出現衝突時，不可采取過激的行為，否則，矛盾就會激化，達到不可化解的地步。
庫克要去社會群島。由於風向不對。考察隊被迫調頭朝東，駛向湯加群島。在到達湯加群島之前，他們發觀了兩座小島——芒艾亞島和阿蒂烏島。這兩座島嶼屬於後來稱作庫克群島的小島群。
3.波利尼西亞人被激怒了
“決心”號和“發現”號於4月30日到達湯加群島。他們一直呆到7月中旬，主要是作為該群島極有權勢的酋長之一保拉霍的客人，在湯加群島中最大的湯加塔布島訪問。情況表明，同土著人的貿易富有成果。他們在岸上買到了一些牲畜，島民們也學到了牲畜飼養的技能。
但是，沒過多久，島民與來訪者的關係便陷入僵局。像往常一佯，偷盜成了一件讓人惱火的事。在湯加塔布島上，庫克不再像以往那樣對這種事情持容忍態度，他開始對島民的這種有害行為做出反應。以前，庫克總是超然物外，從人類學角度看待波利後西亞人的這種行為。如果被偷走的東西確有價值，他就派人拿回來。僅此而已。如果那個壞蛋拒絕歸還所偷的物品，庫克便將其財產（通常是獨木舟）沒收，保留到被偷的物品送回來為止。實在不行，這位船長就把一位有影響的島民請到船上充作人質，島民們什麼時候把偷走的東西送來，就讓他什麼時候回去。
但是，庫克現在開始訴諸於體罰了。他下令鞭打一名偷東西的島民。在偷盜繼續發生的時候，庫克親自用搶打傷一位島民。他還在另一位島民向一位海軍士兵投擲石塊後下令在他的胳膊上刻上十字，以示懲罰。後來，在考察隊離開湯加塔布島時，出現了非常緊張的局麵。8月中旬，考察隊來到社會群島，送回馬伊，而這種擾亂人心的活動在那裏繼續出現。在那裏，庫克曾把偷盜東西的島民剃成光頭，以示懲戒。考察隊的幾隻山羊不見了，這位船長派海軍士兵衝進幾座村莊，毀小船，燒房屋，打死公豬。但是，這些行動並沒有嚇倒波利尼西亞人，反而激怒了他們，使他們更加仇恨這些外國人。緊張局勢步步升級，到兩船於12月駛離杜會群島時，盡管遭到許多軍官的抗議，庫克仍然莫名其妙地采取了極端的行動，在幾個島民已經認罪的情況下，仍然割掉了他們的耳朵。
應當說，庫克之所以在第三次航行期間對島民們做出這類舉動，是由於他正受到疾病的折磨，而不是由於道德淪喪或性格缺陷所導致。這個時期的庫克已非原來那個庫克；在第三次航行期間，他同船員與乘客的關係非常緊張。他脾氣暴躁是盡人皆知的，隻是當時發脾氣比以往更頻繁。這位船長顯然是狀況不佳。某些與島民們司空見慣的行為無關的事情正困擾著他。庫克的傳記作者林恩·威西認為，當時這位船長正患有維生素缺乏症，是在第二次航行期間給他造成不少麻煩的消化係統疾病帶來的後果。其症狀包括壓抑、煩躁、氣惱，乃至偏執。不管原因如何，有一點似乎是肯定的：庫克可能把自己逼得太狠了；就像漏水的“決心”號，成年累月的海上奔波己經影響到他的身心健康。
不管後來的人怎樣替庫克解釋，但他犯下的錯誤隻能由他自己承擔。我們不能把超負荷的工作帶來的壓抑、煩躁、氣惱，乃至偏執造成了惡果由別人承擔。