第一節 機構設置
1986年，縣人民政府設立42個局級機構，包括市政府辦公室、計劃委員會、物資局、信訪辦、統計局、物價局、 科委、民政局、城鄉建設環境保護局、勞動人事局、農牧漁業局、林業局、水利電力局、經濟委員會、二輕局、交通局、鄉鎮企業局、財政局、稅務局、糧食局、商 業局、審計局、工商局、對外經濟合作辦、教育局、文化局、廣播電視局、衛生局、公安局、司法局、計生委、檔案局、標準計量局、老建辦、土地管理局、外事辦 僑務辦和紀念館、水保辦、農機服務公司、縣誌辦、體育運動委員會、供銷社等部門單位。
1987年，成立經濟體製改革辦公室，農機服務 公司更名為農業機械化管理局。1988年，組建監察局，為政府組成部門。1990年成立甘蔗生產辦公室，為正局級事業單位。1991年，成立房地產管理 局、對外經濟貿易局（對外經濟貿易局與對外貿易公司兩塊牌子一套人馬）。1992年，成立招商局，與外經辦、外貿公司合署辦公；成立旅遊局，與外事僑務辦 合署辦公；成立水土保持局，與水保辦合署辦公；標準計量局更名為技術監督局。1993年，成立果業局。1994年，成立地質礦產局、地方稅務局。1996 年，撤銷經濟委員會，組建經濟貿易委員會；撤銷城鄉建設環境保護局，組建建設局、環境保護局；勞動人事局更名為人事勞動局，農牧漁業局更名為農業局，教育 局更名為教育委員會，農村經濟委員會更名為農村工作辦公室，對外經濟貿易局更名為對外貿易合作局，外事、僑務辦、體改委、城管辦歸口政府辦；技術監督局歸 口經貿委，老建辦歸口民政局，信訪辦歸口市委辦；檔案局、旅遊局、廣電局、水保局、農機局、果業局、房管局、二輕局改為事業單位，賦予行政管理職能；物資 局、商業局轉為事業單位，實行企業化管理；地質礦產局改為政府工作部門。1998年，西城區建設管理委員會辦公室改為政府直屬事業單位。同年，撤銷水利電 力局，成立水務局；工商局收編歸省管。2000年，地稅局、技術監督局收編省管；成立支援鐵路建設辦公室，掛靠計劃委員會。是年，市政府工作部門包括市政 府辦公室、計劃委員會、經濟貿易委員會、計劃生育委員會、教育委員會、科學技術委員會、體育運動委員會、農村工作辦公室、人事勞動局、機構編製委員會辦公 室、公安局、司法局、民政局、財政局、審計局、物價局、統計局、建設局、環境保護局、土地管理局、地質礦產局、農業局、林業局、水務局、鄉鎮企業管理局、 交通局、糧食局、對外貿易經濟合作局、文化局、衛生局。城市管理辦公室、外事僑務辦公室、經濟體製改革委員會歸口政府辦；革命老根據地建設委員會辦公室歸 口民政局；檔案局、廣播電視局、房地產管理局、果業局、農業機械管理局、物資局、商業局、二輕局、供銷合作社、水土保持局、地方誌辦公室、旅遊局、中央革 命根據地紀念館等為市政府直屬事業單位；駐北京辦事處、駐廈門辦事處、駐南昌辦事處、駐上海辦事處、駐溫州辦事處為市政府派出機構。
第二節 製度建設
1992年，瑞金縣人民政府製定實施《瑞金縣人民政府工作規則》，對縣人民政府各項工作實行製度化管理。
一、會議製度
縣政府實行全體會議、常務會議和縣長辦公會議等製度，縣政府工作中的重大問題，必須經縣政府全體會議或縣政府常務會議決定。
（一）縣政府全體會議由縣長、副縣長、縣長助理、調研員、辦公室主任和各組成部門正職組成，由縣長或縣長委托常務副縣長召集，必要時，吸收各工作部門正 職、各組成部門副職或各鄉（鎮、場）長列席。原則上每半年召開一次。會議的主要內容是：（1）傳達貫徹上級黨政的指示、決定及工作部署；（2）決定和部署 縣政府的重要工作；（3）報告縣政府的工作；（4）通報全縣政治經濟情況，協調各部門工作；（5）討論通過按法律規定需要由縣政府全體會議決定的事項。