商鞅卻夠狠，比如有一次在渭水河畔，他一次就殺掉了七百多個破壞變法的舊貴族，這其中真正有破壞變法行為的隻是少數，大部分人都是被株連的親族，甚至還有鄰居，整個渭水清澈的水麵，刹那間被滾滾鮮血染紅。連秦孝公的兒子，商鞅也絕不姑息。當時太子的兩個老師鼓動太子反對變法，誹謗商鞅，商鞅得知後，做主把兩個老師處以酷刑，一個割鼻子，一個臉上刺字，如此一來，整個秦國都嚇得打哆嗦了。他連太子的麵子都不給，自然誰的麵子也不會給了。沒辦法，老老實實跟著他混吧。
如日中天的商君
商鞅第一階段的變法持續了七年，到了公元前352年，變法的成果已經非常顯著，秦國上下出現了倉儲豐厚的景象，老百姓生產積極性大為提高，甚至出現了披星戴月勞動的情景。
在國家稅收方麵，大量自耕農的出現，使政府的收入大為增加，國庫財大氣粗，舊貴族勢力遭到了殘酷鎮壓，一時很難對變法形成威脅。變法帶來的巨大實惠，也已經在秦國上下深入人心。
內政順利的時候，秦國軍隊的力量也得到了大幅度提升。獎勵軍功製度的出台，使原本彪悍尚武的秦國人，作戰的積極性更加高漲，打仗不用動員。從商鞅變法的第三年開始，秦國就陸續地在河西地區發動攻勢，多次擊敗魏軍，原先秦國對魏國戰爭一邊倒的慘敗局麵，這時候開始攻守易行。
原本對秦國采取攻勢的魏國，也不得不改變政策，對強大起來的秦國以防守為主，轉而把注意力轉向東邊的中原諸侯國。對於正在上升期的秦國來說，這一事件尤其重要，它使得正在蛻變的秦國，少了一個強大的對手，獲得了充足的成長空間，秦國收複西河失地，東進中原，似乎隻是時間問題了。
商鞅變法的第二階段，從這時期開始。公元前305年，商鞅再次頒布了變法令，因為變法的卓越成果，此時的商鞅已經成為手握秦國大權的大良造。在秦國國內，這是一人之下萬人之上的角色，原本明槍暗箭的反對派們，現在已經無人敢掣肘。
商鞅第二階段變法的內容，主要包括四個方麵：一是廢除井田，開阡陌，這就徹底斷絕了奴隸主貴族的經濟命脈，打破了奴隸主貴族對莊田的壟斷，勤力墾荒的自耕農們，隻要足夠勤勞，就可以把原來奴隸主貴族的土地劃到自己名下，國家法律會為他們提供絕對的保護。二是正式確立秦國的地方行政體係，即郡縣製度，全國劃分成41個縣，縣的長官縣令，由中央直接任免，這樣對地方的控製權，也牢牢地抓在了國君的手裏，原本畫地為牢的舊貴族們，從此徹底成了死老虎。三是統一度量衡，整合國民經濟，建立國家對商業貿易的絕對管理權。度量衡的統一，使國家有了統一的稅收標準，商業稅的征收也更加製度化。四是編訂《秦律》，這是繼《法經》之後，中國又一部封建社會法律，《秦律》參考《法經》製定，內容比《法經》更細致，涉及經濟、政治、軍事的各個方麵，目的是建立一個嚴格的官員督察體係，六國後來所羨慕的秦國官員之嚴謹、認真、高效，正是由此而形成的。
在這四項改革內容中，也包含著一個重要的目的，第一階段的改革，是樹立新法的影響力，建立新法的絕對權威；第二階段，是要把新法的內容製度化，成為秦帝國牢不可動的國體，深深滲透進秦帝國的血液中去。即使商鞅會有粉身碎骨的一天，但是商鞅的變法，也成為秦帝國從此不可分割的一部分。
這時候的秦帝國，還享受著商鞅變法的成果，國民經濟效率大大提升，在不增加賦稅的情況下，政府擴大了稅源，增加了稅收，國庫儲備充裕，足夠支持大型的戰爭。秦國的軍事實力也在逐步增強，這時期的秦國，已經遷都鹹陽，定下了東進中原的國策，秦國的理想，也比中原諸國更加遠大，他們不再謀求建立一個屬於自己的霸主地位，他們的理想是把整個天下統一在自己的囊中。這是秦國國君的願望，他們太盼望君臨天下的輝煌了。這也是商鞅的願望，他期待自己一生的嘔心瀝血，能成為中國未來的典章製度。
這期間的秦國，東進的腳步已經不可遏製。在秦國遷都之前，秦軍已經陸續收複了安邑、元裏等西河失地，稱霸中原的魏軍，被打得節節敗退。到了公元前343年，秦國已經成為諸侯眼中不能小覷的力量，連掛名的周天子都來向秦孝公朝賀，授予他霸主的身份。公元前340年，商鞅親自率軍擊敗魏國10萬大軍，俘虜魏國公子，魏國無奈之下，隻得向秦國歸還了所有的西河領土，幾十年的國恥，就此一朝得雪。
然而，僅僅是洗雪恥辱，在秦孝公君臣眼裏是遠遠不夠的。收複失地不夠，獲得霸主的身份也不夠，最重要的是要平定中原六國，一統天下。商鞅變法第二階段的12年，正是秦國勃興時期的關鍵12年。在這12年裏，秦國和齊國兩麵夾攻，使魏國實力徹底萎靡，秦國打通東進道路的願望從此徹底實現了。此後，彪悍的秦人第一次跨出了函穀關。雪亮的馬刀，直指向富饒的中原大地，關東六國的災難，中國的統一大業，腳步日益近了。