奇怪的是，大約在公元前1500年前後，克裏特島上所有的城市，突然在同一時間全部被毀壞了，不久，這個古老的海上霸國便從地球上永遠地消失了。
1967年，美國考古學家揭開了這個謎。
在克裏特島以北約130公裏，有一座桑托林火山島。桑托林火山海拔僅566米，20世紀中有過3次小規模的噴發，遠不能與維蘇威火山相比，它的寧靜使島上居民祖祖輩輩感到很安全。當美國人在島上60多米厚的火山灰下挖出了一座古代商業城市時，才令世人改變了對它的看法。
研究證明，這是人類曆史上最猛烈的一次火山爆發。那是在公元前1500年前後，桑托林火山噴出的火山灰渣多達62．5平方公裏，島上的城市幾乎在一瞬間就被埋在厚厚的火山灰下。直衝天際的火山灰彌漫在空中，覆蓋了地中海東部地區。據記載，當時埃及的上空曾出現3天漆黑一片的情景。火山爆發引起了巨大的海嘯，浪頭的高度達50米，這滔天的巨浪滾滾南下，很快便來到克裏特島，摧毀了島上的城市、村莊和沃土良田，船隻被狂濤擊碎，米諾斯無敵的艦隊頃刻間化為烏有。
就這樣，一次火山大爆發毀滅了一個古老的文明社會。克裏特王國被人們遺忘了，隻留下了一些莫名其妙的傳說。克裏特文化的興亡，至今仍是考古學中令人費解的難題之一，它的神秘麵紗遠遠未被完全揭開。