後來，破釜澗一帶就更名為洪澤浦。由洪澤浦又衍生出洪澤館、洪澤鎮、洪澤屯等地名。明初，開始出現“洪澤湖”這個名稱，此時的洪澤湖僅限於洪澤湖的南部地區，即破釜澗一帶。直到清初，才開始以洪澤湖統一命名今天的洪澤湖區。
隨著高家堰的修築，洪澤浦開始彙合周圍小湖，漸成巨浸。與洪澤鎮相連的阜陵湖，寬二十裏，長四十裏，原先是淮水貫穿於其中 ，隨著淮水瀦積，遂與洪澤浦彙合，並逐漸與其東部阜陵湖、泥墩湖、範家湖等諸湖彙為一體。此時的洪澤湖地區狀況是：“淮常注湖，黃合淮亦注湖，三勢相合，駕風而恣，東衝琅邪，西逾龜山，浸桃源，北彙清口，南刷衡陽，周回四百裏，茫然無際”。洪水很快淹沒了洪澤鎮一片的村落，百姓們逃離家園，流落到他鄉，濤濤洪澤，已具雛形。
洪水迅速蔓延，直逼泗州，皇家祖陵告急！消息傳到京城，禦史徐用賓、給事中王道等人立即上疏彈劾潘季馴治河不利。萬曆皇帝大怒，緊急召見了首輔張居正，要求立刻治河督潘季馴的罪。
張居正求情道：“眼下兩河工程到了收尾期，不宜草率換帥！”
萬曆皇帝怒道：“想當初，朕一再追問過你們，你們信誓旦旦地向朕保證，此工程不會對泗州一帶形成不利影響！結果又怎樣呢？”
張居正還想說什麼，萬曆皇帝根本不願意再聽他任何解釋。如今的萬曆皇帝已經長大了，已經不是那個任李太後和張居正擺布的小孩了，他開始有了自己的主見，正在努力去擺脫兩人對自己的束縛。
萬曆皇帝本想將主要責任人潘季馴的官職一擼到底，後來經過李太後的勸說，才做了些讓步。經過研究，朝廷最終決定調兩廣總督淩雲翼接任潘季馴的職務，改潘任南京兵部尚書。在明代，由於開國皇帝朱元璋建都南京，後來他兒子朱棣遷都燕京，京城雖然牽走了，南京的那一套機構體製還保存著，不過實權在燕京，南京的官僚們多是有名無實的虛職。這明擺著，潘季馴是被降了職。
這一日，是潘季馴最糟糕的一天。夫人青音聽說老家泗州告急，第一次與夫君紅了臉，她責備道：“奴家一直將你當成最親最愛的人，一直信任著你！為了你，即便爹娘我也不惜與他們翻臉！可是你太讓我失望了，看來爹爹和鄉親們的預感是正確的，我以後還有何顏麵去見家鄉父老！”
潘季馴試圖解釋，可是夫人青音竟然嚶嚶地哭泣起來。正在他心煩意亂之時，突然有個人闖了進來，大喊道：“潘公，大事不好了！江大人他，他，他要不行了！”
潘季馴大驚，忙問發生了什麼事？那人道：“小人今日早上去叫江大人出來吃飯，在門外叫了兩聲不見有人答應，於是就推門進去，發現江大人臉色蒼白，床頭還有很多血！於是不敢耽擱，就前來稟報大人你！”
於是，潘季馴不再理會夫人，跟著那個人便匆匆地來到江一麟的住所。此時的江一麟氣息已經很微弱了，他斷斷續續道：“潘公，就此別過吧！以後，再也不能陪伴在你身邊了……”
潘季馴大顆的眼淚禁不住地落了下來，他握著江一麟的手，道：“兄弟，你說什麼呢？別亂想了，你會好起來的！”
江一麟搖了搖頭，虛弱地閉上了眼睛。潘季馴派人請來了郎中，可是為時已晚，江一麟永遠地離開了人世！
“兄弟，走好！”潘季馴悲苦地叫了一聲。他還沒有來得及痛快地哭上一場，卻聽到外麵一陣大亂，有人高聲喊道：“潘季馴潘大人，快快出來接聖旨！”
潘季馴擦了擦眼淚，忙跑了出去，跪倒在欽差麵前接旨。卻聽那人念道：“奉天承運，皇帝詔曰，河漕總督潘季馴治河不利，致洪災危及祖陵，現免去河總一職，由原兩廣總督淩雲翼接任。朝廷愛才，但念其勞苦功高，改任南京刑部尚書，欽此！”
送走了欽差，潘季馴想起自己目前一地雞毛的窘境，不禁心灰意冷起來，趁沒人在場時，他將聖旨重重地摔在地上，心裏暗罵道：“他媽的，都是什麼東西！你們愛怎麼著就怎麼著，老子今天不幹了！”