第一，這個馮保喜歡挑事兒。
確實如張居正所想，這時候小萬曆才登基不久，高拱和馮保之爭才鬧騰完，張居正剛接手一個內憂外患的爛攤子，政府上下，能不節外生枝就不要節外生枝。馮保你既然也想跟張居正合作來鞏固自己的地位，就不應該橫生事端。說起來放這個王大臣進了紫禁城，你馮保也是有責任的，你悄悄地把人給處理了不就得了嗎？還牽連出戚繼光來，這事不是要眼見著越鬧越大嗎？
第二，他並沒有很高的政治眼光。
你看他審出來的結果是什麼，說這個王大臣是戚繼光的人，那豈不是暗含了一種可能，就是是戚繼光派王大臣來刺殺皇上的嗎？戚繼光什麼人啊，他一是抗倭的英雄，二是鎮守北部邊防的大帥，三更關鍵，他是張居正最親密的心腹。你馮保牽扯出戚繼光來，天下人怎麼議論？北部邊防軍心怎麼穩固？張居正怎麼脫得了幹係？所以張居正一聽就急了，這是動到他的根本利益了。馮保既然跟張居正結盟，這都想不到，說明他的政治眼光實在不怎麼地。
第三，他也確實有實力攪動政局。
馮保這個司禮監掌印太監的位置實在是太重要了，他隻要想，他在這個位置上隨時都能折騰出些事兒來。而且往往不是什麼好事兒。所以這個王大臣事件經他手一折騰，事情馬上複雜起來了。
先是張居正專門去找馮保，親口保證這決不會跟戚繼光有任何關係。馮保隻是政治眼光不遠，但也不傻，他一聽就明白自己捅了個漏子。牽出戚繼光實在是沒必要的事兒，可能那個逃兵原來真是戚繼光的手下，但這個事件有刺殺皇上的可能，就不能亂說了。他連忙向張居正保證，這消息還沒放出來呢，審的結果也沒上報呢？一切他心裏明白，請張先生放心。
張居正聽了這話才算是放了心，囑咐他不要借這個事兒做文章，見他答應了，才放心地走了。
這邊張居正正在緊鑼密鼓地準備他的萬曆新政，那真是日理萬機，很快就把這事兒給忘了。哪知道才過了兩天，隻見遊七急匆匆地跑進來報告說：“老爺，大事不好。”
張居正聽得一愣，心想各項工作都在有條不紊地展開，哪一環又出錯了？他抬頭看著遊七說：“什麼事？休要驚慌。”
隻見遊七歎了口氣說：“唉，我剛聽徐爵說，馮公公把那個王大臣的案子給結案報上去了。”
張居正一聽是這事兒，鬆了口氣，心的話工作我做過了啊，肯定跟戚繼光沒關係。所以他很放心，說“噢，這事兒啊，怎麼大事不好了？”
遊七看張居正不著急，自己就更著急了，他說：“老爺您還不知道馮公公報的幕後主謀是誰吧？”
張居正一聽眉毛就豎起來了：“上次我都給他說好了，這事兒就是個偶然事件，沒有什麼幕後主謀啊！”
“就是這個問題啊，馮公公上報皇上說王大臣幕後的主謀是——”
“是誰，你說啊？”張居正心的話，總不能是我吧。
“是高閣老！”
張居正一聽這話，“啪”一拍桌子就站起來了。這真的是像遊七說的，事情麻煩了。
遊七為什麼說大事不好呢？因為高拱下台之後，很多人都認為是張居正和馮保一起陰謀陷害了高拱，張居正雖然抱著清者自清的態度，但畢竟還有不少人在背後悄悄地議論。現在馮保要借王大臣的案子趁機報複高拱，張居正作為現任的內閣首輔一定脫不了幹係啊，這下就更證明了他和馮保是陰謀勾結在一起來陷害高拱的。
這個冤案要是做成了，天下人怎麼看他張居正呢？朝廷上下又怎麼議論他張居正呢？他的改革計劃又該如何實施呢？
