太宗則總忍不住隨時要突出李泰，他甚至作出了一項令人震驚的決定，讓李泰由延康裏遷居武德殿。武德殿在太極殿東邊，緊鄰東宮，是太極宮的重要宮殿之一，隋時修建，隋文帝楊堅曾在此殿大會群臣，宣布廢太子楊勇為庶人。隋末義寧元年（617年），李淵率軍入長安，立楊侑為恭帝，自任大丞相，丞相府即設在此殿。唐初，齊王元吉亦曾居此殿後院。現讓李泰住在這裏，難免不使人頓生疑雲。魏征遂立即上書道：“陛下您愛魏王，常想讓他平安無事，應當隨時抑止他的驕橫奢侈，不要住在這遭人嫌疑的地方。現遷居這武德殿，就在東宮的西邊，從前齊王（元吉）曾經住過，當時人們就認為不適合，現在雖然時間不同事情也不一樣，然而魏王的心恐怕也不敢安逸吧！”太宗這才意識到問題嚴重，馬上讓李泰搬回延康裏。
對同一個人，為同一件事，魏征多次進言，曆時數年，這是不曾有過的，足見這事的繁難，也反映了太宗在廢立太子問題上的矛盾心態，久久不能決斷，故而一再反複，一再試探。但魏征在同僚的支持下，不斷進諫，終於使太宗心回意轉。這時太宗自己也發現，由於他對李泰的偏愛，使承乾與李泰的關係迅速惡化。一方麵是李泰積極活動，他引妹夫駙馬都尉柴令武、右衛將軍房遺愛（房玄齡之子）為心腹，黃門侍郎韋挺（前曾侍太子李建成）、工部尚書杜楚客（杜如晦之弟）相繼代理府事，積極為自己策劃，連結朝臣，大肆賄賂，群臣交相依附李泰；另一方麵承乾也采取相應措施，派人上書密告，揭發李泰罪行，乃至收買刺客，準備暗殺李泰。隨著李泰與承乾的矛盾加劇，朝中大臣也因有的支持李泰，有的支持承乾而開始分裂。
眼見事態不妙，貞觀十六年（642年）八月，太宗問侍臣：“當今國家什麼事情最緊急？”諫議大夫褚遂良立即說：“現在天下沒有什麼值得憂慮的，隻有太子、諸王必須明確他們的身份、地位之事最為緊急。”看來太宗也意識到他不能再偏袒李泰了，當即表態道：“這話很正確。”當時太子承乾行為不檢點，太宗說：“當今群臣，忠誠正直沒人能超過魏征，我派他去做太子的師傅，用這來杜絕天下人的懷疑。”九月，任魏征為太子太師，其時魏征已重病在身，待稍好一點，他去朝廷上表辭謝，太宗親筆詔書道：“周幽王、晉獻公，廢嫡立庶，危國亡家。漢高祖幾乎廢太子，依靠四皓輔佐然後平安無事。我現在依靠你，也是這個意思。知道你有病，可以躺著保護太子。”魏征不得已才接受了任命。
魏征出任太子太師，加強了承乾的地位，使眼見就要爆發的政治危機得到一定程度的緩解，但是李泰的黨羽並不就此甘心，繼續暗中活動，散布流言蜚語。為此，太宗對群臣說：“聽說外邊有人認為太子腳有毛病，魏王聰明，不少人跟魏王結交來往，就產生出一些稀奇古怪的議論來，僥幸之徒已經在跟著附和。太子即使腳不好使，也並非不能走路。而且根據《禮記》，嫡子死，立嫡孫，現在太子的兒子已經5歲，我最終不會以庶子取代嫡子，開覬覦的先例。”這樣，終魏征之世，李泰的奪嫡也沒能實現，承乾保住了他的太子地位。