李淵本來是試圖擺平三個兒子之間的關係，因為畢竟每個兒子都是自己的，對於李建成與李元吉暗算李世民的不軌行為，知道後就堅決製止，決不容忍。但是，李淵怎麼阻止都是無用的，因為他們謀劃都是在暗中進行的，絕不可能次次讓父親知道。例如李元吉曾經勸李建成除掉李世民，甚至還說：“當為兄手刃之！”還有一次，李世民隨李淵來到齊王府，李元吉竟然想趁李世民不備，派刺客暗殺他，但李建成知道這樣會被父親識破，製止了李元吉的這次行動。李元吉竟然惱怒地說：“我隻不過是為你謀劃而已，對我能有什麼好處呢！”總的來說，李淵不管怎麼做，都無法協調雙方的矛盾，他的協調不但沒有收到好的效果，反而使互相對壘的形勢更加複雜化。
在兩大勢力的爭奪中，從政治影響來看，李建成占絕對主動，他是皇太子，有著別人無法企及的地位。李淵每當外出時，總是由他留守京師，處理大小政務，是非常有實權的。不論內宮的妃嬪、大臣還是外地的各地都督，依附於東宮的相對多些。李建成曾經揚言，隻要讓秦王“留在京師製之，一匹夫耳”。這話難免有點自我吹噓，但也可以想象李建成當時的勢力之大，已使李世民在京師處於不利的地位。
對此，李世民和秦府僚屬都頗感不安。李世民也完全看出了問題的嚴重性，就如他當時所說：“阽危之兆，其跡已見，將若之何？”房玄齡對李世民說：“現如今東宮已對主公發動進攻了，他們在京師的勢力比我們強，如果我們不積極準備，很快就會受製於人。如今之計，隻有發動政變，除掉皇太子，才能解除我們的危險。”房玄齡的這番話完全符合李世民的心意。
據說，李世民想拉攏靈州大都督李靖，讓李靖和他一起謀劃這件事，李靖堅決不同意。李世民隨後又想拉攏行軍總管李世勣，讓李世勣給出謀劃策，但是李世勣也不願幹。李世民為何不找別人，單找他倆呢？這主要是因為李靖、李世勣原來都是他手下的將領，對他非常忠心。即使拒絕也不會投靠李建成。為什麼他們要拒絕呢？當然他們都有自己的主意，他們明白兩派的鬥爭，尤其是這種繼承者的爭奪，
是不能參加的，一著不慎就會禍及九族。更何況秦王府現在正處於劣勢，勝負之數還不能預料，置身事外，也許是最好的結局。房玄齡、長孫無忌和杜如晦則與李靖、李世勣不一樣，他們都是李世民的親信，他們對李世民是以死效忠的。他們要處處為李世民著想，但是李靖他們不一樣，李世民當了皇帝他們當然好，李建成當了皇帝他們照樣做官。這時李世民雖有殺李建成的意思，但又不忍心下手。房玄齡、長孫無忌和杜如晦他們認為，現在隻有果斷地先發製人，才能轉危為安。既然李世民下不了手，這事也一定要做，於是他們三人密謀策劃。後來，這事泄漏了出去，幸好沒有被人抓到把柄，但是房玄齡、杜如晦被逐出了秦府。房玄齡、杜如晦被逐更顯示出了事情的緊迫性，長孫無忌就和舅父高士廉以及秦府將領侯君集、尉遲敬德等日夜進行策劃，勸世民早做決定，掌握主動。
太子李建成的實力日漸增長，朝廷官員也偏向於太子一邊，再加上李元吉因私心與太子結盟，李世民處境越來越危險。為了轉敗為勝，李世民必須反戈一擊。