嘉靖皇帝聽了，如雷擊一般，口吐鮮血，倒在地上。他想起自己從十三歲起，嚴嵩就把他跟自己係在一起，幾十年來風雨同舟，自己對他還是比較了解的。在當時社會上，他一個達官顯貴連小妾都不納一房，一個不近女色的男人，能是巨貪嗎？想到這裏，嘉靖皇帝似乎反應到什麼，他令人將徐階找到病榻前，問：“查抄嚴府贓物甚多，據戶部上奏，入庫卻隻有十萬兩銀子，還有那麼多到哪裏去了？”
徐階說：“剩餘的直接充了邊餉。”
嘉靖皇帝正色質問：“邊餉由戶部撥出，贓物不入庫而直接撥出，是何道理？”按照正常的程序，一切贓物都應入庫，全國所有費用均由戶部統一撥出，徐階不將贓物入庫而直接撥出，他在搞什麼鬼？
徐階額頭冒汗了，支支吾吾：“這個……微臣也不知道是什麼道理，等查明了再稟皇上。”
嘉靖皇帝已經預感到自己冤枉了嚴嵩，非常痛心。姑且不說嚴嵩平時家裏應該有點積蓄，就說他僅僅以首輔的資格退休，光朝廷賞銀就是二十萬兩，在他府裏搜出十萬兩銀子，這意外嗎？
嘉靖皇帝沒有等到徐階向他彙報這是為什麼，因為從這天起，他忽然病得時昏時醒神誌不清。十天後，即嘉靖四十五年（1566）十二月十四日，一代雄主嘉靖皇帝，在自己的寢宮——乾清宮崩逝了。諡欽天履道英毅聖神宣文廣武洪仁大孝肅皇帝，廟號世宗。而查抄嚴府巨大的財產除十萬兩銀子進了國庫外，其他的均不知所蹤，也把一個巨大的疑問留給了後人。
《明史·趙錦傳》全文記錄了一個趙錦為嚴嵩翻案的奏折，這個奏折回答了上麵的問題：“方聖祖肅皇帝時，故大學士嚴嵩特受眷知音參機務，每不能仰體聖祖所倚毗之心，而專怙寵行私。其子世蕃，複大為奸利。於是中外切齒，言者四起。而聖祖方旋悟疚逐，命收捕世蕃。而言者猶忿恨不已，至謂世蕃有謀叛狀。於是正世蕃之罪而籍其家。時承勘者與撫按諸臣，懼無以上應明詔，重幹不測，則虛上所當籍事，而其實不符，則又株連影捕，旁收近取以足之。聖祖以為所籍之物，而不知其強半出於無辜之民、閭閻之間。”還記錄了當時交銀入庫的人的回答：“初抄沒世蕃，命下倉促，所得猶僅若此。”
趙錦的這個奏折是什麼意思呢？大意是：嚴嵩受嘉靖皇帝知遇之恩，不體諒嘉靖皇帝對他的希望，卻倚仗嘉靖皇帝對他的信任，公報私仇，中飽私囊。他的兒子嚴世蕃，更是大奸大貪。因此，朝野內外無不切齒痛恨，參劾者接連不斷。最後嘉靖皇帝下旨將嚴世蕃抓捕治罪，參劾他的人又說他有謀反罪，又說他是巨貪。結果抄家的人一查抄，情況根本沒有那麼嚴重，為了掩蓋自己的奏折是欺騙嘉靖皇帝的謊言，他們就大搞株連，把凡是跟嚴世蕃有關的人都抄家，這還不夠，又把用其他辦法搜集、所得財物均算在嚴世蕃的贓物上。嘉靖皇帝以為這些東西都是從嚴府抄出來的，卻不知這些東西一大半是從那些無辜的人家、店鋪、作坊等地方收來的。就是這樣拚命地湊集，也遠遠達不到清單上麵的數額。當徐階的人僅僅隻交了十萬兩銀子入庫時，戶部官員問，怎麼隻有這麼少？交銀子的人回答說查抄的命令下得倉促，我們隻抄到了這麼多。這句話包含了兩層意思，一是嚴府隻有這麼多，二是他們轉移了，我們還在繼續查。清單上那麼大的數額，查抄的人卻說僅僅查到了十萬兩，這是多麼大的差距呀，徐階不說是直接撥發了邊餉，他到天上找那麼多的東西來補這個缺口啊！為了置嚴嵩於死地，徐階可算是赤膊上陣了。
嘉靖皇帝是不是死於謀殺，沒有任何史料能夠證明，唯有一件事值得推敲：幾年後徐階被高拱推倒回家，大量兼並土地險些激起民變。海瑞受朱載垕的密旨，要就地斬殺徐階，嚇得徐階連夜亡命他鄉。一個退休在家的宰相，他就是犯了滔天大罪也不能不問不審就像殺一隻雞一樣隨便殺了呀！朱載垕這麼做是不是有殺徐階滅口之嫌？其後不久，徐階不但脫罪，反而還讓海瑞罷了官，他又有什麼回天之術，竟然這樣反敗為勝？隻有一種解釋，朱載垕有把柄在他手裏：你要殺我也行，我就把你的醜事抖落出去！那麼是什麼醜事竟能要挾一個皇帝呢？這個答案應該不難想象，除了殺弟弑父，絕對沒有第二個原因。
徐階深知，自己比嚴嵩小了二十三歲，以年齡優勢擊敗了嚴嵩，這種勝利是短暫的，也許用不了幾年，自己就會跟嚴嵩顛倒一下位置。隻有將嚴嵩批倒批臭，永世不得翻身才行。嚴嵩成了奸臣，作為推倒他的人，自己理所當然就成了忠臣，對於忠臣，誰敢對自己把事做絕呢！