這其中的關鍵連遊七都看出來了，更不用說張居正了。
張居正立即吩咐備轎，他要去大內去參見皇上和李太後。到了乾清宮，經人通報，張居正進去一看，李太後正在那兒抹眼淚呢？一個勁兒地埋怨：“你個姓高的怎麼這麼狠心，先皇待你那麼好，可先皇一死就欺負我們孤兒寡母的，現在人走都走了，還不放過我們。”
小萬曆在旁邊扯著李太後的袖子勸媽媽，而馮保則一臉得意地站在旁邊。
張居正一看就明白了，馮保這挑撥離間的功夫是下夠了，看來他存心要借王大臣的案子整一場冤獄了。
張居正沒搭理馮保，他先向小萬曆和李太後參拜。李太後看張居正來了，立馬也不哭了，感覺有主心骨了嘛，所以她就問：“先生知道了吧，這高拱太欺負人了。先生看這事應該怎麼辦？”
萬曆和李太後都瞅著張居正，馮保也瞅著張居正，心的話，你說別牽連戚繼光，我就按你的意思辦了，現在你也總該按我的意思辦吧。
哪知道張居正正眼兒都沒看他一眼，向李太後說：“太後息怒，我聽說這個王大臣初供戚繼光主使，現在又供高拱主使，前言不搭後語，朝三暮四，所以所言恐怕不足為信。”
李太後一聽這話，轉頭就看馮保，問“有這事兒嗎？”
李太後多精明的人啊，馮保也不敢說沒有啊，所以隻好說：“確如張閣老所言。”
你看張居正多聰明，我們說戚繼光是他的人，他怎麼著也不能透露出這事兒跟戚繼光還有關聯啊，馮保死也想不到他會這麼說。但張居正突然這麼說，還就顯得這事兒他秉公判斷，不藏私心。況且這樣一說，就顯得王大臣現有的供詞是不足為信的了。
李太後看來是聽張居正的話的，她緊接著就問：“那依先生的意思，這背後到底是怎麼回事兒呢？”
張居正也不敢貿然說這事兒背後就沒有主謀，所以他很聰明的提出了一個公事公辦的辦法。他說現在這事兒已經引起朝廷內外的注意了，若不能查清真相，恐怕會造成惡劣的影響。所以最好由東廠和都察院、刑部、大理寺這些三法司一起會審。這樣審出來的結果就能服眾了，真相也能水落石出。
李太後當然聽張居正的話。馮保也沒多大的脾氣，因為張居正也讓他主管的東廠參加了主審，所以他當時也沒說什麼。心想，既然再審，我還是主審官啊，反正我一定會借這個機會把高拱給整死的。想想高拱氣勢洶洶要搞定他還不過就是幾個月前的事兒，他心裏這個恨就壓不下去。
苦心
從宮裏回來後，張居正趕快物色了兩個資格老、人又忠厚的王侯，打算讓他們和馮保以及三法司的官員一起審這個案子，這樣也好製衡馮保。可正忙著的時候，有兩個他最敬重的官員來拜訪他了。
誰呢？
一個是吏部尚書楊博，一個是都察院左都禦史葛守禮。
這兩個人一個六部的最高長官，一個是監察係統的最高長官，都是在高拱下台後幫張居正穩定政局的老臣。所以張居正對他倆是相當敬重的。
把這二位迎進來，廳堂落座之後。二人直奔主題就說上了王大臣的案子，原來馮保要借王大臣案整高拱的事兒已經滿城皆知了。兩個人開始拐彎抹角地說，後來索性直來直去的說，意思就是你張居正現在一人之下、萬人之上，得饒人處且饒人，不能幫馮保做這樣缺德的事兒。
張居正越聽臉越沉，《明史》上反複說他是“沉毅淵重”，那就是說他的性格是非常沉穩的，別人說話他一般都是很深沉地在那兒聽，輕易不打斷別人。現在聽這兩位老臣都誤解了自己，以為是他張居正和馮保合著夥要陷害高拱，更不要說滿朝文武是怎麼想的了。