這且不說。在其離開杭州之際，武昌起義已經爆發，長江各省紛紛響應。他看到各地響應革命的多為新編陸軍，一到伊犁，即采取斷然措施：一麵轉移軍械彈藥庫，調動滿旗、綠營兵加強惠遠城防；一麵強行解散楊纘緒的混成協，迫令楊纘緒請假入關。而且，對遣散的官兵又遲遲不發放回家盤費，還勒令他們在遣散回家之前將所有皮衣皮褲全部交庫。時值隆冬天氣，逼迫新軍脫下皮衣皮褲，這無異於將他們逼上梁山，弄得怨聲載道，沸反盈天。誌銳倒行逆施的結果，迫使凍餒交加、走投無路的新軍官兵集體加入了同盟會。
針對這種形勢，革命黨人立即組織了領導武裝起義的指揮機關，推舉李輔黃為總指揮。定於1912年1月12日起義，後因謠言蜂起，又提前到1月7日。
1月7日，寒風呼嘯，夜幕剛剛淹沒軍營，由69名骨幹分子組成的鐵血團，在惠遠城南門外炮營秘密集會。鄧瑜的身體雖然剛剛複原，但一接到通知，就按捺不住滿腔興奮，精神抖擻地提前來到會場。
會場上空氣十分緊張。馮特民、李輔黃、郝可權扼要分析了一下形勢之後，就決定當晚十二時舉行起義。可是，正當大家瞪著一雙雙激動的眼睛，聽取具體戰鬥部署的時候，擔任警戒的同誌突然進來報告：有兩名錫伯族士兵，從水溝內逃走。
聽到這意外的消息，總指揮李輔黃鎮定自若地掏出懷表看了看，斬釘截鐵，當機立斷，發布了提前起義的命令：
“同誌們：先下手為強！李輔黃、李夢彪、鄧瑜負責攻打東門，並與南庫黃立中接應奪取彈藥，然後入城策應；馮特民、郝可權、馬淩霄負責攻打將軍署和北庫。馮大樹去秘密照會俄國領事館，讓其嚴守中立。現在，還有47分鍾，分頭行動。九時整，我鳴槍為號，舉行起義！”
鄧瑜聽到自己的任務，手提五響馬槍，帶了僅有的五粒子彈，立刻緊隨李輔黃，率部向惠遠城東關撲去。
此時，誌銳已得到這晚十二時革命黨人將舉行起義的秘密。一麵慌忙調動滿蒙各營入城守衛，一麵急令部下務必在十二時之前攻占楊纘緒的協統署。就在這千鈞一發之際，革命黨人終於搶先一步，發動了震撼中外的伊犁起義。
九時整，一聲清脆的槍響劃破了邊陲漆黑而死寂的夜空。李輔黃、鄧瑜一路，首先攻占了東關，打開了東門，奪得了南庫的槍支彈藥。接著，馮特民、郝可權一路也很快攻下了將軍署，並從隔壁的協領衙門大堂東夾道內，搜捕到了越牆而逃的誌銳。連戰皆捷，群情振奮，士氣十分旺盛。
但是，被新滿營盤踞的北庫，憑借新式武器的火力和武備學堂學生的支援，在正藍旗協領蒙庫泰的指揮下拚死頑抗，久攻不下。
李輔黃下令放開東門，給響應革命的各族人民發放了武器，也組織他們參加戰鬥。同時，派鄧瑜、李夢彪也去協同轉攻北庫。一場惡戰打得十分激烈，眼看東方就要透亮，仍然不分勝負。怎麼辦？如再拖長時間，駐綏定的綠營防軍必會前來增援，起義軍就有遭到內外夾擊的危險！
麵對緊迫形勢，革命黨人立即開會商量，決定利用廣福和誌銳的矛盾，由楊纘緒親自去邀請廣福出麵調停。由於廣福與蒙庫泰同為蒙古族人，素日關係親密，再加聽到誌銳已被活捉，大勢已去，經廣福勸告，新滿營即放下武器，交出了北庫。至此，伊犁起義宣告勝利。
1月8日上午，將誌銳拖到鍾樓前槍決之後，以廣福、楊纘緒的名義在商務會召開成立了一個“五族共和會”，組成了伊犁f臨時政府。廣福任都督，楊纘緒任總司令部部長，賀家棟（原伊犁知府）任參謀部部長，馮特民任外交部部長……李輔黃任前敵總指揮，徐國楨為東進支隊司令，建立了一個由革命黨、舊官僚、舊軍人三結合的奇特的革命政權。
伊犁臨時政府一成立，一麵電促新疆巡撫袁大化讚助共和，宣布獨立；一麵募集各族人民，編練軍隊，準備東進。袁大化十分驕橫，當即複電伊犁，要兵戎相見，派兵嚴守通往伊犁的要隘果子溝口，命令協統王佩蘭率部向伊犁殺來。