如此巨大豪華的柱礎甚至讓人懷疑其是否真正使用過。為了配合這種超級柱礎，是否能找到如此粗壯的木材作為大柱？蟠龍柱礎並沒有遺留在三大殿的遺址上，而是集中的被埋在皇城西北的土地裏。是當年因為沒有合適的木柱而被廢棄？還是大殿被拆毀後，蟠龍柱礎被轉移到此處？這些疑問隻能等將來大規模的考古發掘後才有可能有答案。
鳳陽，這座以農村改革的先驅形象而出名的縣城，其作為明中都的曆史價值卻長期被世人忽視。確實，明中都已經被埋沒的太久太久。由於長期無人管理，很多城磚和石構件已被當地的農家拿去蓋房子、砌豬圈了，遺址上的文物毀壞流失量相當大。城牆內外的片片農田之下，還不知有多少被埋沒的皇城秘密。如今，你如果去問那些在中都宮殿遺址上幹活的老農，他們還是會如數家珍般地和你講朱元璋和中都城的傳說故事，熱情地領你去看那不太好找的蟠龍柱礎。顯然，鳳陽人依然以是朱元璋的同鄉而自豪，節慶時，民間的鳳陽花鼓戲仍然唱著。
南京故宮建造之謎
當中都城因勞民費財而無法進行下去，朱元璋終於決定罷建中都宮殿。盡管中都計劃可以說以失敗告終，但朱元璋的修城熱情並沒有絲毫減弱，而是將熱情轉移到了京師——南京來了。
朱元璋登吳王位時就已經開始了南京的城市建設，營建中都嚴重影響了南京城的建設進度。而此時，朱元璋住的吳王新宮，僅有三殿兩門，城牆兩重，與中都那樣三朝五門、前朝後廷、三重城牆的完整形製相比，吳王新宮已顯得小家子氣了，對於大明帝國的首都來說已極不相襯，所以都城南京的建設已經成了當務之急，朱皇帝要建一個和中都一樣規模的宮殿來撐起帝都威儀！
就這樣，中都罷建僅半年，朱元璋就下命令大力修建南京城與南京宮殿，統治者新一輪的大勞作又開始了！由於有著中都宮殿的失敗經驗，朱元璋拉下麵子，承認中都宮殿過於勞費，他要求在修建南京宮殿應該：“但求安固，不事華麗，凡雕飾奇巧，一切不用，唯樸素堅壯，可傳永久。”事實上，以封建統治者的標準，他的確做到了。
經過十七年不停地修建、複建、改建。洪武二十五年（1392年），完整的南京城及宮殿終於完成了。朱元璋一手營建的南京城垣為四重，分別是外郭（土城）、都城（城牆）、皇城（保護皇宮的外圍城牆）、宮城（皇宮的城牆），如此嚴密的設計，真可謂是大明帝國的完美之都。建成後的南京宮殿果然是簡樸牢固，但那隻是沒有像中都宮殿那樣過於豪華奢侈而已，從建築上來看，南京宮殿依然是殿宇重重，雕梁畫棟，千門萬戶，金碧輝煌，氣勢恢弘，蔚為壯觀，隻是一些細節的裝飾上比中都宮殿簡樸了許多。
作為都城，南京宮殿規格顯然要高於中都宮殿。南京宮殿基本沿用了中都宮殿的設計，由皇城與宮城兩部分組成，合稱皇宮。
在宮殿形製上，朱元璋力圖恢複漢族文化傳統的政治主張，集中表現為遵循禮製，以周朝禮製為依據，打造了中軸線上三朝五門、後立六宮的基本格局。皇城在外，圍護著宮城。皇城開有六道門：正南為洪武門，正對著都城正陽門（今光華門）；東南為長安左門，外為長安街；西南為長安右門，東為東安門，西為西安門；北為玄武門。
宮城俗稱“紫禁城”，開有六道門：正南是午門，東南為左掖門，西南為右掖門，東為東華門，西為西華門，正北是北安門。在皇城與宮城之間還有兩道門，南為承天門，北為端門，與洪武門、午門處在同一條中軸線上。宮城中由南向北依次建有宏偉的奉天、華蓋和謹身三大殿。三大殿的東側有文華殿，西側有武英殿，統稱為“前朝”五殿。後來北京故宮的太和、中和、保和三殿，就是模仿奉天、華蓋、謹身三殿建造的。
奉天殿，是三大殿的主體，俗稱金鑾殿，上蓋琉璃金瓦，雙簷重脊，雕梁畫棟，朱漆描金雕花的門窗，它是朱元璋舉行重大典禮和接受文武百官朝賀的地方。在朱元璋時代，不僅有早朝，還有午朝和晚朝，規定各府部有一百八十五種事件必須麵奏皇帝。奉天殿旁左廡是文樓，右廡是武樓。
奉天殿的後麵的華蓋殿，四麵出簷，滲金圓頂，殿頂上還綴有一顆碩大的金球。在這裏，朱元璋要先行接受內閣大臣和宮廷執事人員的參拜，然後才去奉天殿接受百官的朝賀。華蓋殿後就是謹身殿，規模僅次於奉天殿，也是一座雙重飛簷的大殿，是皇帝上朝前更衣的地方。
三大殿之後，是皇帝與後妃生活起居的地方，名叫“後廷”。後宮南麵正中為乾清門，乾清門內為乾清宮大殿。處在中軸線位置上宮殿左邊有日精門，右邊有月華門，殿的東西有斜廊，廊後左邊有東暖閣，右邊有西暖閣。乾清宮後麵是省躬殿，製式如同華蓋殿，略小。省躬殿後為坤寧宮，是皇後居住的地方。坤寧宮的東、西兩側，建有柔儀殿和春和殿兩座別殿。在春和殿西側還有禦花園。“前朝”與“後廷”相結合，組成“朝廷”。