唯識，梵文vijaptimatratā，音譯為毗若底摩呾喇多。識，即心之本體，離識變現之外無任何實在，稱為唯識。即認為人類自己心外之物心諸現象皆由八識自體所變現之主觀（見分）與客觀（相分），又以所認識對象之相似形狀為心內之影像所映現而認為實在實有，且作為認識對象之物境自體（本質）亦從阿賴耶識中之種子變生，故唯識以外無其他實在，稱為唯識無境，或稱萬有從識所變之意義，而稱唯識所變。唯者簡別義，遍無外境；即排除所執我法離心而心。識者了別義，表有內心，即表因緣所生之法性皆不離心。《華嚴經》就集起義言唯心，《成唯識論》就了別言唯識。或唯心通因果，唯識唯在因位。如《義林章》雲，識者心也，由於心的集起，彩畫為主之根本，故經雲唯心。分別了達之根本，故論稱唯識。識的了別，在因位中作用最強，故說識為唯。《成唯識論述記》雲有二義：（1）簡別義：庶無心外境，顯其非有。但是虛妄執著。（2）決定義：離增減義，決定有識存在。
法相唯識學以八識二無我成立唯識義，說明法界無我的唯是識。主張一切諸法皆是阿賴耶識等諸識之所變，然而，所變法雖有森羅萬象，但能變識隻有三種，即第八識、第七識、前六識。《成唯識論》依次名為異熟能變、思量能變、了別能變；亦即初能變、二能變、三能變。此三皆名能變，而能變有二種，即因能變及果能變。認為第八阿賴耶識中，攝藏產生一切法的原因之種子，由此種子能轉變現起諸法，稱為因能變；又由此種子所生起之八識能各從自體變現出見、相二分，稱為果能變。因能變之“變”為轉變、生變之義，故又稱因變、生變；果能變之“變”則為變現、緣變之義；其結果在第八識上起主觀與客觀之區別，而向對象起作用。《觀心夢覺鈔》卷下分為二種道理說明：（1）熏習道理，即生變之義，種子係由自心之作用深植於識中。（2）轉變道理，即緣變之義，由識變現見、相二分。
據《成唯識論》卷二載，因能變指第八識中的等流、異熟二因之習氣，能轉變成諸法，故稱因能變。即：（1）等流習氣，又作名言習氣、名言種子。即瑜伽行學派所說，由“七轉識”之善、惡、無記等三性為同類因，而熏成第八識中之名言種子。等流，謂流類相等或相似；由七轉識所引生等流果之習氣，稱為等流習氣。此習氣乃第八識所藏之生果功能，故謂之種子；此習氣與由其所生之果（即現行法）流類相似，例如由善因則生善果，由惡因則生惡果，由無記因則生無記果，故謂之等流。如是依善、惡、無記等各種性質而熏成之流類相似之種子者，即是具有“能熏”作用之七轉識，故《成唯識論》卷八謂，等流習氣是由七識中之善、惡、無記三性所熏而生之種子。（2）異熟習氣，指能招感三界異熟果之業種子，即前六識之有漏善、惡業熏習第八識而生之業種子。此業種子即是第六識相應的善惡等思心所之種子，乃招感第八異熟識之增上緣，而第八識則是一切有情總報之果體。這種子有二種功能：自生現行之功能和資助其他異熟無記之種子令生現行之功能。其中，自生現行之種子，即是等流習氣；資助其他異熟無記之種子，即是異熟習氣。蓋此一體之二用，並非遠離等流習氣而另有別體。所謂資助所生之其他無記之果，係指總報之第八識與別報之前六識；而第七識僅為無記，故非異熟因所攝，又具有覆蔽聖道之性質，故亦非異熟果。總果之第八識，稱為異熟或真異熟；別果之前六識，稱為異熟生，此異熟與異熟生，合稱異熟果。
異熟習氣又稱為業種子，等流習氣又稱名言種子，那麼種子義怎樣呢？這是唯識學的一個專門術語。種子，梵文bija，如同穀類等由其種子所生，色法（物質）與心法（精神）等一切現象亦有其產生之因種，稱為種子。對穀內之種子稱為外種；對外之種子而言，唯識學將其種子攝於阿賴耶種中，稱為內種。內種子係指其生果功能而言（生果作用），乃為現行諸法（現行所顯現之諸現象）熏習於阿賴耶識中，而形成一種特殊之習氣或餘習。
種子之說，原為一種譬喻，最早見於《雜阿含經》。部派佛教中之化地部亦謂，於“窮生死蘊”之識中，常藏有色法和心法之種子；對此，經量部認為色法與心法，互為種子而具有熏他之性質，故主張“色心互熏”之說。於《瑜伽師地論》中，立阿賴耶識為“種子識”，並謂此識能生色、心、善、惡等一切諸法，而藏有一切種子。“種子”一詞，其後成為唯識學重要術語之一。據《成唯識論》卷二之說，於阿賴耶識中，能同時生起七轉諸法現行之果，又具有令自類之種子前後相續不斷之功能；即能生一切有漏、無漏、有為等諸法之功能者，皆稱種子。如同植物之種子，具有產生一切現象之可能性。種子藏於阿賴耶識中，前者（種子）為因、作用，後者（阿賴耶識）為果、本體。然種子並非一客體，而係一純粹之精神作用。
自類別而言，種子可分為二種：（1）能產生諸現象（眾生之迷界）者，稱為有漏種子。（2）能生菩提之因者，稱為無漏種子。有漏種子複可分為二類：（1）能產生與種子同類之現象者，稱為名言種子、等流種子，即前說之等流習氣。（2）可幫助名言種子，以善惡業而產生異熟作用者（即具有產生當來有漏果之功能），稱為業種子、異熟種子、有支習氣、異熟習氣等。上述之中，名言種子係一切諸法之“親因緣”種子，乃以名言為緣所熏成之種子，又分表義名言與顯境名言兩種。表義名言種子，指於名言（名、句、文等）中詮表諸法之義者；第六識即緣此名言，隨其語言音聲而變現一切諸法之相狀，由之所熏成之種子。顯境種子，指緣前七識之見分（認識諸法相狀之作用）為境，隨緣所熏成之種子。若就現行所受用之情形而言，名言種子又有共相與不共相二種名言種子。共相名言種子，如日月、星辰、山河、大地等，舉凡可以供自他共同受用者，是為共相；能生起此類共相境界的種子，皆稱為共相名言種子。自相名相種子，例如各人之身體，僅能供一己受用，能變現此等自相之種子，稱為自相名言種子（即不共相）。就作用而言，共相與不共相之名言種子，均由共業與不共業之業種子為之資助，始能招感其相，即共業種子資助共相種子，始能招感共相；不共業種子資助不共相種子，始能招感不共相。準此可知，大乘唯識之宗義，乃謂無論依報、正報等一切萬法皆由種子所變現者。