擁眾據城邑，保村落，駐山穀，拒險寨者不可勝數。
凡獻忠所選府、州、縣官，有到任兩三日即被殺害，甚至有一縣三四月內連殺十餘縣官者。雖重兵威之，亦不能止也。
清人彭遵泗著《蜀碧》更載：
蜀民共起，殺偽守牧令判等官。賊所破郡縣置守牧令判等官，緝捕百姓。時四方兵大起，民之荼毒未盡者，斬木揭竿，糾集殺賊。一時偽官或刺於庭，或生畀之火，或投之於水，幾於殆盡。
在南充，原舉人鄒簡臣，潛與順慶豪傑倡義，建“中興”赤幟於江滸，數日眾至十餘萬，軍聲大振。賊卷甲遁，恢複順慶十餘城。渠縣進士李含乙，永川刁、古二族，順慶譙、馮二姓，潼川楊先誌、林時泰，詹州陳鐵腳，嶽池劉武舉俱起義兵。
川西原明朝軍官朱化龍“斂兵自守”，也割據一方。黎州土司十六歲的馬京起兵反抗，“得兵萬餘，恢複雅黎”。在張獻忠實際控製區內的百姓也紛紛起義，起義兵斬偽令者，所在皆是。後來竟弄到這樣的地步，成都百裏外，櫌鋤白梃，皆與賊為難。
越來越多的人踴躍參加官軍。《蜀警錄》載：“曾英至重慶，駐兵江上。招集難民入伍，舳艫百裏，旌旗蔽江。”明軍勢力迅速壯大起來。
兩個傳教士的回憶
張獻忠始則有條不紊，繼而手忙腳亂，終於驚恐絕望。
十多年提著頭沐風櫛雨，身先士卒，雖然艱苦，卻也快意。勝也勝得痛快，敗也敗得幹脆。如今住進了皇宮，開辟了帝業，卻陷入了無邊無際的焦慮煩惱之中。
作為一個職業軍人，他還沒有學會治理帝國這個需要同時處理多種事情的彈鋼琴藝術。日理萬機，千頭萬緒，百爪撓心，心中如焚，壓力從四麵八方朝張獻忠一個人壓來，幾乎要把他壓得粉碎。從各個方麵傳來的消息，都是警報和敗績。按了葫蘆起了瓢，好不容易鎮壓下一處，更多的火苗又在周圍燃起。
最初的新鮮勁過去了，現在他越來越懶得上朝，脾氣也越來越大。有一天上朝，忽然把自己頭上戴的那頂鑲滿了寶石的金冠摘下來，扔到地上，用腳上去一頓亂踏，踩得稀爛。旁邊人看得麵麵相覷，誰也不敢上去勸。踩完了，把旁邊侍衛的大沿布帽奪過來，戴在頭上，大笑道：“他娘的，老子還是戴這個舒服。”
他越來越懷疑揮兵入川是個錯誤。初以為蜀人柔脆，容易征服。不想他們是柔而不脆，一時望風而倒，終久卻不屈服，正像《蜀碧》所評論的：
乃西川人性戇愚，特明順逆，不量勢力，不肯被不義之名，故其所置郡縣賊吏特以兵威迫脅，民勉聽從，兵才他適，則群起而殺之。
這個時候，張獻忠軍中擄獲了兩名在四川傳教的西方傳教士，分別是意大利的利類思和葡萄牙的安文思。他們分別於崇禎十年（公元1637年）和十三年（公元1640年）來華，崇禎十五年（公元1642年）進入四川傳教。他們被張獻忠留在身邊，相處一年多。逃出張軍後，其所見所聞載入《聖教入川記》一書，為後人留下了寶貴的曆史記載。
兩位傳教士回憶，隨著軍事上的失利，張獻忠的酒越喝越厲害，也越來越依賴看他人流血來尋找一點刺激。他們經常見張獻忠發脾氣，誰也不能勸止。
某日，張獻忠心情不好，“即殺軍官三員，宣其罪狀，謂伊等在席間高聲談論，絕無顧忌”；某日“又殺文官一員，謂其吸煙太多，精神疲憊”；“又殺太監七名，謂有多數軍官在朝私語，該太監等溺職不報，罪當斬決雲雲”。
無論是宮內男女還是大小官員，隻要稍不如意，即處以絞刑、斬首，或淩遲碎骨。神父們的好友、禮部尚書吳繼善，就是因奉命分配馬匹給各軍，請示張獻忠開列名單，以此細故而觸怒張獻忠，即受酷刑而死的。有位武官，素為張獻忠所寵，因為冬至節祀天，未遵張獻忠令讀條文，以致冒犯張獻忠，被鞭打至死。還有位官員，因諫張獻忠少殺無辜，而被重刑處死。
因為酒喝得太多，張獻忠精神也出現不正常的征兆。那一天，獨坐飲食，喝悶酒，忽然見到空中伸出千百隻人手來奪自己案上的食物。張獻忠嚇了一跳，抹抹眼睛，清醒一下，又什麼都沒有了。
舉杯消愁愁更愁，張獻忠的心情不斷墜向深穀，零星殺戮漸漸變成集體屠殺。他平生極為厭惡官場風習，甚至對自己任用的文官，他也抑製不住厭惡之情。有一次，部下大將孫可望遠征凱旋，張獻忠部下的文官們按明朝官場舊例，出城遠迎，進獻賀禮，遞“連名狀”。張獻忠聞知，“怒其沿故朝陋習，按名棒殺二百人”。有一次，因一點小小過錯，株連殺掉了自己屬下三百多名文官。有人勸他說都殺光了誰還為他服務，張獻忠說：“文官怕沒人做耶？”
人命在我，我命在天
如果鬥膽說一句張獻忠是殺人魔頭，也許並不過分。張獻忠本人正是以此自命並自詡的。