丹朱徹底被孤立起來，隻得再次回到自己的封地，虞舜開始登上王位。順利登上王位之後，舜帝告慰上天，祭祀天地四時和一眾山神。然後協調了春夏秋冬四時的月份，並確定天數，製定了公侯伯子男朝聘的禮節。在四嶽的舉薦之下，禹開始登上舜曾經的位置，管理百官。舜帝給在治水中同樣立了大功的棄、契、皋陶和伯益也分別封了大官，棄被任命為主管農業的官，大致相當於後世的戶部尚書，現在的農業部長兼財政部長；契被任命為教導開化民眾的官，大致相當於後世的禮部尚書，現在的教育部長兼外交部長；皋陶被任命為主管刑罰和征戰的官，大致相當於後世的刑部尚書兼兵部尚書，現在的司法部長兼國防部長；伯益被任命為掌管樹林、草地和鳥獸的官，大致相當於現在的國土資源部長兼牧業部長。除了封官，舜帝還分別賜給了他們爵位和封地。其他一同被任命的官員還有垂、伯夷、夔、龍等等，垂被任命為掌管百工的官，大致相當於後世的工部尚書，現在的工業部長，伯夷被任命為專職祭祀鬼神、與天地溝通的禮官，夔做了樂官，龍做了言官，大致相當於後世的禦史等等。據說一共封了二十二個人做官，封完官之後，舜帝還給了三苗很多優厚的政治待遇和經濟利益。做完這些之後，舜帝開始像帝堯一樣，到各處巡視。
在虞舜執掌權力期間，還有一件非常有意思的事情，那就是改變了對於犯了罪的人的懲罰手段，不再使用刑罰。根據相關記載，新的懲罰犯人的方式有兩個，一是流放，二是讓他們用一定數量的銅來抵消罪過。要知道在那個時期，銅是極其罕見和稀缺的資源，不管是哪一個氏族都不可能擁有非常多的銅，更不要說拿銅來抵罪了，所以虞舜的這一項舉措非常值得我們注意。我們是不是可以把兩種方式綜合起來理解，那就是虞舜下令將犯了罪的人送到某一處礦山挖礦，用挖出來的礦石來抵消罪過。至於虞舜為什麼這麼做，難不成虞舜是個愛財之人嗎？筆者隻能說這種懲罰方式非常重要，也是形勢所逼，至於具體情況，我們將在下一章進行詳細分析。
舜帝繼位之後，麵臨了和帝堯同樣的一個問題，那就是王位傳子。但是在當時的情況之下，即便是舜帝擁有高超的政治手段，舜帝王位傳子的意圖依然是沒有實現。原因與帝堯時期一樣，那就是四嶽以及眾多其他大氏族首領的反對。在四嶽及一眾氏族首領的堅持下，禹作為王位接班人及早就被定了下來，麵對這樣的形勢，舜帝與帝堯一樣無力改變。舜帝想要傳位的兒子名叫商均，大致是因為同樣的命運，據說商均後來和丹朱還成了非常要好的朋友。同樣是王位傳子沒有獲得成功，舜帝與帝堯最終的結局卻是不一樣的，帝堯被虞舜軟禁了二十多年。
作為帝堯晚年不幸遭遇的始作俑者，舜帝這種非人的日子不好熬，於是舜帝在最後一次巡視天下之後，就沒有再回王城。舜帝一路來到了九嶷山，這裏是他的弟弟象的封地，舜帝希望能夠在這裏終老。雖然在年輕的時候，象因為嫉妒而排擠欺壓舜，但是在舜手握權力之後，不僅沒有懲罰和排擠象，反而賜予象爵位和封地。曾經的種種恩怨早已經散去，舜與象之間也早已經冰釋前嫌，如今舜帝陷入了困境，象也並沒有對舜袖手旁觀，更沒有因為利益而與舜帝撇清關係，而是盡力贍養舜，讓自己的哥哥能夠安度晚年。舜葬去世之後，葬在了蒼梧，象一手為自己的哥哥操持葬禮，而且堅持給哥哥守墓。對於舜帝來說，晚年還有一件遺憾的事情，那就是一直沒有獲得娥皇女英二位妃子的諒解，一直到去世都沒有再見到二位妃子一麵。