好一個“三大可惜，四大可憂”，分析透辟，句句忠實。崇禎帝看到奏疏後，懷疑是否背後有人指使，華允誠於是又上疏揭露了很多關於閔洪學營私舞弊的事。並且進一步指出：“體仁生平，臂塗顏，廉隅掃地。陛下排眾議而用之。以其悻直寡諧，豈知包藏禍心，陰肆其毒。又有如洪學者為之羽翼，遍植私人，戕盡善類，無一人敢犯其鋒者。”崇禎帝也有所察覺，溫體仁和閔洪學既然是同鄉，可能有些私人感情在其中，但他還是認為溫體仁是忠於朝廷的。因此不但沒有追查溫體仁的罪行，反而下旨罰華允誠半年薪俸。為了遮人耳目，也將閔洪學罷了官。
華允誠的彈劾，並沒有使溫體仁受到致命的打擊，也並沒有削減皇上對他的信任。當然他不能坐以待斃，要主動進攻。於是指使宣府太監王坤彈劾周延儒庇護陳於泰。王坤的表疏招來了言官們的抗議，因為太監參劾首輔屬違例行為，認為是對朝廷的輕視。給事中傅朝佑說：太監不應當彈劾首輔，他這麼做肯定有人指使。副都禦史王誌道也對王坤加以指責。朝中言官此時議論紛紛，大為不滿。可是這次崇禎皇帝又站在溫體仁一邊，將禦史王誌道罷官。
溫體仁乘勢又唆使給事中陳讚化彈劾周延儒，說他與武弁李元功相勾結，招搖圖利。同章中還揭發周延儒把崇禎皇帝比為“羲皇上人”，言語悖妄不敬。皇上大怒，詔將李元功下獄治罪，同時追問從哪聽來的。給事中李世祺等紛紛證明確是延儒所言。周延儒此時真的感到了懼怕，於是請求溫體仁能幫他一把。但是此時溫體仁覺得延儒大勢已去，便沒有答應。並且私下裏還把同延儒關係好的人都罷了官，從此延儒的處境更加艱難。
周延儒失寵於崇禎皇帝，周圍的親信黨羽又一個一個被溫體仁逐出朝，他孤軍一人，戰不能勝，退不能守，隻好於崇禎六年六月，主動要求致仕。溫體仁順理成章地當上了首輔。崇禎帝對其也是恩寵有加。
溫體仁終於擠掉周延儒，他通過玩弄手段，騙取了崇禎帝的信任。如今大權在握，便竭力樹植親信黨羽，打擊、排擠異己。他還是那麼一副彬彬有禮的樣子，就是在殺人的時候，也絕不露出凶相。這一點頗有點像唐朝的李林甫，口蜜腹劍，但他比李林甫高明多了，在不知不覺中，不露聲色地把人害了，人們還會覺得他在挽救自己。可見其手段之高明。他想要推薦某人，決不大張旗鼓地去提名爭取，而是授意某人，讓他先提出來，自己隨後馬上附和。這樣往往具有很大的欺騙性，誰也不會說他恃權植黨。如果要排擠誰，他也決不明目張膽地大加撻伐，而是首先弄出一些事情讓你不滿，當你按捺不住首先動怒的時候，讓人看到是你首先挑起爭論，而他依舊不與你正麵衝突，讓你火氣越來越大，最後他再到皇上那裏奏一本，皇上便將你或貶或調離。這樣他又可不擔排擠大臣的惡名。
講官姚希孟，曾為東林係統的官員所敬重。又因為才名較高，也很為皇上倚重。溫體仁看到他受到皇上的恩寵，心生妒忌，擔心他將來可能會威脅到自己的地位，便想方設法把他搞掉。終於借端把他排擠到南京翰林院。
權臣的一個最大的特點是嫉賢妒能，弄權者的目的在於保住自己的地位不受侵犯，至於國家的利益是否受損那就顧不上了。起用庸人和小人往往成了權臣用人製度上的一個特色，小人阿附，庸人聽話。
當時魏忠賢的遺黨也在窺探朝中政局，他們並不甘心永遠退出政治舞台。溫體仁的所為，使他們重新看到了希望。於是早已被崇禎皇帝定為逆案的魏氏黨徒，便把翻案的希望寄托在溫體仁身上，準備再與東林黨人決一勝負。於是他們加緊勾結攀附溫體仁，而溫體仁對東林大臣早有成見。他們多是正直有為之人，不僅不阿附自己，還常常找自己的毛病。於是溫體仁便策劃起用逆黨成員，以鞏固擴大自己的權勢。恰好吏部尚書、左都禦史缺員，溫體仁便暗中指使侍郎張捷推薦逆案分子呂純如。由於逆案是崇禎二年所定，逆案成員攀附魏氏禍國殃民，其成員永不敘用已有成文。張捷此舉使輿論嘩然，朝中議論紛紛。崇禎皇帝對此也十分氣憤，下詔斥責張捷。溫體仁的精明就在這裏，他讓張捷舉薦隻是投石問路，如果朝中上下沒有反應，他便可能站出來附和，而眼下皇帝都火了，他也隻好裝作與己無關，張捷也就自認倒黴吧。溫體仁趕緊上書薦謝陛、唐世濟補上了此缺。
雖然在舉薦逆黨的問題上碰了釘子，但是溫體仁並不甘心。這決不是溫體仁不識時務，明知不成也硬往南牆撞，他有他的打算。逆黨雖是已定成案，但其遺黨還大有人在，如果能翻此案，其他好處不說，至少擴大了自己的政治勢力。於是他又唆使唐世濟，上疏推薦逆案成員霍維華，結果又失敗了。唐世濟由此獲罪罷去了官職。從此，溫體仁才徹底灰了心，不敢再冒險了。一旦追查到他這兒，定下罪來也不是鬧著玩的。
溫體仁為逆黨翻案失敗後，便把全部精力用到了打擊、排斥異己上。在權奸的眼中，收買和打擊是相輔相成的。
崇禎八年，皇上有感內憂外患，旨令責人進講春秋，有裨治亂。當朝才士文震孟是研究春秋的名家，他是文徵明的曾孫，在同魏忠賢逆黨鬥爭中，不避危險，頗有時望。但其為人正直，識卓才高，因此為溫體仁嫉恨。當次輔錢士升提到他時，溫體仁假裝大驚的樣子，拍著腦門說：“幾失此人。”無奈之中，又不得不把文震孟的名字報給皇上。崇禎皇帝對他的才識十分欣賞。不久皇上要增加閣臣名額，便召廷臣好幾十人試以票擬，結果特擢文震孟以禮部左侍郎兼東閣大學士入閣。