7月11日，在提出第二次創業的一年後，史玉柱在全體幹部會議上不得不宣傳：巨人必須進行二次創業整頓，包括三個方麵--思想整頓、幹部整頓和管理整頓，核心是幹部整頓，進行一次幹部大充血，凡是過去3個月中沒有完成任務的幹部，原則上一律調整下來。
史玉柱使用的第一招是，通過競爭上崗進行大換血。他宣布整頓的3天後，從7月14日至22日，人事部門庭若市，前來競聘的員工達46人，其中自薦者43人，許多分公司的員工也打來千裏長途。
8月，史玉柱使出第二招，集團向各大銷售區派駐財務和監察審計總監，財務總監和監審總監直接對總部負責。同時，監審與財務總監又各自獨立，雙軌並行互相監控。
8月26日，史玉柱的第三招出台，成立幹部學院，將180名幹部集中到南京海軍學院，進行為期一周的軍訓，以增加團隊意識和紀律性。
整頓沒有從根本上扭轉局麵，1995年9月，巨人集團的發展形勢急轉直下步入低潮。麵對大起大落，史玉柱將其描繪成"開始進入發展史的'長征時期'。10月2日，史玉柱發動"秋季戰役"，規模和聲勢大大減弱。他在動員會上下一道死令：秋季戰役對分公司經理來說是一場生死之戰，成則英雄，敗則落馬，集團隻問結果，不問過程。
秋季戰役使巨人集團的營銷有所回升，但再也沒有昔日的高潮迭起。巨人集團出現衰態征兆，史玉柱已感到嚴峻形勢的壓力，他決定出巡大西南，沿著紅軍長征的路線一路考察，似乎要汲取一種力量。一路上，他去了太平天國起義舊址金田，仔細研究了洪秀全的成敗得失；在遵義會議舊址，他思考的是戰略與戰術的轉變。來到大渡河那天，恰逢陰雲密布，秋風怒號，史玉柱陡生一種悲壯之氣，麵對滔滔河水而仰天長歎："我們麵前就橫著一條大渡河呀!"
(三)失血斷腕，巨人體態
1995年底，巨人集團營銷出現嚴峻形勢，集團財務狀況吃緊，史玉柱立刻宣布進入"緊急狀態"，各省總公司的一批總經理被撤職，巨人集團迎來有史以來最寒冷的冬天。
1996年的元旦，巨人集團過得有些沉重。因為巨人集團在1995年經曆了前所未有的陣痛，一些員工相繼離去，一批幹部的憂患意識漸濃。史玉柱元旦沒有休息，而是召開營銷會議。他在會上承認：1995年的"三大戰役"和"秋季攻勢"都未達到預期目標，這是因為幹部隊伍暴露缺陷，集團綜合協調係統發生問題。最後，史玉柱以紅軍長征作比喻："巨人正處於長征後期，肯定會淘汰一批沙子，能走完長征的人將是巨人的核心和骨幹。吹盡狂沙始到金。"
1996年初，史玉柱為換救頹勢，營銷戰略從全麵進攻轉向重點戰役，在開發出減肥食品"巨不肥"後，他打算發動"巨不肥會戰"。春節一過，史玉柱成立"會戰總指揮部"，他出任總指揮，下轄三大"野戰軍"。每支"野戰軍"率領七八個"兵團"(各省總公司)，各"兵團"又有幾支縱隊(子公司)。各部門還挑選精幹人員組成衝鋒隊，《巨人報》的記者成為前線戰地記者。2月10日，三大"野戰軍"司令員舉行陣前盟誓。2月25日，史玉柱總指揮高舉酒杯，為奔赴前線的將士壯行。2月26日，宣布進入全線戰備狀態。3月份，會戰打響，此次會戰沒以大規模的廣告覆蓋為先導，而是舉行"巨不肥大贈送"，此次戰役的宣傳口號為"請人民作證"。據《巨人報》報道，參加會戰的"正規軍"為2000人，"民兵"5000人。
巨不肥會戰在4月份取得戰績，銷售大幅回升，1995年底的嚴峻形勢得以緩解。巨人集團喘上一口氣。
營銷形勢好轉並非整體狀況好轉，更不意味良好機製形成。相反，集團內部一些人把"巨不肥會戰"當成最後一頓晚餐，侵吞私分巨人集團利益的現象集中爆發。1996年7月，監事會主席周良正在一份報告中認為，巨人集團出現各類違規、違紀、違法案件，截留、坐支、挪用公款，搞虛假廣告、衝貨的人屢見不鮮。鑒於這種跡象日趨明顯，7月8日，史玉柱組織全國總公司經理和總部中層以上的幹部，參觀了廣東省高明市重刑犯監獄。
到1996年下半年，一個更大的壓力向史玉柱襲來，巨人大廈急需資金。這可是硬碰硬的壓力，逼迫他迅速作出抉擇：是停掉巨人大廈，還是拆東牆補西牆。實際上，史玉柱此時已意識到，僅靠巨人的生物工程和電腦兩個產業支柱，不足以支撐巨人大廈，但史玉柱還是作出一個違背企業行為的決定，抽調生物工程的流動資金，去支撐大廈的建設資金，活錢變死錢。
從資金運作角度，史玉柱當時應該讓巨人大廈停工，將資金投放於已染上貧血症的生物工程，使其恢複元氣。史玉柱事後說，他是明知故犯，因為巨人大廈是珠海的標誌性工程，國家領導人都非常關注，所以他決策時非經濟因素占上風，沒有過多考慮經濟規則。
巨人大廈是史玉柱有生以來第一個重大投資失誤，他根本沒有實力蓋一座全國最高的大廈，這是個人狂熱的一個典型之作。更讓人瞠目結舌的是，大廈從1994年2月動工到1996年7月，史玉柱竟未申請過一分錢的銀行貸款，全賃自有資金和賣樓花的錢支撐。稍微懂點經濟的人都知道，房地產必須有金融資本作後盾，可史玉柱竟將銀行擱置一邊。他對此的解釋是：到1996年6月前，我沒感到資金緊張，生物工程方麵的銷售回款源源不斷，帳上的錢花都花不完。
直到1996年5月，史玉柱依然據此做法建設大廈，甚至達到頂點。這個月，各子公司交來毛利2570萬人民幣，史玉柱把淨留下來的850萬資金全部投入了巨人大廈。這是投放資金最高的一個月。
史玉柱就那麼點資金，又要在兩條戰線上作戰，當然顧此失彼。到1996年下半年，他感到需要外援時，因宏觀調控影響至深，各處都資金吃緊，隻好竭澤而漁。
進入7月份以後，保健品銷量急劇下滑，維護生物工程正常運作的基本費用和廣告費投入不到位，許多公司一籌莫展，隻好等待總部政策。進入8月份，史玉柱發動了一場秋季攻勢，力換頹勢，但並未奏效。所有公司完成任務率都有程度不同的下降。
巨人大廈抽幹了巨人產業的血，史玉柱把生產和廣告促銷的資金全部投入到大廈，結果生物工程一度停產，資金補給線嘎然中斷。
從11月份開始，史玉柱控製住從巨人產業流向巨人大廈的每一份錢。一刀斬下，巨人大廈與巨人產業瞬間涇渭分明，但為時已晚。
盡管史玉柱勉力支撐，但他已回天乏力。直到1997年1月12日，危機總爆發。當大難臨頭之際，沒人能幫史玉柱。盡管他堅信巨人不會因此趴下，終有東山再起之日，但已身陷四麵楚歌。
巨人集團能否力挽狂瀾?史玉柱獨上高樓，望盡天涯路。