最後進來的人是政府部門派來保護陳右軍、緝捕張秋琴的。陳右軍在來女兒島之前，已經將全部情況報告給了政府有關部門。
接下來發生的事情就比較簡單了。
張秋琴被政府關押起來。
張秋琴交待了她所知道的全部情況。根據她提供的線索，又破獲了五六部電台，抓獲了十餘名特務。
在張秋琴知曉範圍之外，各地還隱藏了一些沒有破獲的零星電台。這些特務十分狡猾，經常變換發報地點，所用密碼也極為複雜，令陳右軍絞盡腦汁也終未破譯。
有關部門對陳右軍施壓，不破譯敵台密碼，就拒絕他繼續到海洋研究所同海豚在一起。自從張秋琴被關進牢房後，陳右軍對海豚愈加癡迷，時有坐在池邊讀電碼。他曾幾次提出要見見張秋琴，都未獲批準。
他把全部激情都投入到了破譯那部難啃的密碼上。
陳右軍一度感到生活甚是無趣。苦悶至極，無處發泄，他就一次又一次地向密碼發起了攻擊。他多次變換戰法，使盡了他曾屢試不敗的伎倆，都奈何不了潛伏台的密碼。他感到他的破譯生涯走到了天盡頭，自己無計可使了，自己黷驢技窮了，自己走投無路了。
他的精神世界開始混亂無序，他的腦海整日沸騰不止，幾乎到了瘋狂的地步。
這個時期，他時常不可救藥地想起女兒島，想起女兒島上早期的海豚趣事，當然也心緒異樣、興趣昂然地重溫了他與張秋琴的那段友情交往，還回憶了最近一次他與張秋琴在女兒島上的那三天三夜。
陳右軍被那該死的密碼幾乎逼到絕境。
這天上午，陳右軍突然提出一個要求：同張秋琴一同破譯這個密碼。領導說，早已派人把這部密碼素材送到過張秋琴的手裏，以減刑為條件讓她破譯。可她至今也沒有攻克它。
陳右軍說：“我們倆聯手作戰也許還有希望。我們曾有過默契的配合，我倆的密碼靈感相通。相信我們能行。”
有關部門權當把死馬當作活馬醫，在監獄裏為張秋琴和陳右軍弄了一間特殊的牢房，倆人開始了一段特殊的生活。白天他們死守在一起破譯密碼，晚上張秋琴則被帶回她原來的牢房。
剛在一起的幾天，倆人手中雖然拿著密碼的素材紙，實則心完全沒在密碼上。他們隻管悄聲細語地交流著心聲，傳達著情感。
通過這一係列變故，陳右軍對張秋琴的態度有了重大變化。
張秋琴棄暗投明了。她非但沒有幹掉他，反而幹掉了想幹掉他的同黨。她的心自始致終都在他身上，盡管她為敵所用，但從來就沒有背叛過他。敵特組織派她來策反他，來幹掉他，本身就是一個錯誤。敵特組織隻知道她熟悉他、了解他，執行該項任務條件更充分一些，而忽視了他倆之間的情感因素。
陳右軍徹底放棄了多年來對張秋琴的抗拒態度，他拿定主意要痛痛快快地接受她。他對她說盡了天底下有情人所有的愛慕言辭。哨兵不在門窗前晃動時，他就抓著她的手纏綿，甚至還把她擁在懷裏一會。她不再對他說一句愛語，隻無聲地享受著這遲來的愛撫。
重逢帶來的激情過後，他們才開始破譯密碼。他們調動各自潛在的智力，充分運用倆人形成的超強合力，一點點啃食著這塊硬骨頭。他們的心相通了，他們的靈感熾熱地交融在一起了，一次次地碰撞出了耀眼的火花。兩個半月後的一天，他們終於攻克了這個頑堡。
他們沒有歡呼，沒有狂跳，甚至沒有吭一聲。他們幾乎同時產生了一個念頭：暫不告訴領導密碼已達成破譯。讓我們再過一段這種相聚的生活。
桌上攤著素材紙，嘴裏卻悄聲說著與此毫不相幹的話題。
他們談夠了愛情，就談海豚，談其他生物物種。
他說，在地球上除了我們自己外，還不知有多少類智慧生物。它們對人類舉止善良，充滿著柔情，展現著友好。它們時常用人們不能理解的方式，向人類示愛，求和。而人類總有那麼一部分人，卻有計劃地殺戮它們。對無辜生靈的糟蹋，使人類的弱點暴露無遺。
她說，在各種各樣的戰爭中，人殺戮 著人，不把對方當作人看待。非但如此，殺人者的心裏還時常充滿神聖。納粹曾宣稱某些整個種族是劣等民族。這樣劃分出人類等級之後，就有理由剝奪這些劣等種族的公民自由權，奴役他們，殺害他們。
