竟一時不知該如何進行下去了。他坐穩了，試探地問：“當真？”
張居正說：“當然！”
“那就擬旨吧。”
很快，張居正的票擬來了：“授王俊錦衣衛指揮使。”
朱翊鈞跳起來，抖著張居正的票擬，向身邊的太監們咆哮：“世襲呢，世襲兩個字呢？！”
張居正又來了，朱翊鈞像是複讀機：“世襲呢？世襲兩個字呢？！”
“錦衣衛指揮使已是最高榮譽，倘若再加世襲二字，恐怕和祖製違背。”這是張居正不緊不慢的回答，他越是這樣氣定神閑，朱翊鈞就越生氣。
“祖製？我不是跟你說了嗎，武宗在位時，外戚的職位就是世襲的。”
張居正仍是一副不溫不火的樣子：“皇上明鑒，祖製並非都是完美無缺的。尤其是武宗皇帝在位時，奸賊小人太多，導致政體紊亂。世宗皇帝繼位後，將一切弊政全部改正，複我祖宗之舊，這才是我們要遵守的祖製。武宗一朝是改變了祖製，我們絕不能將錯就錯，違反祖製。”
朱翊鈞氣得七竅生煙：“張先生為何在升王俊為錦衣衛指揮使之前不說，這個時候又說？”
張居正最近感到朱翊鈞的脾氣越來越大，其實可以換一種說法，朱翊鈞要擺脫束縛的心越來越強！
朱翊鈞的問題正中張居正的計策，他說：“臣認為皇上聰明睿智，正大無私，應該能想明白這件事的利害。官職是公家之物，不可輕易授人。尤其是世襲，和浪費金銀沒有區別。我常和皇上講，浪費可恥，節儉光榮，原因正在此。皇上現在醒悟，也為時不晚。”
朱翊鈞愕然，顯然，張居正把他輕而易舉地繞了進去。在這種時候，他不可能再毫無廉恥地糾纏“世襲”那兩個字了。
如你所知，朱翊鈞不可能心服口服。張居正的話語中毫無誠意，全是詭辯，所以朱翊鈞對張居正的恨就更加濃重。
除了朱翊鈞之外，張居正又和李太後的信仰發生了矛盾。李太後多年來信仰佛教。普通老太太信仰佛教，無非是買個廉價佛珠，每日數珠罷了。但李太後有權有錢，所以信仰起來就非比尋常。1581年夏初，李太後在五台山建大寶塔寺，要內閣票擬。張居正和張四維抱怨說：“李太後真以為錢是大風刮來的嗎？這麼多年，咱們披肝瀝膽，星夜奔馳，才積攢了這麼點錢，都被她拿去建寺廟了。那玩意兒有什麼用？”
施舍，要是做看得見的功德，不但向和尚的寺廟裏捐錢，還給普通百姓捐款，這是張居正可以容忍的，但建各種毫無必要的寺廟，張居正卻很有意見。
他如數家珍道：“萬曆二年建承恩寺、海會寺，三年修東嶽廟，四年建慈壽寺，五年建萬壽寺。這些寺廟有何用？無非是慫恿更多的懶惰之人看到不勞而獲的希望，進寺廟出家而已。”
這是宗教問題，張居正堂堂大言，一語道破，讓張四維和申時行很是欽佩。欽佩是欽佩，申時行卻說出問題的關鍵：“那大寶塔寺的問題……”
張居正沉思起來，他想起萬曆元年的一件事。當時李太後對朱翊鈞說要建涿州胡馬河、巨馬河兩條大橋。朱翊鈞對張居正說了這件事，張居正立即反對說：“皇上繼位之初，應與民休息，建橋太勞民，而且耗錢，恐怕有關部門不會辦理。”
朱翊鈞若有所思。幾天後，他對張居正說：“母後說了，一切花銷都由母後來，一錢不取於官，一夫不取於民。”