盡管是有驚無險，張居正和初幼嘉兩人還是不願再連累何心隱等人，決意告辭南都，潛回荊州。何心隱堅決不允，聲稱南都諸門盤查甚嚴，加之新明朝廷已將他們畫影造形，發下海捕文書，著令江南諸省府州縣偵緝捉拿他們，而湖廣省自巡撫牛君儒、布政使雷澤清反戈一擊之後，已落入新明朝廷之手，想必剛剛升任巡撫的雷澤清正在大肆搜捕與顧璘有來往的官紳士子，他二人此時出京回鄉無異於自投羅網，讓他們稍安勿燥，容他再想周全之策。
經過反複商議，何心隱於次日上疏監國益王，以無辜蒙冤被搜查居所，玷汙官箴、侮辱斯文為名，請求辭官歸鄉。在益王溫言慰留和其師史夢澤好意規勸之下，何心隱才收回了辭呈，但自請改任外官，或州判或縣令皆可。益王疑惑不解，追問其故。何心隱泣然奏對，坦然承認自己不願與那些勳臣貴戚同列朝班，而且也擔心那些勳臣貴戚再尋釁生事，懇請外任是為避禍。益王黯然不語，史夢澤雖厲聲斥責何心隱出言無狀，不該以小人之心妄加猜度朝廷依為泰山的社稷重臣，但心裏也擔心那些勳臣貴戚不會放過自己這個生性耿直狷狂的門生，便建議益王命何心隱以兵科給事中的身份巡按徐州，一是暫避風頭，二來也可借此機會視察前線靖難之軍的戰備情況，看是否如同那幫手握兵權的勳臣貴戚所說的那樣“厲兵秣馬、枕戈待旦”。益王也正想了解前線的真實情況，便同意由忠實可靠的何心隱出巡徐州。
半年遊曆南都的經曆恍如一夢，其間也曾有過歡笑，有過激昂，但更多的，卻是不堪回首的夢魘，不但是張居正和初幼嘉兩人，就連如今正在得寵的何心隱也萌生了激流勇退之意，但辭官歸鄉未蒙恩準，也隻能退而求其次，將兩位朋友遠遠地送出南都再說，故慷慨接受了新的任命。
因蔡益沒有自何心隱家中搜出張居正和初幼嘉兩位欽犯，朝中正在得寵的江西籍官員對他們尋釁滋事多有非議，攻訐他們“奪威福自用”的彈章奏本無時不有，魏國公徐弘君等勳臣貴戚也不敢從中作梗，再生事端，不但為何心隱安排了遠遠超出其官秩所配享有的禮製規格的官船和護衛，還在石城門外碼頭的接官廳為他舉行了盛大的餞別儀式。
兵亂之後，何心隱擔心張居正和初幼嘉兩人太過傷悲，一直不敢告訴他們顧璘自焚而死，屍骨蕩然無存的消息。因此，臨別南都之前，他們提出要冒死為顧璘收殮骸骨。何心隱百般勸說也無濟於事，不得不提出以拜謁太祖高皇帝朱元璋的孝陵代替那樣冒險的舉動。
這一提議無疑是最合理且不容反對的。孝陵埋葬著開國之君太祖高皇帝朱元璋及他的皇後馬氏，近兩百年來，一直是大明王朝赫赫功業的象征，以其不朽的光榮，在臣民百姓心目中享有至高無上的地位。時至今日，大明王朝早已度過了它欣欣向榮、蓬勃發展的前期，進入了積弊橫生、變亂頻仍的中平守成之期，昔日無比強盛的大明王朝已成為一個支離破碎的舊夢。尤其是在北虜南倭當今垂治理九重的嘉靖皇帝又一意孤行，推行玷汙禮教、**士林的新政，在張居正和初幼嘉這般的青年士子看來，安眠著太祖高皇帝的孝陵才是綱常大義、祖宗成法的象征，他們應該也必須前去瞻仰朝拜，獻上大明忠臣諍子的一片耿耿孤忠；同時，祈求太祖高皇帝的在天之靈能為他們指點迷津，保佑他們為風雨飄搖的家國社稷找到一條救亡圖存、再造中興的康莊大道……
於是，在辭別了前來送行的官員士人之後，何心隱便命官船暫泊於碼頭，換乘車駕，帶著隨從打扮的張居正和初幼嘉兩人，匆匆來到坐落在紫金山南麓獨龍阜玩珠峰下的孝陵。
穿過巨大的孝陵牌坊，走到那塊鐫刻著“諸司官員下馬”六個大字的石碑前，三人下了車駕，肅整了衣冠，帶著香燭祭品，沿著神道向裏走去。
那條神道極其寬闊，可供十匹馬並轡而行，或是三十二人抬的皇帝步輦通行，筆直地向著西北方向延伸而去，兩旁是參天的古柏和合抱的巨鬆，鬱鬱蒼蒼，遮天避日，將神道的氣氛烘托得格外莊嚴肅穆。而在下馬牌坊的百步之外，矗立著一座紅磚黃瓦的門樓，這便是孝陵的正門——大金門。
到了這裏，便進入了孝陵的範圍。為了確保太祖陵寢的絕對安寧，防止任何外來的紛擾打攪了這裏的肅穆和寧靜，不但沿著陵園修建著一道綿延四十餘裏的紅色皇牆，將孝陵封閉其中；陵園內還駐紮著重兵，嚴密防衛並時時巡邏。因此，當他們一行三人才行出幾十步之遙，還未接近大金門，就被一隊頂盔貫甲、手持刀槍的守陵軍校喝令止步了。