她又說，我們在戰爭背後搞密碼破譯，我們不能親眼看見誰在殺誰，我們的感覺遠沒有謀殺別人時的那種感覺。在我們破譯的電報裏得知，人們殺起同類來都能那樣容易地把無理的事說成有理，把殺人說成是偉大的壯舉。就這樣，弱勢民族被技術更發達的文明社會橫加殖民強暴。
他說，盡管我們探索外星生命可能需要很長時間，但我們如果能與海豚對話交朋友，逐步實施一項人類返本歸真、走向仁慈博愛的計劃，那就再好不過了。
他又說，這一部密碼已經耗盡了我們智力的全部，我們已經沒有能力破譯越來越現代的密碼了，我以後再也不碰這該死的密碼了。我的知識儲備不夠用了，我的技術水平不行了。現在通信技術發展太快了，密碼編碼水平長進太快，我真的感到跟不上趟了。這次，要不是你的輔佐，這塊硬骨頭我到死也啃不下來了。
他們到底還是拿下了這個高堡。他們不能再裝下去了，在最後的期限內，不得不交出了破譯成果。他們不得不結束了這難以割舍的相聚生活。
張秋琴雖已被減刑，但仍需在監獄度過十三年。
陳右軍又回到了他那個特殊部門工作。可他再沒有破譯開一部密碼，他漸漸從機密圈裏淡出，逐步離開了特情工作。現在上麵對他的惟一要求，是保守住自己以往所經曆過的秘密。這成了他惟一的一項工作。
密碼破譯行業的職業背景十分複雜。它常年用冷酷執拗的態度，向它的所屬人員發布保密、保密再保密的訓示，直到把保守秘密的意念，培養得勝過自己的生活習慣，成為自身的第二天性和真正的本能。
陳右軍始終處在這種令人窒息的保密氣氛之中，從不能真正對他圈外熟悉的人提起自己的身份，久而久之形成了自己牢不可破的職業特點。這是職業戒律所要求的，無人敢突破它。領導說：“你要自己告訴自己，你的過去是一場夢，醒來要忘個一幹二淨，不能再對任何人提起，甚至不能再對自己提起”。是啊，對不再從事破譯行業的陳右軍來說，這就是一場夢。不，還不如一場夢。夢醒了，還可以對睡在身邊的人說，我做了一個怎樣的夢。而這個夢做了要像沒做一樣，死死地封存在自己的腦殼裏，千萬別讓它探出頭來。他明白：他們這些特殊的做夢人，一定要耐得住寂寞，從心底深處徹底忘掉過去的特殊歲月。否則，各種各樣的麻煩將與你糾纏不清。
陳右軍同“與世隔絕、單調乏味、沉默無語、絕對保密”的生活告別了，不能再靠近那個神秘機構半步。然而，他卻時常接受著那個神秘機構各種形式的督查。
陳右軍又回到了海濱海洋生物研究所工作。
陳右軍數月未到海豚池來，私自跑到這裏參觀的人增多。他看到，有人在用木杆引導索妮表演水上迪斯科。
陳右軍不知突然發現了什麼，衝逗弄海豚的人大喊：“停下，快停下！”
他下到水池，摟著索妮仔細察看著。索妮對久日未見的老朋友十分熱情。顯然，它還牢牢記著它與陳右軍之間的友誼。
陳右軍落湯雞般爬上水池，先是興奮地原地轉了兩圈，還無聲地笑了兩聲，然後就衝持木杆的人大叫起來。“索妮已經懷孕足月了。你們怎麼還殘忍地讓它做腰部劇烈運動的水上迪斯科。索妮要是有個三長兩短，誰負這個責任？”這是一個奇跡，是一個意外驚喜，繼而成了陳右軍的精神支柱。在他心裏索妮有孕，不亞於他破譯開了一部高級密碼。這也是一個令人鼓舞的重大成果。
三天後的一個早晨，索妮就要生產了。愛豚如命的陳右軍一直雙手合十，跪在海豚池邊，懷著複雜的心情目睹著索妮生產的全過程。
幼豚的尾部先露出母體，然後是嬌小的身體。全頭全尾滑進水中後，緊貼在身體上的背鰭和側鰭漸漸展開。
索妮拱護著幼豚遊向水麵。它張開出氣孔，完成了來到這個世界上的第一口呼吸。
半小時後，小海豚就遊動自如了。
陳右軍長長地呼了一口氣，雙手捂住臉，竟“嚶嚶”地哭起來。