於是，根據孝莊太後的建議，順治十五年二月，順治帝特旨加封孫可望為義王。五月初二，孫可望來到北京。孝莊太後請順治帝給其安排了隆重的歡迎儀式。10天之內，皇帝賜宴就達3次，賜銀兩共12000兩，孝莊太後也特地召見了孫可望的女眷，另外賜給如意冠、珊瑚朝珠、翡翠白玉式佩、赤金鏨鐲等一大堆女子使用的奇巧裝飾品。孫可望成為清宮廷中熱議的風頭人物。
孫可望曾經是雲貴軍事集團的政治決策者，他掌握著這個集團大量的核心政治軍事機密，熟悉這個政府的一切運作程序。後來，孫可望會同洪承疇以及各
提督、總兵進行圖上作業，使清軍各級將領對於雲貴軍事集團的大致軍事走向了然於胸。因此，孫可望的叛變，對於雲貴割據政權的打擊是致命的。
於是，順治十四年十二月十五，孝莊太後與順治帝抓住這個難得的戰機，下達了三路進軍西南的總攻命令：
任命吳三桂為平西大將軍，與固山額真墨勒根侍衛李國翰合兵由四川直插貴州。命令固山額真趙布泰為征南將軍，與廣西提督線國安合兵後，從北麵進取貴州。湖南中路則由寧南靖寇大將軍固山額真宗室羅讬、固山額真濟席哈、洪承疇三人共同負責，由辰州、武岡一線向貴州大規模反撲。
清軍三路進軍時，李定國正在貴州永昌等地，平息孫可望舊部王自奇、關有才、張明誌等人的叛亂活動。等到李定國得知清軍動手的消息之時，三路清軍已於順治十五年（1658年）七月直入貴陽。
九月，為了理順雲貴前線的指揮責權，孝莊太後建議任命豫親王多鐸之子信郡王多尼為安遠靖寇大將軍，換回固山額真羅讬。信郡王多尼偕多羅平郡王羅可鐸，貝勒尚善、杜蘭，固山額真伊爾德、阿爾津，固山額真卓羅等顯貴戰將，與增援滿洲精銳抵達貴州平越衛楊老堡。
於是會議議定：全軍仍分三路進取雲南。多尼中路自貴陽取道關嶺、鐵索橋至雲南。西路吳三桂（此時李國翰已病死），自遵義取七星關入雲南。南路趙布泰自都勻發兵，繞出安隆所，直插昆明。三路大軍，每路約5萬人，全軍合計15萬人左右。洪承疇、羅讬駐守貴陽，辦理軍需轉運等事宜。李定國這一段時間戰績很差。至十二月十三，三路清軍對昆明已經形成合圍之勢。
在這種情勢之下，昆明城已不可守。於是，沐天波提出：退守沐家的老根據地滇西永昌一帶。那裏沐家的群眾基礎不錯，地方荒遠無際，清兵追到那裏肯定要出現高原反應。再說了，萬一清兵追得緊，我們還可以以大明皇帝的身份，到緬甸搞一個出國遊。清兵搞不來護照肯定傻眼。朱由榔這一輩子做人，在南方各偏遠地區奔波鼠竄，他還真沒有出過國呢。於是，一種想出國的願望，強烈地主宰了朱由榔的意識。
滇西之行遂從定議。
如此，順治十六年（1959年）正月初三，信郡王多尼、征南將軍趙布泰、平西王吳三桂三路清兵不戰進入昆明省城。
作為李定國個人而言，他是絕對不喜歡沐天波提出的撤入“瘴氣晝熏體，菵露夜沾衣”之緬甸國的計劃。不過，李定國仍然願意留下來殿後，掩護朱由榔逃跑。
於是，在雲貴軍事集團即將落幕之時，李定國又在夕陽無限好的磨盤山，跟追蹤的清軍大隊打出了一場明亮驚豔的硬戰！
磨盤山在永昌境內。起先李定國是預備在那一帶打一個伏擊戰的。大家都知道李定國的伏擊堪稱古代戰爭史上的一絕。大清的名將之花尼堪便死於他的連環伏擊刀法之下。這一次，李定國仍然安排手下悍將竇名望、高文貴、王國璽三人，給清軍準備了一道連環三伏的精美大餐。二月二十一，立功心切的吳三桂、趙布泰二人合軍進入了李定國的伏擊圈。但是，這時，李定國身邊有一個叫盧桂生的人臨時投敵，泄露了李定國的計劃。吳三桂緊急喝令全軍迅速後退，並用大炮轟擊山上伏兵。事已至此，李定國自然不能待在山上等死，便全軍冒著密集的炮火拚死往下衝！這一戰，吳三桂勝在人多、炮火的火力猛。李定國則倚仗有利地形與死裏求生的士氣。雙方的損失均很慘重。清軍方麵損失的有固山額真沙裏布、梅勒章京多波羅（征南將軍趙布泰侄子）、阿達哈哈番琿津、漢軍固山額真祖澤潤（祖大壽長子）等18位都統以及輔國公幹圖、鎮國公紮喀納二人。李定國的3 員先鋒大將陣亡了竇名望、王國璽兩位。清軍無力再追。李定國精銳盡失，隨後再也無力發動有威脅的戰役了。