日本進出口銀行對中國提供了大約32240億日元的優惠貸款，遠遠超過了日本政府對中國官方援助的金額。其主要項目包括資源貸款、資金合作貸款、投資金融等大型項目的貸款。上世紀80年代，日本進出口銀行對中國的貸款主要用於資源的開發，尤其是煤炭和石油資源的開發。進入上世紀90年代以後，貸款主要用於中國的基礎設施建設，包括修建機場、高速公路、橋梁、發電站等。考慮中日比較特殊的曆史和政治關係，日本進出口銀行在中國貸款方麵一直給予優惠，比如由中方為主選定貸款對象；實施破格低息，資源貸款在財政投資和融資利息基礎上加0.2%的手續費，比其他國家同類貸款利率低3%；在資源貸款方麵，一般都采用5年至9年長期貸款的方式。中日企業的直接投資合作自上世紀90年代以後呈明顯上升趨勢。中國改革開放後，各項事業取得了長足的進步，對中國這個還有待開發的大市場，日本企業家紛紛聚焦中國，對中國的投資也急劇增長。1992年為10.7億美元，1994年日本對外直接投資項目為694件，其中對中國的投資就318件，占總數的45.8%。日本對中國的直接投資1997年為2438億日元，數量是258件；1998年為1363億日元，數量是112件。從1979年至2006年4月底，日本對中國投資項目達3.6萬個，合同金額817億美元，實際到位金額548億美元，居中國實際利用外資國別地區排名第二位。中國成為日本的第二大投資對象國。
據日本貿易振興機構統計，2005年日本在中國投資激增19.8%，創下了65億美元的最高記錄。在日本對華投資連續回落之後，投資的回溫是日本企業長期戰略的體現，在大多數日本企業的規劃中，中國仍然被視為第一大的海外市場。日本對華投資的不斷增長，為中國解決失業下崗問題提供了有力的幫助，提高了中國對日本的商品出口，推動了日本一般技術在中國的轉讓。同時，日本在中國的投資也得到了豐厚的回報。在 華 投 資 的日資企業利潤與銷售額之比在9%以上的企業超過了58%，在日本國內經營的企業該比率僅為3%。其中，利潤和資本額比達到20%的企業達到30%以上，也就是說在華投資的企業基本上5年之內就可以收回投資。日資企業在中國的投資回報率比日本國內的回報率要高出很多。可見，日本對中國的付出得到的回報也是相當可觀的。
上個世紀90年代初期，日本企業在華投資占中國境外投資的10%，到了2002年就降為8%，盡管在中國接受外國投資中仍然名列前茅，但是在境外對中國直接投資的總比例中出現了下降趨勢。同時，日本對中國的直接投資占日本對外國的投資比率一直比較低，在日本對外直接投資的比率中，1997年，美國占38.5%，四小龍占6.3%，東盟占10.6%，歐洲占20.8%，大洋洲占3.8%，中國僅占3.7%；1998年，美國占25.3%，四小龍占4.3%，東盟占8.2%，歐洲占34.4%，大洋洲占5.4%，中國僅占2.6%。到了2000年以後，日本開始增加對華投資金額，比重有所增長。
中日經貿在不斷發展中取得了多項成就，但是也存在一些需要改進和解決的問題。日本企業技術轉讓不夠，在中國直接投資，隻建工廠並不設立技術研發部門，日本的一些大公司對華投資依然比較保守。日本進出口銀行和對中國的開發援助逐年減少，優惠貸款也越來越難以得到，各種限製和約束越來越多。1999年，日本進出口銀行製定了對中國提供貸款的新方針，改變了對中國的特殊優惠待遇，把中國作為一個普通國家處理。在新方針中規定，對中國提供資金的利息由原來低於其他國家改為和其他國家相同；取消資源貸款的長期一攬子方式，改為以每年度作為計算單位；改變原來貸款項目由中方單獨選定事後由日本進出口銀行批準的做法，變為由日本進出口銀行事先確定；改變過去不管貸款項目工程內容的做法，要進行個別檢查；要求今後中國新聞媒介對日本進出口銀行貸款項目進行積極報道和宣傳。
中國經濟的快速發展，綜合國力的不斷增強，日本的政治家開始對中國的發展表示憂慮，開始擔心中國強大之後會威脅到日本的安全，於是不願意像過去那樣以優惠的條件支持中國的經濟發展。另外，日本國內經濟狀況的低迷和財政的拮據也是促使日本進出口銀行做出這樣決定的另一重要原因。日本的很多學者、專家認為日本總是無聲無息地對中國提供援助不能給日本帶來任何好處，所以要求中國媒體對日本援助中國要作積極報道，顯示出日本想借援助中國來提高自己的國際地位，博得政治聲望的政治目的。但是回顧兩國經濟往來的多年曆史，中日經貿關係的主流和發展方向還是好的，對中日關係的改善起到了積極的推動作用。
中日兩國在經貿、文化、科技等方麵有很大的合作空間。但是30年的合作並沒有緩解中日兩國之間的政治降溫，出現了“經熱政冷”的局麵。這種強烈的反差是中日曆史上曾多次出現過的。縱觀兩國交往的曆史，即使在打得不可開交的時候，兩國的經濟仍然在繼續往來和發展。曆史不容忘卻，尤其是近年來，日本國內右翼勢力的不斷擴張，中日在很多方麵產生了摩擦，台灣問題，釣魚島領土糾紛，修改憲法，日本首相參拜靖國神社等成為兩國關係發展的新的障礙。這些因素不但影響了中日兩國關係的順利發展，也嚴重傷害了兩國人民的感情。