從“共和”走向“專製”
雖然馬雲基本完成了從雅虎的“贖身”，但隨著從雅虎回購的股權被注銷，原本作為第二大股東軟銀的持股比例相對上升，成為持股34.4%的第一大股東，同時，由於回購雅虎所持股權過程中，同樣引進了大量第三方股東，及至IPO前夕，馬雲團隊合計的持股比例僅為13%左右。為了實現馬雲等少數股東對企業的控製，他炮製出了一個“合夥人製度”。
阿裏這個曾經被香港證監會拒之門外的“合夥人製度”，隨著其赴美IPO文件的公布而徹底浮出水麵。
“合夥人製”——創新or倒退？
招股書稱，自創始人們1999年首次聚集在馬雲家中起，他們以及集團管理層一直秉承合夥人精神來運營和管理公司。2010年7月，為了保證公司的使命、願景和價值觀的可持續性，阿裏巴巴決定將這一合夥人製度正式命名為“湖畔合夥人”，或稱為“阿裏巴巴合夥人”。
目前，阿裏的合夥人由28名成員組成，包括22位阿裏集團管理層成員以及6位關聯公司及附屬公司的管理層成員。招股書並未披露這28位合夥人的具體名字，僅僅表示，阿裏巴巴的合夥人成員是一個動態的組成。
合夥人的提名與選舉。現有合夥人可以提名新的合夥人，不過需要現有合夥人以一人一票的方式獲得四分之三多數通過方可。新合夥人獲得提名的基本條件是：高標準的個人操守；在阿裏集團或關聯公司任職至少5年；擁有突出的業績貢獻；高度認同公司文化，願意為公司使命、願景和價值觀竭盡全力。此外，為了使得合夥人的行為與公司股東利益保持一致，合夥人任職期間需要持有一定數量的公司股票。
合夥人的退出與罷免。馬雲與蔡崇信為永久合夥人，其他合夥人成員則在其離職或者退休時，自動失去合夥人資格。現有合夥人中（包括馬雲與蔡崇信），如果遭到半數現有合夥人投票罷免，同樣也將失去合夥人資格。
合夥人的董事提名權。IPO之後，阿裏集團的董事會成員將從目前的4人增加至9人，而馬雲控製的阿裏合夥人將獲得其中5席的提名權。合夥人通過投票以簡單多數的方式選舉出董事候選人，如果阿裏合夥人提名的某一董事候選人未獲得股東大會通過或者中途離任，合夥人有權委任另一名臨時董事，直到下一年股東大會召開。關於合夥人對董事提名權的規定，在IPO之後將寫入阿裏集團的公司章程。而要修改公司章程中關於合夥人提名董事的條款，需獲得全體股東95%通過方可。
阿裏的招股書披露，馬雲持股8.9%，蔡崇信持股3.6%，其餘聯合創始人持股比例皆低於1%，按此計算馬雲團隊合計持股比例大約為13%。而阿裏的最大股東軟銀持股比例高達34.4%，第二大股東雅虎持股22.6%，二者合計占股高達57%。通過合夥人製度及合夥人擁有的超半數董事提名權，馬雲團隊僅僅依托13%左右的股權，即實現了對董事會的絕對控製。
額外的控製權保障
不僅如此，馬雲在此基礎上還額外加了兩道保險——與雅虎及軟銀的股東協議以及與中投等投資人的股東協議。
根據招股書，在阿裏集團IPO完成時，公司將同馬雲、蔡崇信、軟銀以及雅虎簽訂一項投票權協議。該協議將保證軟銀有特定的信息權，並有權向董事會提名一位董事。當軟銀持股低於15%時，其提名權將終止。
此外，軟銀還同意：1）在每年的年度股東大會上投票讚同阿裏合夥人的董事提名人選；2）在沒有和馬雲及蔡崇信取得一致意見的情況下，不罷免任何阿裏合夥人提名的董事；3）將所持股份超過總股本30%部分的投票權授出，以支持馬雲及蔡崇信的投票。
而馬雲和蔡崇信也將在每年的年度股東大會上，用其所擁有的投票權支持軟銀的董事候選人當選。