於是將應天的兵署暫時改為行宮，定應天做了帝都，分內外皇城。又著內務府發出國努，大興土木，建築宮殿。洪武元年的八月，宮殿落成。因為朱元璋初踐大位，萬事都從儉樸。那宮殿建設隻求雅觀，不事富麗。但雖不見得畫棟雕梁，卻也金碧輝煌。這皇宮的正殿，叫作奉天殿，是皇帝臨朝的地方。奉天殿的後麵，是華蓋殿，最後是謹身殿，為皇帝召見大臣的所在。兩邊是一帶的長廊，直達奉天殿，左為文樓，右名武樓。過此便是宮門，正門叫作乾清門，進了乾清門就是坤寧宮，為皇後所居。兩邊分建著六宮，一仁壽、二景福、三仁和、四萬春、五長春、六永壽、六宮之後，左右華屋六楹，列兩殿即涼殿、暖殿，過涼、暖兩殿是玄武殿，殿後是寧安門，出寧安門是禦花園，中建金水橋、太華池、飄香亭、安樂亭、魚亭、香草亭、鹿亭、鶴亭。又奉天殿的門外，也建著兩殿，左麵的叫文華，是將來皇太子禦臨的所在。右邊名武英，是皇帝齋戒的地方。兩旁門兩重左名左順，右名右順。
從這裏出去是正門一所，就是午門了。午門外是皇城，又建端門、長安門、承天門、慶瑞門諸門。內外宮殿，凡屋宇一千六百三十八楹。
宮殿既造就，由太史官劉伯溫選擇了一個吉期，明太祖朱元璋登奉天殿正式受百官朝賀，又大封功臣。晉徐達魏國公右皿相，李善長輔義侯左丞相，常遇春鄭國公大將軍，鄧愈衛侯左將軍，湯和信侯右將軍，胡大海靖安侯，花雲崇海侯，郭英平涼侯，耿再成東平侯，沐英穎川侯，昊貞、鄭遇春、華雲龍、郭興、呂懷玉、方剛、吳良、俞通海、廖永安，均封將軍晉伯爵。陳野先、張興祖、薛顯、吳複、金朝興、仇成、王弼，葉升等一班降將，都晉為男爵加將軍銜。又封死難的將士，若俞通淵、廖永忠都追贈侯爵。晉劉伯溫為國師太史公安國公。李文忠、耿炳文也封了伯爵。
又追溢高祖為德祖玄皇帝、高祖姚玄聖太皇後。曾祖為懿祖桓皇帝、曾祖妣懿聖皇太後。祖考為熙裕皇帝、祖姚裕聖皇太後。父朱世珍為仁祖淳孝皇帝，母溫聖睿慈太後。封妻馬秀英為皇後，姬櫻桃為寧妃，閣氏為瑜妃，翠娥為惠妃。當時命瑜妃居了萬春宮，惠妃居了仁和宮。一麵下旨，令沐英持了金節，備皇後的鳳葷，全副儀衛去迎那馬皇後。令方剛持族，備皇妃半副儀衛，去迎寧妃。
沐英、方剛領了諭旨帶同儀衛，即日出京到滁州來迎皇後和寧妃。不日到了滁州，耿再成、吳良忙出城迎接，後邊跟著地方官，遠遠地跪迎。沐英和方剛進了城，便去晉渴馬皇後和那寧妃，外麵耿再成、吳良及地方官等在那裏照料，還幫著整儀衛，打掃街道，沿路上懸著彩燈，蓋起彩棚，凡鳳輩經過的所在，地上都鋪著黃沙。滁州城中的百姓，聽得迎接皇後這個消息，便家家門前排起香案來，準備跪著送鳳駕。
這裏沐英、方剛在滁州兵署請皇後、寧妃各登了鳳肇，擺起全副儀仗，直出東璧門。馬皇後傳諭，把鳳輿和朱幕打起，以便百姓們的瞻艦。一時沿途的歡聲，好似雷鳴般的，直是萬戶頌揚哩。明太祖朱元璋在金陵聞得皇後的鳳輩將到，因坤寧和六宮的宮已征得三百多人，宮女卻寥寥幾十人，當然不夠分配，於是下諭，就應天府治下和江寧、句容、高淳、江浦、六合、傈水、漂陽、上元等八縣中挑選秀女。
這條旨意一出，八縣的地方官果然忙得走投無路，便是那班百姓，也大家奔走號呼起來。這時給李善長、劉伯溫得知了，忙上章來諫阻。元璋讀了奏疏，勃然大怒道：“身為天子，難道選幾個秀女也不能嗎？”便不聽善長、伯溫的話，竟傳諭趕緊實行。又令葉衷做了選秀女的總監。當時選得秀女三千七百六十六人，經地方官‘度的挑選，選得二千一百十六人。又被選官挑擇過，凡錄用一千五百四十四人。就把這一千五百四十四個秀女送到了應天，又由葉衷選過，隻選得七百二十五人。葉衷即奏知元璋，元璋卻坐起了謹身殿親自選錄，好中取好，共選中秀女二百三十三人。那餘下選不中的秀女，仍命送還給民家。元璋便把這二百三十三個秀女分派在各宮去侍候後妃。
過不上幾天，馬皇後和寧妃的鳳輩到了應天，元璋親自率領文武百官出城去迎接。這是元璋自己知道出身寒微，恐內外臣工瞧不起皇後，所以他禦駕去親迎，也是尊重馬後的意思。馬後的儀衛到了離城十裏，和皇帝的儀仗接著，文武百官一列俯伏地道上，齊聲三呼著娘娘千歲。那伴駕官喝聲起丟，文武官員就紛紛起立，武官騎馬，文官步行，列隊在前麵引道。最前是皇帝的儀仗和皇帝坐的變駕。隨後便是馬皇後的儀衛，排列著一對對地過去。前導黃I兩對，大戟一對，五色繡蟠三對，長戈一對，繡蟠三對，錦蟠三對，難尾扇兩對，紅花團扇兩對，曲蓋兩對，紫方傘兩對，由紅衣的甲士們執著，共是四十二人。後頭是校尉六十四人。列在左右兩邊是班劍、金吾杖、立瓜、臥瓜、橙杖、骨朵、儀刀、錢斧每件共是兩對。又金響節十二，錦花蓋四，十六個校尉分作兩隊，還有十六個校尉戴著大邊的珠涼帽，紅衣、黃綢腰帶、碧油靴，控著駿馬，執著豹尾槍徐徐地前進。後麵又是宮女二十四人，手裏各個捧著金交椅一座，金踏腳一個，金水盆一個，金水罐一個，金唾壺一個，金唾盂一個，金香盒一個，金脂盒一個，也列隊過去。以後是武裝的宮女，一個個短衣窄袖，各執著五色繡蟠、金斧、金骨朵、拂子、方扇、紅杖、紗燈、黃花蓋、曲蓋、金節、青傘之類，共是二十四人。最後宮女十二人，提著明紗燈三對，在鳳輩左右，後麵便是文武百官，武官騎馬列隊在前，文官卻步行著在後。文武官的後頭，即是馬後的鳳葷。鳳輩之後，隨著寧妃的儀衛，也列著引蟠、清道旗、方傘、金吾杖、立瓜、臥瓜、紅紗燈之類算是半副儀仗。後麵便是寧妃的鳳輩，最後是護衛鳳輩的校尉六十四人，武官長兩人，率領著兵士六百名，個個是鮮衣美服，刀槍如霜地隨後護送。