內戰爆發後的第二年，擔任整編第168旅少將旅長的馬光宗參與了攻占陝西三邊的軍事行動，以配合胡宗南對延安的攻勢。但沒過多久馬光宗就被馬鴻逵調回寧夏，擔負起他的老巢——銀川的城防任務了。時間一轉眼到了1949年5月，馬鴻逵提拔了他的兒子馬敦靜當了寧夏兵團司令官，這空出來的第11軍軍長的位子，就交給了馬光宗。半年後，麵對大勢已去的西北戰局，馬鴻逵帶著他的家當逃離了銀川，把馬光宗等將領以及部隊拋棄了。
此時的馬光宗又在想些什麼呢？從他在後來的行動中不難看出，馬光宗並不打算執行馬鴻逵死戰到底的命令，也不想成為盤踞寧夏數十年的馬家王朝的殉葬品。就在馬敦靜繼他老子之後也逃離了銀川的時候，馬光宗立即和第128軍軍長盧忠良、賀蘭軍軍長馬全良取得了聯係，三人一合計，決定響應彭德懷要求他們起義的號召。於是在9月25日，馬光宗在銀川飯店召集了11軍團長以上軍官講話，並命令所屬部隊原地不動，靜候解放軍前來接管。散會之後，馬光宗對於那位跟隨了幾十年並有提攜之恩的馬鴻逵懷著一絲愧意，他說了一句話：“將來怎麼對得起總司令啊？”由此可見，馬光宗雖然順應實勢地歸順了解放軍，但對老長官，馬鴻逵的感情還是很深厚的。
事情的進展並沒有如馬光宗想象的那般順利。就在馬光宗宣布命令後不久，部分部隊在特務的鼓動下鬧起了兵變，這就使得銀川城內陷入了混亂，因為在三天前，銀川已經遭到了前線潰兵的襲擾，此時城內秩序還沒有全部恢複，11軍的這次兵變加劇了城內的混亂狀態，11軍也就在一陣混亂之後煙消雲散了。
沒了部隊的馬光宗隻身一人前往解放軍軍管會報道，以證明他的起義之心是真誠的。解放軍對於馬光宗，仍執行優待政策予以善待。在西北軍政大學高級研究班結業之後，馬光宗被派為西北軍區參議室當參議，1953年轉業後分配到甘肅省政府工作。此後他先後擔任甘肅省人大代表、全國人大代表、甘肅省政協常委、民革中央委員、監察委員、民革甘肅省常委、秘書長、副主委等職。於1987年8月28日在蘭州去世。
(本章完)