科學必然戰勝迷信，誹謗、攻擊隻是一小撮居心不良的小醜玩弄的伎倆。天花繼續泛濫，種過牛痘的人卻安然無恙，種牛痘能預防天花已成為抹煞不了的事實。當那些求神、禱告的人們得不到上帝的保佑時，便自動向這位偉大的發現者求救。而那些造謠誹謗者麵臨天花威脅的時候，也隻好偃旗息鼓，誠惶誠恐地接受牛痘的接種。
因患天花而得救的人，僅就英國來說，每年達四萬五千餘人。
在大量的事實麵前，英國政府終於承認了詹納的研究成果。1802年，英國國會以一萬英鎊獎勵詹納的偉大發現，1806年又獎給了兩萬英鎊。俄國皇帝贈送給他一個寶石戒指作為紀念。詹納把一部分獎金為第一個接受他種牛痘的孩子蓋了一幢房子，並親手在房前種了薔薇花。但他還是拒絕到英國政府去當官，仍在故鄉當鄉村醫生。
詹納的著作先後被譯成法、德、西班牙、俄、中等國家的文字，種牛痘免疫在世界各地廣泛應用。
1823年，詹納在七十四歲時與世長辭了。為了紀念這位平凡而又偉大的鄉村醫生，1857年的5月14日，也就是詹納1796年第一次給小菲普士接種的日子，在倫敦舉行了詹納紀念像的揭幕式，雕塑家精心製作了一座詹納為菲普士接種的雕像。他的碑銘上寫著：向母親、孩子、人民的英雄致敬！從此，人們為紀念詹納的偉大貢獻，把每年的5月14日定為“種痘節”。
人們與天花這一嚴重危害人類健康和生命的傳染病作了長期不懈的鬥爭，終於迎來了天花在世界上絕跡的一天——1980年世界衛生組織宣布天花已在全世界被消滅，這是人類消滅的唯一傳染病。