由於煉丹家從很早的時代起便研究水銀的變化，他們對水銀的其他化合物也是有研究的。例如唐人煉丹著作《太清石壁記》有“造水銀霜法”（水銀霜就是升汞或氯化亞汞）：先把水銀和錫以不同溫度分別加熱，使成錫汞齊，然後搗碎加鹽，和以太陰玄精（氯化鎂）、敦煌礬石（粗石膏）或絳礬（含鐵粗石膏），用樸硝末（硫酸鈉）覆在上麵，加熱七晝夜。我們現在看來，汞和氯化鈉、硫酸鈉共熱是能生成氯化汞的，氯化汞和多餘的汞再起作用，就會生成氯化亞汞。這個方法很複雜，後世生產水銀霜的方法已經比較簡單了。
關於汞和其他金屬形成汞齊的作用，古人在煉丹實踐中早就注意到了。魏伯陽所謂“卒得金華，轉而相親，化為白液，凝而至堅”，說的就是汞的這種作用。他們製成的汞合金，除錫汞齊以外，還有金、銀、鉛等金屬的汞齊。劉安的《淮南子·修務訓》說，“明鏡”要“粉以玄錫”，“玄錫”就是鉛汞齊，古時用作製銅鏡時候的拋光劑。南北朝時期的陶弘景說：水銀“能消化金、銀使成泥，人以鍍物也。”這說明製作金銀汞齊的方法在南北朝的時候已經普遍用於生產。宋人《諸家神品丹法》中有“化庚粉法”，就是利用金汞齊製造金粉的方法：先製成金汞齊，再加入食鹽，然後蒸發掉水銀，溶掉食鹽，留下來的就是粉末狀的黃金。宋人《感氣十六轉金丹》書中有“十四轉紫河車法”：丹砂四兩，雄黃四兩，生汞二兩，同研成粉末，在丹爐中密閉加熱六十日，就成所謂“紫河車”。用少許紫河車可以“幹汞一兩，其色轉黃”。有人這樣解釋這一反應：三種藥物加熱以後可能形成一種紅褐色的固體溶液（紫河車），取少量這種固體溶液加入水銀中，可能又使水銀變成一種黃色固體溶液。不難理解，古代煉丹家研究汞的這種反應，也是為了尋求一種能“點”水銀成黃金的“神丹”。在當時的條件下，他們這種想法是不能實現的，但是他們的實踐卻擴大了人類對自然現象的認識。
金屬鉛和它的化合物在我國出現很早，我國勞動人民大約在漢代以前已經在製造化妝用的胡粉，就是堿式碳酸鉛（胡粉是糊麵的粉，不是胡人的粉，見漢劉熙：《釋名》）。“胡粉投火中，色壞還為鉛”（《周易參同契》），這種變化引起了煉丹家的注意，把它當作重要研究對象之一。他們除用鉛製造鉛汞齊外，還用它製備黃丹，就是四氧化三鉛。《抱樸子·黃白篇》說：“鉛性白也，而赤之以為丹；丹性赤也，而白之而為鉛。”這是說鉛不止用來製作白色的胡粉，而且還可以用來製作赤色的黃丹，把黃丹投入火中，也一樣會“色壞還為鉛”。比較晚的煉丹家對鉛的化合物還有許多研究，例如唐代清虛子的《鉛汞甲庚至寶集成》中有“造丹法”，用鉛、硫、硝三種物質經過溶化和“點醋”等手續，可以製得一種叫作“黃丹胡粉”的粉末，可能是不純的醋酸鉛。
“金性不敗朽，胡為萬物寶。”（《周易參同契》）煉丹家認為服用金銀礦物等“不敗朽”的東西，可以使人的血肉之軀也同樣“不敗朽”，因此他們不僅要設法服用這些東西，還要用人工方法煉製藥用的金、銀。從漢朝的劉徹、劉安開始，許多帝王將相豪門貴族都曾經招致煉丹家替他們煉金。這一目的在那時是不可能實現的，但是他們在勞動人民生產經驗的基礎上，在冶金方麵的確有不少發明創造。葛洪在《抱樸子·黃白篇》中說，在他的時代，煉丹家有《神仙經·黃白之方》二十五卷，共一千多首方子；另外還有《黃白中經》等書，講的都是煉“金”、“銀”的方法，就是所謂“黃白術”。他還提到錫、鉛、汞等可以用藥物化為“金”、“銀”，說明晉代煉丹家已經能利用各種賤金屬製成各種黃色或白色的合金。南北朝時期陶弘景在《名醫別錄》中說，雄黃“得銅可作金”，說明那時煉丹家已知利用含砷礦物煉製銅砷合金。到唐、五代時期，據《寶藏論》所載，當時市麵上曾經流行假金十五種，假銀十二種，都是用藥物“點”、“化”而成。這種煉金活動在我國古代曾經盛極一時，直到宋代還沒有結束，宋真宗趙恒（968～1022年）就曾命方士王捷替他用鐵煉製“鴉觜金”，鑄成“金”龜、“金”牌賜給近臣。
煉丹家對於硫磺、砒霜等具有“猛毒”的金石藥，在使用之前要先用燒灼的方法“伏”（馴服）一下，使它們失去或減少原有的毒性，這種手續叫做“伏火”。“伏火”法起源很早，方法有時隻用火煆燒，有時另加其他易燃的藥物。唐初孫思邈（581～682年）有“伏硫磺法”：硫磺、硝石各二兩，研成粉末放石鍋中，用皂角（含碳）三個引火，使硫和硝起火燃燒，火熄後再用生熟木炭三斤來拌炒，到炭消三分之一為止。唐憲宗元和年間（778～820年），煉丹家清虛子有“伏火礬法”，所用藥物是硝石、硫磺各二兩，馬兜鈴（含碳）三錢半，和孫思邈“伏硫磺法”用藥幾乎完全相同。伏火的方子都含有碳素，而且伏硫磺要加硝石，伏硝石要加硫磺，可見煉丹家是有意使藥物容易起火燃燒，以去掉它們的“猛毒”的；不過現在從化學上看，這種處理手續的目的是不很明確的。但是，由於經常因給藥物“伏火”而引起丹房失火的事故，卻使唐代煉丹家取得一項重要經驗，就是硫、硝、炭三種物質可以構成一種“火藥”。大約在晚唐時候，這一配方已由煉丹家轉入軍事家之手，這就是我國古代四大發明之一的黑色火藥。